在线 Reactome 富集分析

Reactome富集分析是一种基于Reactome通路数据库的生物信息学方法,用于研究基因或蛋白质集合在生物学通路中的功能富集情况。Reactome是一个高质量、人工注释的通路数据库,涵盖广泛的生物学过程,包括代谢、信号传导、免疫反应等。其核心目标是帮助研究者从系统层面理解基因的功能关联和调控网络。

分析目的:

解析基因/蛋白质的生物学功能:通过富集分析,确定目标基因集(如差异表达基因、蛋白质组数据)显著参与的Reactome通路,从而推断其生物学作用;

揭示疾病或表型的潜在机制:从高通量数据(如RNA-seq、ChIP-seq、质谱数据)中挖掘与疾病相关的关键通路;

支持多组学数据整合:结合GO富集、KEGG分析和蛋白质互作网络(PPI),构建更全面的“基因-通路-表型”关联模型;

指导实验验证:通过富集结果筛选关键通路,设计后续功能实验(如通路抑制剂处理、基因敲除/过表达)。

如果对于代码不是很理解、不想自己写代码又或是没有代码运行条件,可以尝试使用【掌上生信绘图平台(https://handybioplot.cn)】,只需要上传文件即可一键分析并自动绘制对应的图片。

柱状图

气泡图

结果表

绘图参数

结果图片均提供了绘图参数,可以自由修改图片样式

任务列表

如果分析结果不满意,还可以修改参数重新提交分析,所有任务独立记录,可自由切换查看结果。

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