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单晶培养方法与优化策略综述--实验操作014
单晶培养方法及优化策略综述 摘要:本文系统总结了单晶培养的主要方法(溶剂挥发法、液相扩散法、气相扩散法)及操作要点,分析了影响单晶形成的关键因素。针对有机小分子和配合物的单晶获取,提出了无水无氧条件下的优化操作策略,包括溶剂体系选择、温度控制、结晶容器选择等。研究表明,通过控制溶剂挥发速率、分子间作用力和外部条件等参数,可显著提高单晶质量。综述为单晶培养提供了实用的技术参考,对结构化学和材料科学研究具有重要意义。原创 2025-07-30 15:07:11 · 505 阅读 · 0 评论 -
4-香豆酸:CoA连接酶晶体-文献精读138
4-香豆酸:CoA连接酶(4CL)是植物特有的苯丙烷类代谢途径的核心酶。它催化羟基肉桂酸-CoA硫酯的合成,这些硫酯是木质素和其他重要苯丙烷类化合物的前体,反应过程包括形成羟基肉桂酸-AMP酰胺和随后AMP被CoA取代的亲核替代反应。在本研究中,我们分别在2.4、2.5和1.9 Å分辨率下,确定了杨树(Populus tomentosa)4CL1的晶体结构,包括未修饰(apo)形式以及与AMP和腺苷5′-(3-(4-羟基苯基)丙基)磷酸(APP,一种中间体类似物)复合物的形式。原创 2025-05-31 20:55:29 · 1750 阅读 · 0 评论 -
N-甲基转移酶晶体-文献精读115
在天然产物生物合成中,涉及吲哚甲基化的N-甲基转移酶鲜有被发现。本研究聚焦于CyaF酶,该酶在生物合成过程中催化β-咔啉骨架上吲哚的关键N-甲基化步骤。从重组菌株中分离出了七种β-咔啉类似物(3–9),其中包括三种新化合物(5–7)。体外实验显示,CyaF 具有较强的底物适应性。通过解析CyaF/S-腺苷-L-高半胱氨酸(SAH)复合物的晶体结构,结合AlphaFold 预测模型及定点突变实验,揭示了CyaF 的催化机制和结构特征,阐明了其对多种底物的适应能力,并突出了其在生物催化领域的应用潜力。原创 2025-03-10 00:44:03 · 1716 阅读 · 0 评论 -
win下载安装Autodock Vina和mgltools-生信工具45
一路next即可,配合autodock使用!Autodock Vina下载。一路next即可安装。原创 2025-02-13 15:57:53 · 718 阅读 · 0 评论 -
Vinorine合成酶的晶体结构-文献精读110
Vinorine合成酶是一种酰基转移酶,在植物Rauvolfia中抗心律失常单萜吲哚生物碱ajmaline的生物合成中占据中心地位。Vinorine合成酶属于苯甲醇酰基转移酶、花青素-O-羟基肉桂酸酰基转移酶、苯甲酰基/肉桂酸酰基-氨基苯甲酸转移酶、去乙酰维多林酰基转移酶(BAHD)酶超级家族,其成员参与多种重要药物的生物合成,例如吗啡、紫杉醇以及抗癌药物长春新碱和长春碱的前体维多林。Vinorine合成酶的X射线结构解析分辨率为2.6 Å。原创 2025-02-08 14:30:55 · 1120 阅读 · 0 评论 -
紫杉醇的药物代谢-文献精读73
紫杉醇(PTX,或称Taxol)是一种广泛用于治疗多种癌症的化疗药物,经过细胞色素P450酶CYP3A4和CYP2C8的代谢转化。CYP3A4催化紫杉醇的芳香族羟基化反应,而CYP2C8表现出不同的反应特征,通过烷烃羟基化生成6α-羟基紫杉醇。尽管紫杉醇的代谢对其抗癌效果有显著影响,但这些转化的详细机制仍然大多不清楚。在本研究中,我们采用了量子力学和分子力学(QM/MM)混合计算来阐明人类CYP2C8对紫杉醇代谢的机制。我们的QM/MM结果显示,CYP2C8对紫杉醇的羟基化遵循一种非典型的反弹机制。原创 2024-10-28 23:34:20 · 1314 阅读 · 0 评论 -
肉桂酰辅酶A还原酶Cinnamoyl-CoA Reductases(CCR)表征及晶体-文献精读70
肉桂酰辅酶A还原酶(CCR)催化羟基肉桂酰辅酶A(CoA)酯的还原反应,利用NADPH生成木质素合成中的羟基肉桂醛前体。通过晶体结构、定点突变、动力学和热力学分析,推导了高粱(Sorghum bicolor)中肉桂酰辅酶A还原酶的催化机制和底物特异性,高粱是一种用于生物能源生产的重要植物。虽然SbCCR1对咖啡酰-CoA或p-香豆酰-CoA的亲和力高于对阿魏酰-CoA的亲和力,但该酶对后者的活性显著更高。原创 2024-10-22 21:05:52 · 1695 阅读 · 0 评论