LVM-Med 项目安装与配置指南

LVM-Med 项目安装与配置指南

LVM-Med 项目地址: https://gitcode.com/gh_mirrors/lv/LVM-Med

1. 项目基础介绍

LVM-Med 是一个基于医学影像的大规模自监督视觉模型学习项目。它通过第二阶图匹配公式统一了当前的对比和无实例自监督学习（SSL），旨在推动医学影像分析领域的发展。该项目的主要编程语言是 Python。

2. 项目使用的关键技术和框架

项目使用的关键技术包括：

• 第二阶图匹配：一种统一对比和无实例自监督学习的方法。
• ResNet-50 和 ViT-B 架构：作为模型的基础结构。
• PyTorch：深度学习框架，用于模型的开发和训练。

项目依赖的主要框架和库包括：

• Python：基础的编程语言环境。
• PyTorch：深度学习框架。
• TorchVision：PyTorch 的视觉库。
• segmentation-models.pytorch：用于图像分割的 PyTorch 模型库。

3. 项目安装和配置准备工作

在开始安装之前，请确保您的计算机满足以下要求：

• Python 版本 3.8 或更高。
• PyTorch 和 TorchVision 库已安装并支持 CUDA（如果您的计算机有 NVIDIA GPU）。

详细安装步骤

步骤 1：克隆项目仓库

打开命令行工具，执行以下命令克隆项目仓库：

git clone https://github.com/duyhominhnguyen/LVM-Med.git
cd LVM-Med

步骤 2：创建虚拟环境

创建一个名为 lvm_med 的虚拟环境，并激活它：

conda env create -f lvm_med.yml
conda activate lvm_med

步骤 3：安装依赖

在虚拟环境中，安装项目所需的所有依赖。首先安装 segmentation-models.pytorch：

git clone https://github.com/qubvel/segmentation_models.pytorch.git
cd segmentation_models.pytorch
pip install -e
cd ..

然后将 segmentation_models_pytorch_example 文件夹中的 __init__.py 和 resnet.py 文件移动到 segmentation_models.pytorch/segmentation_models_pytorch/encoders 目录下：

mv segmentation_models_pytorch_example/encoders/__init__.py segmentation_models.pytorch/segmentation_models_pytorch/encoders/__init__.py
mv segmentation_models_pytorch_example/encoders/resnet.py segmentation_models.pytorch/segmentation_models_pytorch/encoders/resnet.py

步骤 4：准备数据集

根据您的需求下载相应的数据集，并将数据集文件夹移动到项目中的 dataset_demo 文件夹下。然后根据数据集的名称运行以下命令准备数据：

python prepare_dataset.py -ds [dataset_name]

替换 [dataset_name] 为您的数据集名称。

步骤 5：配置数据加载器

编辑 dataloader/yaml_data 中的 YAML 配置文件，确保其中的路径指向您的数据集。

完成以上步骤后，您就可以开始使用 LVM-Med 进行医学影像分析工作了。

LVM-Med 项目地址: https://gitcode.com/gh_mirrors/lv/LVM-Med