PyTorch Geometric分布式训练技术解析与实践指南-CSDN博客

本文链接：https://blog.csdn.net/gitblog_00516/article/details/148362242

PyTorch Geometric分布式训练技术解析与实践指南

pytorch_geometric 项目地址: https://gitcode.com/gh_mirrors/pyt/pytorch_geometric

分布式图神经网络训练概述

在现代图神经网络(GNN)应用中，处理大规模图数据已成为常态。PyTorch Geometric项目提供的分布式训练解决方案，为处理超大规模图数据提供了高效的技术路径。该方案基于纯PyTorch和PyG构建，无需依赖其他分布式计算框架，保持了PyG生态的一致性。

核心架构设计

分布式并行机制

分布式数据并行(DDP)：用于模型参数的同步更新，确保各计算节点上的模型保持一致性
远程过程调用(RPC)：实现跨节点的采样和特征获取，解决图数据局部性问题

关键组件

DistNeighborSampler：智能采样器，支持：
- 本地CPU采样算法
- 跨节点特征提取
- 统一输出数据结构
DistLoader：分布式数据加载器，负责：
- RPC连接的安全管理
- 采样过程的生命周期控制
METIS Partitioner：基于METIS算法的图分区工具，实现：
- 均衡的图数据划分
- 最小化跨分区边数量

实践案例：OGB数据集节点分类

环境准备

软件要求：
- PyTorch Geometric 2.5.0+
- pyg-lib 0.4.0+
系统配置：
- 节点间SSH免密登录
- 统一的环境配置（推荐使用Docker容器）
- 开放TCP端口11111-11113

实施步骤详解

第一步：图数据分区

python partition_graph.py --dataset=ogbn-products --root_dir=./data --num_partitions=2

分区注意事项：

METIS分区具有非确定性，需确保所有节点访问相同分区数据
建议在共享存储或主节点生成后分发

分区目录结构：

data/partitions/ogbn-products/
├── ogbn-products-partitions/
│   ├── part_0/      # 分区0数据
│   ├── part_1/      # 分区1数据
│   ├── META.json    # 元数据
├── ogbn-products-label/
│   └── label.pt     # 标签数据

第二步：启动分布式训练

手动执行方式：

# 主节点(rank=0)
python node_ogb_cpu.py \
  --dataset=ogbn-products \
  --dataset_root_dir=./data/partitions/ogbn-products \
  --num_nodes=2 \
  --node_rank=0 \
  --master_addr=192.168.1.100

# 工作节点(rank=1)
python node_ogb_cpu.py \
  --dataset=ogbn-products \
  --dataset_root_dir=./data/partitions/ogbn-products \
  --num_nodes=2 \
  --node_rank=1 \
  --master_addr=192.168.1.100

网络接口配置技巧：

# 主节点
export TP_SOCKET_IFNAME=$(ip addr | grep "$MASTER_ADDR" | awk '{print $NF}')
export GLOO_SOCKET_IFNAME=$TP_SOCKET_IFNAME

# 工作节点
export TP_SOCKET_IFNAME=$(ip route get $MASTER_ADDR | grep -oP '(?<=dev )[^ ]+')
export GLOO_SOCKET_IFNAME=$TP_SOCKET_IFNAME

自动化脚本方案

launch.py方案：

python launch.py \
  --workspace /path/to/workspace \
  --num_nodes 2 \
  --dataset_root_dir /path/to/partitions \
  --dataset ogbn-products \
  --batch_size 1024 \
  --part_config /path/to/META.json