转录组分析流程(十):基因组突变分析

我们的教程主要是以一个具体的例子作为线索,通过对公共数据库数据bulk-RNA-seq的挖掘,利用生物信息学分析来探索目标基因集作为某种疾病数据预后基因的潜能及其潜在分子机制,同时在单细胞水平分析(对scRNA-seq进行挖掘)预后基因的表达,了解细胞之间的通讯网络,以期为该疾病临床治疗提供新的参考,同时我们还可以经过分子对接实现药物靶点的初步筛选。

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一、背景

基础概念

基因组变异分析是肿瘤生物信息学研究中的重要环节,旨在系统性地识别和描述肿瘤样本中的体细胞突变(如单核苷酸变异 SNV、插入缺失 InDel 等),揭示

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