医学图像处理_医学图像处理教程（二）——医学图像读取，存储和不同对象互相转换...

weixin_39798497

于 2020-11-29 15:41:37 发布

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文章标签：医学图像处理

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本文介绍了医学图像的读取方法，包括dicom和非dicom图像，探讨了图像存储、信息修改及其影响，以及SimpleITK图像与Numpy数组之间的转换。重点在于理解图像的方向矩阵对图像的影响，以及转换过程中需要注意的维度顺序问题。

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今天将给大家分享医学图像读取，包括dicom图像和非dicom图像，图像的存储以及修改图像信息后产生的变化结果，最后再介绍如何将SimpleITK的图像数据与Numpy的数据进行互相转换。

1、读取dicom序列文件

这里采用ImageSeriesReader()来读取dicom序列图像，只需要输入dicom的目录路径就可以读取图像。

# read dicom series imagedicom_input_dir = "E:\Data\other\LIDC_nodul"print("Reading Dicom directory:", dicom_input_dir)reader = sitk.ImageSeriesReader()dicom_names = reader.GetGDCMSeriesFileNames(dicom_input_dir)reader.SetFileNames(dicom_names)image = reader.Execute()

2、读取非dicom格式文件

这里采用ReadImage()来去读非dicom格式的图像，只需要输入非dicom格式的文件名就可以读取图像。

# read imageimage = sitk.ReadImage("srcdicom.mha")

3、输出图像信息

图像除了像素信息外，还有图像大小，图像spacing信息，图像方向信息，图像原点信息。

# show dicom series image messagesize = image.GetSize()print("Image size:", si

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