生信入门转录组分析——上游分析
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从实战出发，带你零基础入门转录组分析——上游分析，包括：软件的安装，数据的准备，质控，序列比对，表达定量，最后输出结果为基因表达矩阵，可与另一个专栏：生信入门转录组分析——下游分析相衔接
呆猪儿
本人曾任职国内最前沿生信分析工程师，拥有上百个完整项目实战经验，现今团队均为国内外硕博，人均有完整的项目实战经验。额外承接生信项目及教学，包括但不限于TCGA，GEO数据挖掘，生存分析，预后模型构建，机器学习，孟德尔随机化分析，单细胞转录组分析，NHANES数据分析，MIMIC数据分析等，以及nature级生信绘图。
座右铭：授人与鱼不如授人以渔
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零基础入门转录组上游分析——第五章（表达定量）
零基础入门转录组分析第五章——表达定量，从实战（小鼠注射药物后的差异基因转录组分析）的角度详细展开全部内容，全文有5个部分（1.序列比对结果查看 2. 表达定量 3. 提取有效信息 4. 合并多个样本定量结果 5.进一步修改表达矩阵）原创 2024-10-21 16:09:08 · 2085 阅读 · 4 评论 -
零基础入门转录组上游分析——第四章（序列比对）
零基础入门转录组上游分析第四章——序列比对，从实战（小鼠注射药物后的差异基因转录组分析）的角度详细展开全部内容，全文有5个部分（1.数据准备 2. 构建参考基因组索引 3. 序列比对 4. 压缩与排序 5. 批量运行 ）原创 2024-10-18 15:47:29 · 2271 阅读 · 3 评论 -
零基础入门生信转录组数据分析——导读
转录组数据分析（上游，下游，数据可视化）专栏的目录，可以直接通过点击各个分析点直接跳转到相关帖子，方便查找和观看原创 2024-10-18 15:38:25 · 7395 阅读 · 0 评论 -
零基础入门转录组上游分析——第三章（质控及数据过滤）
零基础入门转录组分析第三章——质控及质量过滤，从实战（小鼠注射药物后的差异基因转录组分析）的角度详细展开全部内容，全文有6个部分（1. 查看原始数据 2. 质控 3. 质控进阶 4. 质控结果合并 5. 合并结果解读 6. 数据过滤）原创 2024-10-17 16:48:24 · 2822 阅读 · 0 评论 -
零基础入门转录组上游分析——第二章（数据的准备）
零基础入门转录组分析第二章——数据准备，从实战（小鼠注射药物后的差异基因转录组分析）的角度详细展开全部内容，全文有三个部分（1. 准备原始数据 2. 准备参考基因组文件 3. 准备参考基因组注释文件）原创 2024-10-17 16:48:16 · 1885 阅读 · 3 评论 -
零基础入门转录组上游分析——第一章（软件的安装）
零基础入门转录组分析，从实战（小鼠注射药物后的差异基因转录组分析）的角度详细展开第一个章节：软件安装，本章节是定量流程的第一步，后续全部章节内容包括：软件安装——数据准备——质控——序列比对——表达定量——数据可视化等原创 2024-10-16 18:03:56 · 2073 阅读 · 3 评论