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育种数据分析之放飞自我
个人公众号:育种数据分析之放飞自我
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笔记03 | 机器学习A-Z 数据预处理(R)
数据预处理工具1. 载入库这里,使用R中的默认函数read.csv读取数据,使用caTools包切分数据。# install.packages("caTools")library(caTools)2. 载入数据这里的数据为Data.csv,格式是csv格式,使用的是read.csv的函数读取。dataset = read.csv('Data.csv')datasetA data.frame: 10 × 4 CountryAgeSalaryPurchased <chr>原创 2020-11-24 23:03:43 · 505 阅读 · 1 评论 -
笔记02 | 机器学习A-Z 数据预处理(python)
数据预处理工具1. 载入库这里,载入的是numpy,matplotlib中的pyplot,还有pandas这三个库。import numpy as npimport matplotlib.pyplot as pltimport pandas as pd2. 载入数据这里的数据为Data.csv,格式是csv格式,使用的是pandas的函数读取。这里读取成功后,打印前4行预览一下。dataset = pd.read_csv('Data.csv')dataset.head()原创 2020-11-22 16:22:49 · 504 阅读 · 0 评论 -
笔记01 | 机器学习A-Z 学习笔记序
1. 背景这门课是Udemy上的课程,这里我记录一下学习笔记。我的知识背景:农学专业,生物信息方向,偏数据分析岗位。编程语言熟悉Perl,Python,R,数据分析知识熟悉生物统计,一直想学习机器学习,但是没有很多进展。这里,根据视频课程,课程代码,学习相关知识,并上机操作记录笔记。里面加上自己的一些学习心得体会。这是一个系列,我计划2020年底学习更新完成,对相关课程感兴趣的朋友,关注我,一起学习交流吧。2. 课程介绍对机器学习领域感兴趣吗?那么这道菜是给你的!本课程帮助您以简单的方式学原创 2020-11-21 16:00:36 · 468 阅读 · 0 评论 -
机器学习的路线
之前,在公众号上写了一个专辑《进军机器学习》,时间跨度两年了,还是学学停停,同样学习的朋友都已经到深度学习、神经网络、强化学习了,而我还在机器学习的门口左右徘徊。关于机器学习的学习,我有很多经验,因为我深深的知道不花钱是不能够学到东西的,毕竟充值才能让你变强,我也知道不立Flag不能办成事。我的Flag历史,最早可以追溯到2018年,距今已有两年了!截图如下:关于充值使你变强,我买了很多书,买了很多课程,报了一些班,虽然买过之后特别有学到东西的满足感,花钱的快乐就是好,但是很多书都放在书架上只能睡觉,原创 2020-10-22 21:55:33 · 659 阅读 · 0 评论 -
机器学习 | R语言中的方差分析汇总
方差分析,是统计中的基础分析方法,也是我们在分析数据时经常使用的方法。下面我总结一下R语言如何对常用的方差分析进行操作。1. 方差分析的假定上面这个思维导图,也可以看出,方差分析有三大假定:正态,独立和齐次,如果不满足,可以使用广义线性模型或者混合线性模型,或者广义线性混合模型去分析。本次我们的主题有:2. 数据来源这里,我们使用的数据来源于R包agridat,它是讲农业相关的论文,书籍中相关的数据收集在了一起,更加符合我们的背景。包的下载地址:https://cran.r-project.原创 2020-10-21 21:53:52 · 5556 阅读 · 3 评论 -
机器学习 | 使用statsmodels和sklearn进行回归分析
这里,使用Python中的statsmodels和sklearn进行回归分析。1. 数据来源:womenwomen是R中的一个数据集,我们把它保存到csv文件中:> data(women)> write.csv(women,"women.csv",row.names = F)数据预览:2. statsmodels的矩阵的形式import pandas as pdimport statsmodels.api as smdat = pd.read_csv("women.csv"原创 2020-06-09 22:08:06 · 4489 阅读 · 0 评论 -
如何学习GWAS以及安利西瓜书
1. 江郎才尽怎么讲那就开始回忆过去……开始讲我有一个朋友……开始贴邮件来往,有人给我写信……2. ok,贴邮件有一个同学,给我写了一封信,信中如李太白之行路难,欲渡黄河冰塞川,将登太行雪满山……下载数据,下载不下来Linux系统一窍不通git能操作完全摸不着北编程基础几乎没有我看过之后认为,这完全就是刚入门的状态,没有什么毛病!我之前也是这种状态,甚至更差,所以我就回了一封信,回信的过程中我就变成了人生导师,然后青春一去不回来了。我记得不久前青春才撞了我一下腰,现在竟然要当人生导原创 2020-06-02 22:52:22 · 1012 阅读 · 1 评论 -
Spyder: 一款优秀的Python 数据科学开发环境
个人感想看到Udemy中机器学习的教程,讲师用的是Rstudio操作的R,用的是Spyder操作的Python,惊艳了我。决定学习一下这个编辑器的操作,做一下记录。1. Spyder编辑器介绍Spyder是一个强大的科学环境是用Python编写编辑器,由科学家,工程师和数据分析师所设计。它具有一个综合开发工具的高级编辑、分析、调试和概要分析功能与科学包的数据探索、交互执行、深度检查和漂亮的可视化功能的独特组合。此外,Spyder还内置集成了许多流行的科学软件包,包括NumPy、SciPy、Pan原创 2020-05-22 00:03:32 · 5491 阅读 · 2 评论 -
由火车站戴口罩人脸识别入站感想
由火车站戴口罩人脸识别入站感想个人经历过完春节,去上班,疫情还很严重,火车站机器安检,需要摘下口罩刷身份证才可以安检成功,在摘下口罩的那一刻,慌得一批。最近经历最近又坐火车,还是机器安检,这时候疫情基本控制,准备从容的摘到口罩安检,发现前面那个人戴着口罩刷身份证竟然通过了,我抱着试试看的态度戴着口罩安检,人脸识别通过,验票成功。机器学习我的第一感觉,是机器学习的模型更新了,安检机器上的算法已经可以做到对遮盖的面部进行人脸识别了,我以为应用还很遥远,没想到就在眼前!朋友交流我把这个经历说了以后原创 2020-05-19 23:27:21 · 873 阅读 · 0 评论 -
Fortran 搭配vscode安装及配置
1. Fortran安装及配置1.1 安装MinGWMinGW-w64 - for 32 and 64 bit Windows下载安装包。双击打开安装程序,点击Next:点击Next:一直默认安装:1.2 配置环境变量我的路径为:C:\Program Files (x86)\mingw-w64\i686-8.1.0-posix-dwarf-rt_v6-rev0\mingw...原创 2019-11-07 08:22:19 · 6416 阅读 · 1 评论 -
当机器学习遇到基因组选择
当你还在GBLUP或者贝叶斯类方法进行优化时, 我带着卷积神经网络进行了降维打击…1. 参考文献Crossa, José, Pérez-Rodríguez, Paulino, Cuevas J , et al. Genomic Selection in Plant Breeding: Methods, Models, and Perspectives[J]. Trends in Plant ...原创 2019-06-04 17:40:01 · 3645 阅读 · 0 评论 -
如何批量提取网页上的链接
如何批量提取网页上的链接?比如打开淘宝, 想把里面所有的商品链接提取出来, 应该怎么操作?1. 打开淘宝https://world.taobao.com/2. 打开google插件:Link Grabber3. 打开右上角Link Grabber快捷键会显示提取的链接, 复制即可.可以看出, 改页面共提取1089个链接, 可以根据商品的前缀, 进行筛选.4. firefox...原创 2019-06-08 15:33:18 · 18156 阅读 · 0 评论 -
通过基因组选择预测杂交水稻的表现(数据挖掘)
基因组选择, 预测杂种优势, 在水稻可以用, 在玉米, 高粱中也可以用, 在动物选择配套系时也可以用, 根据加性效应和非加性效应进行预测. 前景广阔.这篇文章的作者, 有很多大牛, 徐世忠老师, 专门做算法的, 张启发老师, 水稻大牛, 文章本身没有数据源, 使用已有数据, 去挖掘信息, 这才是数据分析师应该有的范…1. 参考文献Cui Y , Li R , Li G , et al. H...原创 2019-06-05 20:19:58 · 2706 阅读 · 0 评论 -
进军机器学习--序言
我们之所以建模, 主要的价值在于预测. 学习统计时, 看到各种模型,线性回归,多元线性回归, 曲线回归等等, 都是为了建模.但是模型是否好呢? 我们可以查看R方, 调和R方.机器学习的到来, 为统计打开了另一扇大门. 交叉验证, 查看预测准确度.如果说现代统计学是一门循序渐进, 系统完善的科学, 机器学习则是各种流派,黑猫白猫抓到老鼠就是好猫. 英雄不问出处.机器学习的到来, 让结果说...原创 2018-11-09 20:20:31 · 575 阅读 · 0 评论