Historia:

Los coronavirus son virus de ARN de sentido positivo envueltos que varían de 60 nm a 140 nm de
diámetro con proyecciones en forma de púas en su superficie que les dan una apariencia de corona
bajo el microscopio electrónico; de ahí surge el nombre de coronavirus [3]. Además, un motivo de
cuatro residuos en la RBM del SARS-CoV-2 (aminoácidos 482-485:G-V-E-G) da como resultado una
estructura más compacta de su cresta de unión a hACE2 que en el SARS-CoV y permite un mejor
contacto con el N-terminal hélice de ACE2 (REFS). Todos los pacientes eran asintomáticos (9%) o
tenían una enfermedad leve. Abordar esta epidemia es un trabajo a largo plazo que requiere el
esfuerzo de cada individuo y la colaboración internacional de científicos, autoridades y el público en
general para crear un sitio de escisión polibásico (RRAR), que permite una escisión eficaz mediante
furina y otras proteasas". Además de RaTG13 y RmYN02, el análisis filogenético muestra que los
coronavirus de murciélago ZC45 y ZXC21 detectados previamente en murciélagos Rhinolophus
pusillus del este de China también pertenecen al linaje SARS-CoV-2 del subgénero Sarbecovirus"
(FIG. Se observaron neumonía intersticial viral aguda y respuestas inmunes humorales y celulares.
La tomografía computarizada de tórax suele ser anormal incluso en aquellos sin síntomas o con
enfermedades leves. El tratamiento es esencialmente de apoyo; el papel de los agentes antivirales
aún no se ha establecido. CDC (Tabla 1) (258, 259) consolidación. Los 6 marcos de lectura abierta
funcional (ORFs) están ordenados de 5’ a 3’: replicasa (ORFla/ORF1b), espiga (E), envoltura (E),
membrana (M) y nucleocápside (N). Todos los pacientes se recuperaron con terapia sintomática y
no se registraron muertes. Un análisis avanzado en profundidad del genoma ha identificado 380
sustituciones de aminoácidos entre las secuencias de aminoácidos del SARS-CoVv-2 y los
coronavirus similares al SARS/SARS. Inmediatamente después de la confirmación de la etiología
viral, los virólogos chinos publicaron rápidamente la secuencia genómica del SARS-CoV-2, que
desempeñó un papel crucial en el control de la propagación de este nuevo coronavirus recién
apareciendo en otras partes del mundo (69). 4).

La transmisión temprana de SARS-CoV-2 en Wuhan en diciembre de 2019 se relacionó inicialmente

con el mercado mayorista de mariscos de Huanan, y se sugirió como fuente del brote260. 4).
Actualmente, sin embargo, los datos de secuencias disponibles no son suficientes para interpretar
la historia de la transmisión global temprana del virus, los patrones de viaje, los efectos fundadores
y las medidas de salud pública también influyen fuertemente en la propagación de linajes
particulares, independientemente de las posibles diferencias biológicas entre las diferentes
variantes del virus. Desde marzo, mientras que el COVID-19 en China está efectivamente controlado,
el número de casos en Europa, EE.UU. y otras regiones se ha disparado. El 23 de enero se cerró la
ciudad de Wuhan y se bloquearon todos los viajes y transportes que conectaban con la ciudad. En
las dos semanas siguientes, se restringieron todas las actividades y reuniones al aire libre, y se
dosificaron las instalaciones públicas en la mayoría de las ciudades, así como en el campo". Hasta
ahora, ninguna prueba ha demostrado que los pangolines estuvieran directamente implicados en la
aparición del SRAS-COV-2. Sin embargo, la carga viral de SARS-CoV-2 en muestras del tracto
respiratorio superior ya era colosal durante la primera semana de síntomas, por lo que el riesgo de
diseminación faríngea del virus era muy alto al principio de la infección%. Excepto lopinavir y
ritonavir, que inhiben 3CLpro, los otros tres actúan sobre RdRp2515 (FIG. 2). Recientemente se ha
propuesto una RO estimada de 2,5 (oscilando entre 1,8 y 3,6) para el SARS-CoV-2, frente a 2,0-3,0
para el SARS-CoV. El 23 de enero, los 11 millones de habitantes de Wuhan fueron bloqueados con
restricciones de entrada y salida de la región. Los epítopos neutralizantes de estos anticuerpos
monoclonales también ofrecen información importante para el diseño de vacunas. El brote de
COVID-19 en China alcanzó un pico epidémico en febrero. (3a). Por lo tanto, el despliegue de
intervenciones eficaces de salud pública podría ayudar a cortar la propagación de este virus a nivel
mundial.

El animal huésped y el contagio:

Los murciélagos son importantes huéspedes naturales de alfacoronavirus y betacoronavirus. (5). Un

modo de estado de reposo de la proteína S del SARS-CoV-2 puede no favorecer la unión al receptor,
pero es útil para la evasión inmunitaria". El posible origen del SARS-CoV-2 y el primer modo de
polimorfismo en la posición nucleotídica 28.144, que da lugar a la sustitución aminoacídica de Ser
por Lys en el residuo 84 de la proteína ORF8. La posibilidad de protección “eross” en CoVID-19 fue
comparando las secuencias de la proteína S del SARS-CoV-2 evaluadas con la del SARS-CoV. La
administración de alimentos y medicamentos (FDA) había concedido 22 autorizaciones de Uso
Urgente (EUA) de diagnóstico in vitro, entre ellas para el panel de diagnóstico RT- PCR para la
detección universal de betacoronavirus similares al SARS y la detección específica del SARS-CoV- 2,
desarrollado por los EE.UU. Muchas personas son asintomáticas. El parecido más cercano al SARS-
CoV-2 conocido hasta la fecha es un coronavirus de murciélago detectado en Rhinolophus affinis de
la provincia de Yunnan (China), denominado 'RaTG13, cuya longitud de secuencia genómica es
idéntica en un 96,2% a la del SARS-CoV-2 (REF «). El síndrome de tormenta de citoquinas causa
síndrome de distrés respiratorio agudo e insuficiencia respiratoria, que se considera la principal
causa de muerte en pacientes con COVID-19 (REFSO), y de muertes. Por otro lado, se ha notificado
un alto riesgo de transmisión nosocomial en algunos otros. La patogénesis de la infección por SARS-
CoV-2 en humanos se manifiesta desde síntomas leves hasta insuficiencia respiratoria grave.
Independientemente del tipo de coronavirus, las células inmunitarias, como los mastocitos, que
están presentes en la submucosa del tracto respiratorio y la cavidad nasal se consideran la principal
barrera contra este virus (92). El virus también puede detectarse en las heces y, en casos graves, en
la sangre. No obstante, según los hallazgos actuales, la divergencia entre el SARS-CoV-2 y los
coronavirus de murciélago relacionados probablemente representan más de 20 años de evolución
de la secuencia, lo que sugiere que estos coronavirus de murciélago sólo pueden considerarse el
precursor evolutivo probable del SARS-CoV-2, pero no el progenitor directo del SARS-CoV-2 (REF35).
Además de los murciélagos, los pangolines son otros huéspedes salvajes probablemente
relacionados con el SARS-CoV-2. Los datos bioquímicos confirmaron que las características
estructurales del RBD del SARS-CoV-2 han reforzado su afinidad de unión a hACE2 en comparación
con la del SARS-CoV50,52,53. Al igual que otros coronavirus, el SARS-CoV-2 necesita el
procesamiento proteolítico de la proteína S para activar la ruta endocítica. EE.UU. es el país con
mayor número de casos hasta la fecha. Aunque las pruebas genéticas sugieren que el SARS-CoV-2
es un virus natural que probablemente se originó en animales, aún no hay conclusiones sobre
cuándo y dónde entró el virus por primera vez en el ser humano. Los resultados preliminares del
ensayo clínico Adaptive COVID-19 Treatment Trial (ACTT) del Instituto Nacional de Alergia y
Enfermedades Infecciosas (NIAID) informaron de que remdesivir puede acortar el tiempo de
recuperación en adultos hospitalizados con COVID-19 en un par de días en comparación con el lugar,
pero la diferencia en la mortalidad no fue estadísticamente significativa, La FDA ha emitido una
autorización para el uso de emergencia de remdesivir para el tratamiento de pacientes
hospitalizados con COVID-19 graves. La mayoría de las personas mostraron signos de enfermedad
tras un periodo de incubación de 1 a 14 días (con mayor frecuencia en torno a 5 días), y la disnea y
la neumonía se desarrollaron en una mediana de 8 días desde el inicio de la enfermedad. En un
informe de 72.314 casos en China, el 81% de los casos se clasificaron como leves, el 14% eran casos
graves que requerían ventilación en una unidad de cuidados intensivos (UCI) y un 5% eran críticos
(es decir, los pacientes presentaban insuficiencia respiratoria, shock séptico y/o disfunción o
insuficiencia orgánica múltiple, Al ingreso, la opacidad en vidrio deslustrado era el hallazgo
radiológico más común en la tomografía computarizada (TC) de tórax. El 30 de enero, la OMS declaró
el nuevo brote de coronavirus emergencia de salud pública de importancia internacional". Hay que
recordar que los paneles PCR multiplex actualmente disponibles no incluyen el COVID-19. Los
estudios intensivos sobre estos perfiles virológicos del SARS-CoV-2 sentarán las bases para el
desarrollo de estrategias preventivas y terapéuticas contra el COVID-19. Se calcula que la tasa de
letalidad oscila entre el 2 y el 3%. El diagnóstico se realiza por demostración del virus en las
secreciones respiratorias mediante pruebas moleculares especiales. Los inhibidores de la
replicación incluyen remdesivir (GS-5734), favilavir (T-705), ribavirina, lopinavir y ritonavir. La
mayoría de las ciudades chinas se enfrentan actualmente a brotes localizados de COVID-19 (231). El
motivo de unión al receptor (RBM; que forma parte del RBD) de estos virus presenta una única
variación de aminoácidos con respecto al SARS-CoV-2, y es idéntico al de este último en las cinco
vías respiratorias inferiores críticas. Además, es necesario un seguimiento genómico continuado del
SARS-CoV-2 en nuevos casos en todo el mundo, ya que es importante identificar rápidamente
cualquier mutación que pueda dar lugar a cambios fenotípicos del virus. El principal problema
asociado a este kit de diagnóstico es que sólo funciona cuando el sujeto de la prueba tiene una
infección activa, lo que limita su uso a las primeras fases de la infección. Por el momento, tampoco
se dispone de pruebas comerciales. 3a). El tratamiento con plasma convaleciente es otra terapia
complementaria potencial para el COVID-19. Además, la excreción prolongada del virus alcanzó el
punto más alto en el curso de la infección en macacos asintomáticos, y los monos viejos mostraron
una neumonía intersticial más grave que los monos jóvenes", lo que es similar a lo que se observa
en pacientes con COVID-19. El reciente aumento del número de pacientes críticos confirmados con
COVID-19 ya ha superado los suministros de cuidados intensivos, lo que limita los servicios de
cuidados intensivos a sólo una pequeña parte de los pacientes críticos (67). Antes de elegir el agente
terapéutico ideal para el tratamiento de la COVID-19, deben realizarse estudios de control clínico
aleatorizados con una población de estudio suficiente.

Las vacunas:

La vacunación es el método más eficaz para una estrategia a largo plazo de prevención y control de
COVID-19 en el futuro. Aunque se han detectado infecciones por COVID-19 en casi 30 cruceros de
diferentes países, los principales cruceros implicados en los brotes de COVID-19 son el Diamond
Princess, el Grand Princess, el Celebrity Apex y el Ruby Princess. Los caninos también se ven
afectados por CoV que pertenecen a géneros diferentes, a saber, coronavirus entérico canino en
Alphacoronavirus coronavirus en Betacoronavirus, que afectan al tracto entérico y respiratorio
canino, respectivamente (129, 130). La elevada mortalidad se produjo especialmente cuando los
recursos sanitarios se vieron desbordados. También se ha notificado fallo orgánico múltiple en
algunos casos de COVID-19 1365. Los cambios histopatológicos en pacientes con COVID-19 se
producen principalmente en los pulmones. Cuatro virus corona, llamados, HKU1, NL63, 229E y
OC43, han estado en circulación en humanos, y generalmente causan enfermedad respiratoria leve.
En las dos últimas décadas se han producido dos casos en los que la transmisión de virus betacorona
de animales a humanos ha provocado una enfermedad grave. La subunidad 51 de un corona-virus
se divide a su vez en dos dominios funcionales, un dominio N-terminal y un dominio C-terminal. Los
análisis estructurales y bioquímicos identificaron una región de 211 aminoácidos (aminoácidos 319-
529) en el dominio C-terminal S1 del SARS-CoV-2 como el RBD, que tiene un papel clave en la
entrada del virus y es el objetivo de los anticuerpos neutralizantes 051 (FIG. Las cepas del virus
portadas por estos dos huéspedes intermedios eran casi genéticamente idénticas a los virus
correspondientes en humanos (más del 99% de identidad de secuencia genómica)'. A pesar de una
RBD prácticamente idéntica a la del SARS-CoV-2, los coronavirus de pangolín conocidos hasta la
fecha no tienen más de un 92% de identidad genómica con el SARS-CoV-2 (REF), La prevención
implica el aislamiento domiciliario de los casos sospechosos y de las personas con enfermedades
leves, así como medidas estrictas de control de la infección en los hospitales que incluyan
precauciones contra el contacto y las gotitas. Los pacientes infectados por COVID-19 presentaban
niveles elevados de angiotensina 2 en plasma. Se descubrió que el nivel de angiotensina 2 se
asociaba linealmente con la carga viral y la lesión pulmonar, lo que indica su potencial como
biomarcador diagnóstico (121). Hasta el 30 de marzo de 2020, luego en Estados Unidos y
posteriormente, la transmisión continua de persona a persona propagó el brote". La mayoría de las
proteínas codificadas por el SARS-CoV-2 tienen una forma similar a la del COVID-19 y mostraban
características típicas en la TC inicial, incluidas opacidades multilobulares bilaterales en vidrio
deslustrado con una distribución periférica o posterior 1, Por lo tanto, se ha sugerido que la TC
combinada con pruebas repetidas con hisopo debería utilizarse en individuos con alta sospecha
clínica de COVID-19 pero que dan negativo en el cribado inicial con ácido nucleico 1, Por último, Las
pruebas serológicas del SARS-CoV-2 que detectan anticuerpos contra la proteína Nor S podrían
complementar el diagnóstico molecular, sobre todo en fases tardías tras el inicio de la enfermedad
o para estudios retrospectivos16,120121; Sin embargo, el alcance y la duración de las respuestas
inmunitarias aún no están claras, y las pruebas serológicas disponibles difieren en su sensibilidad y
especificidad, todo lo cual debe tenerse en cuenta a la hora de decidirse por las pruebas serológicas
e interpretar sus resultados o, potencialmente, en el futuro, realizar pruebas para detectar
respuestas de células T.

Tratamientos Terapéuticos:

Hasta la fecha, no hay terapias eficaces generalmente probadas para el COVID-19 o antivirales
contra el SARS-CoV- 2, aunque algunos tratamientos han mostrado algunos beneficios en ciertas
subpoblaciones de pacientes o para ciertos puntos finales (véase más adelante). (3d). Un estudio
estructural sugirió que el sitio de eliminación de furina puede reducir la estabilidad de la proteína
SARS- CoV 25 y facilitar la adaptación conformacional que se requiere para la unión del RBD a su
receptor". Estas diferencias en las secuencias de aminoácidos podrían haber contribuido a la
diferencia en la divergencia patogénica del SARS-CoV-2 (16). Se necesitan más investigaciones para
evaluar las posibles diferencias en el tropismo, la patogénesis y la transmisión de este nuevo agente
asociadas a este cambio en la secuencia de aminoácidos. Se encontró que la IFR estaba en el rango
de 0,3% a 0,6%, que es comparable a la de una pandemia de gripe asiática anterior (de 1957 a 1958)
(73, 277)
En particular, el nuevo análisis de la curva pandémica COVID -19 del grupo inicial de casos apuntaba
a una transmisión considerable de persona a persona. En comparación con las cepas de Guangdong,
los coronavirus de pangolín notificados en Guangxi son menos similares al SARS-CoV-2, con un
85,5% de identidad en la secuencia genómica", La aparición repetida de infecciones por coronavirus
relacionadas con el SARS-CoV-2 en pangolines procedentes de distintos casos de contrabando
sugiere que estos animales son posibles huéspedes de los virus. Esta propiedad de la RBD puede
aprovecharse para diseñar posibles vacunas que contengan RBD contra el SARS-CoV, ya sea
utilizando proteínas recombinantes o vectores recombinantes que codifiquen la RBD (175). En
comparación con virus emergentes como el virus del Ébola, el H7N9 aviar, el SARS-CoV y el MERS-
CoV, el SARS-CoV-2 tiene una patogenicidad relativamente menor y una transmisibilidad moderada
(15). El riesgo de muerte entre las personas infectadas con COVID-19 se calculó utilizando el riesgo
de mortalidad por infección (IFR). Investigadores y fabricantes están llevando a cabo ensayos
clínicos a gran escala para evaluar diversas terapias contra el COVID-19. Está muy estrechamente
relacionado con el SARS-CoV-2, presentando una similitud de secuencia del 92,4%. Por último, la
COVID-19 supone un reto para todos los seres humanos. Los hallazgos de laboratorio comunes
incluyen recuentos de glóbulos blancos normales/bajos con proteína C reactiva (PCR) elevada. La
mayoría de estas proteínas no estructurales del SARS-CoV-2 tienen una identidad de secuencia de
aminoácidos superior al 85% con el SARS-CoV25. El análisis filogenético del genoma completo
muestra que el SARS-CoV-2 está agrupado con el SARS-CoV y los coronavirus relacionados con el
SARS (SARSr-CoVs) encontrados en murciélagos, lo sitúan en el subgénero Sarbecovirus del género
Betacoronavirus. La región del gen de unión al receptor (173, 174). Al unirse a las células epiteliales
del tracto respiratorio, el SARS-CoV-2 comienza a replicarse y a migrar hacia las vías respiratorias y
penetra en las células epiteliales alveolares de los pulmones. El análisis comparativo confirmó que
los residuos variables se encontraban concentrados en la subunidad SI de la proteína S, un objetivo
importante del virus (150). Estudios recientes informaron de la existencia de anticuerpos
monoclonales específicos que neutralizan la infección por SARS-CoV-2.

Inhibición de la replicación del virus:

La migración masiva de chinos durante el Año Nuevo chino alimentó la epidemia. Se notificaron
casos en otras provincias de China y otros países (Tailandia, Japón y Corea del Sur en rápida
sucesión) en personas que regresaban de Wuhan. Se ha demostrado que las proteasas del huésped
participan en la escisión de la proteína S y activan la entrada del SARS-CoV-2, entre ellas la proteasa
transmembrana serina proteasa 2 (TMPRSS2), la catepsina L y la furint «5455. Las muestras
ambientales del mercado de marisco de Huanan también dieron positivo, lo que significa que el
virus se originó allí [7]. El virus se propaga más rápido que sus dos antepasados los residuos de SARS-
CoV para la unión al receptor (FIG). Sin embargo, este primer informe individual no puede dar una
respuesta sólida sobre el origen del SARS-CoV-2 y la contaminación, por lo que no puede excluir un
resultado falso positivo. Es más, es probable que sigan produciéndose futuros brotes de virus y
patógenos de origen zoonótico. Por lo tanto, aparte de frenar este brote se sabe que los coronavirus
bovinos infectan a varios rumiantes domésticos y salvajes (126). El primer caso mortal se notificó el
11 de enero de 2020. Varios laboratorios de todo el mundo están desarrollando actualmente
pruebas de diagnóstico basadas en anticuerpos contra el SARS-CoV-2 (157)

La Tomografía Computarizada torácica es una herramienta diagnóstica ideal para identificar la

neumonía viral. Con el brote actual de COVID-19, se espera un aumento significativo del número de
estudios publicados sobre este coronavirus emergente, como ocurrió con anteriores epidemias de
enfermedades respiratorias graves, ya que los casos ocurridos requieren sedantes, analgésicos e
incluso fármacos de relajación muscular para evitar la incoordinación de la lesión pulmonar
relacionada con la ventilación mecánica (122). El descubrimiento de diversos coronavirus de
murciélago estrechamente relacionados con el SARS-CoV-2 sugiere que los murciélagos son posibles
reservorios del SARS-CoV-2 (RE.*"). Dentro de este clado, el SARS-CoV-2 se agrupa en un linaje
distinto junto con cuatro aislamientos de coronavirus de murciélagos de herradura (RaTG13,
RmYN02,ZC45 y ZXC21), así como nuevos coronavirus identificados recientemente en pangolines,
que se agrupan paralelamente al SARS-CoV in vitro e in vivo5- 135, En comparación con el plasma
de convalecientes, cuya disponibilidad es limitada y no puede amplificarse, los anticuerpos
monoclonales pueden desarrollarse en mayores cantidades para satisfacer los requisitos clínicos. A
medida que la epidemia avanza, los tests comerciales de COVID-19 están ampliamente disponibles
y pueden utilizarse para detectar la presencia del virus en la población. Si la enfermedad progresa,
especialmente en personas con factores de riesgo y comorbilidades, puede derivar en neumonía,
síndrome de dificultad respiratoria aguda (SDRA) y disfunción multiorgánica. La vacuna ha
demostrado ser segura e inducir una considerable respuesta inmunitaria humoral y celular en la
mayoría de los receptores después de una única inmunización. Otra vacuna vectorizada, ChAdOx1,
y otros SARSr-CoVs (FIG). En la actualidad, las técnicas de detección de ácidos nucleicos, como la RT-
PCR, se consideran un método efectivo para confirmar el diagnóstico en casos clínicos de COVID-19.
Aquellas variantes con esta mutación constituyen un subclado único etiquetado como clado 5'3. Los
síntomas más comunes fueron fiebre (50%) y tos (38%). Los análisis histopatológicos mostraron
daño alveolar difuso bilateral, formación de membranas hialinas, descamación de neumocitos y
depósitos de fibrina en los pulmones de pacientes con COVID-19 grave. Esto también podría haber
contribuido al aumento de la tasa de letalidad observada en el brote de COVID-19.

Virología:

Los coronavirus, una familia de virus dentro de la superfamilia de los nidovirus, se clasifican aún más
según sus géneros, alfa-, beta-, gamma- y deltacoronavirus (α, β, γ y δ). Entre estos, las especies alfa
y beta son capaces de contaminar solo mamíferos, mientras que los otros dos géneros pueden
infectar aves y también mamíferos. Dos de estos géneros pertenecen a los coronavirus humanos
(HCoVs): los coronavirus alfa, que incluyen el coronavirus humano 229E (HCoV-229E) y el
coronavirus humano NL63 (HCoV-NL63), y los coronavirus beta, que son el coronavirus humano
HKU1, el coronavirus humano OC43, el MERS-CoV (conocido como síndrome respiratorio de Oriente
Medio) y el SARS-CoV (referido como síndrome respiratorio agudo severo coronavirus). El
coronavirus del síndrome respiratorio agudo severo 2 (SARS-CoV-2) ahora se denomina COVID-19
(enfermedad por coronavirus 2019). En pequeños animales de laboratorio, el virus de la hepatitis
murina, el coronavirus de la sialodacrioadenitis de rata y los coronavirus de cobayo y conejo son los
principales CoVs asociados con manifestaciones de enfermedad como enteritis, hepatitis e
infecciones respiratorias. Se postuló que las infecciones no documentadas podrían representar el
79% de las vacunas que han demostrado eficacia in vitro contra el SARS-CoV para ser utilizadas
contra el SARS-CoV-2. El número de casos documentados se debió a la alta transmisibilidad del virus
durante la enfermedad leve o el período asintomático. Por lo tanto, la alta similitud genética
existente entre SARS-CoV-2 y SARS-CoV puede ser utilizada para reutilizar vacunas que han
demostrado eficacia in vitro contra el SARS-CoV para su utilización contra el SARS-CoV-2. El número
de casos comenzó a aumentar exponencialmente, algunos de los cuales no tuvieron exposición al
mercado de animales vivos, lo que sugiere que estaba ocurriendo la transmisión de humano a
humano. Sin embargo, a diferencia de los murciélagos, que portan coronavirus de manera
saludable, los pangolines infectados mostraron signos clínicos y cambios histopatológicos, incluida
neumonía intersticial e infiltración celular inflamatoria en diversos órganos. Según el tablero de
COVID-19 del Centro de Ciencia y Ingeniería de Sistemas de la Universidad Johns Hopkins, hasta el
11 de agosto de 2020, se vinculó a un miembro de la familia y 26 niños tenían antecedentes de
viajes/residencia en la provincia de Hubei, China. En las secciones siguientes, resumimos los posibles
tratamientos contra el SARS-CoV-2 sobre la base de datos clínicos publicados y experiencia.
Utilizando secuencias de cinco dominios replicativos conservados en pplab (proteasa 3C-like
3CLpro), nucleotidiltransferasa asociada a la ARN polimerasa ARN-dependiente (RdRp) de nidovirus
(NIRAN), RdRp, dominio de unión al zinc (ZBD) y HEL1), el Grupo de Estudio de Coronaviridae del
Comité Internacional de Taxonomía de Virus estimó las distancias patrísticas entre SARS-CoV-2 y
coronavirus conocidos, y asignó SARS-CoV-2 a la especie existente SARSr-CoV". Aunque
filogenéticamente relacionado, el SARS-CoV-2 es distinto de todos los demás coronavirus de
murciélagos y pangolines de esta especie. La proteína S del SARS-CoV-2 tiene un tamaño completo
de 1,273 aminoácidos, más largo que el del SARS-CoV (1,255 aminoácidos) y los SARSr-CoVs de
murciélago conocidos (1,245-1,269 aminoácidos). Remdesivir ha mostrado actividad contra el SARS-
CoV-2 in vitro e in vivo 2136. Un estudio clínico reveló una menor necesidad de soporte de oxígeno
en pacientes con COVID-19. Por lo tanto, el historial de viajes se vuelve importante. Sin embargo, a
medida que se propaga la epidemia, el historial de viajes, los primeros estadios del brote, sólo se
observaron síntomas leves en aquellos pacientes infectados por la transmisión de humano a
humano. Las tendencias iniciales sugerían que la mortalidad asociada con COVID-19 era menor que
la de brotes anteriores de SARS. Los datos disponibles son insuficientes para interpretar a los
pangolines como el huésped intermediario de SARS-CoV-2. No es posible diferenciar clínicamente o
mediante pruebas de laboratorio rutinarias COVID-19 de estas infecciones. Para abordar este tema
altamente controvertido, se necesitan investigaciones retrospectivas adicionales que involucren un
mayor número de muestras almacenadas de pacientes, animales y entornos, con ensayos bien
validados.

Genómica, Filogenia y Taxonomía:

Como un nuevo betacoronavirus, el SARS-CoV-2 comparte un 79% de identidad de secuencia

genómica con el SARS-CoV y un 50% con el MERS-CoV. Su organización genómica se comparte con
otros betacoronavirus. Se han identificado múltiples virus relacionados con el SARS-CoV-2 en tejidos
de pangolines de Malasia que fueron contrabandeados desde el sudeste asiático hacia el sur de
China entre 2017 y 2019. El BoCoV provoca diarrea neonatal en terneros, lo que lleva a diarrea
sanguinolenta (disentería invernal) y enfermedades respiratorias (fiebre del transporte) en ganado
de todas las edades. Un paciente con COVID-19 esparce virus en gotas líquidas durante el habla. El
11 de febrero, el Comité Internacional de Taxonomía de Virus nombró al nuevo coronavirus 'SARS-
CoV-2', y la OMS nombró la enfermedad 'COVID-19'. En ratones transgénicos humanos ACE2
infectados con SARS-CoV-2, se presentó neumonía intersticial típica, y los antígenos virales se
observaron principalmente en las células epiteliales bronquiales, los macrófagos y los epitelios
alveolares. En China, la inhalación de vapor de interferón-alfa se incluye en las pautas de
tratamiento de COVID-19. Se están llevando a cabo ensayos clínicos en todo el mundo para evaluar
la eficacia de diferentes terapias que involucran interferones, ya sea solos o en combinación con
otros agentes.
Terapia con Inmunoglobulinas:

Una opción terapéutica ideal sugerida para el SARS-CoV-2 (COVID-19) es la terapia de combinación
que comprende anticuerpos monoclonales (MAbs) y el medicamento remdesivir (COVID-19). Un
informe preliminar en Japón mostró tasas de mejoría clínica del 73.8% y 87.8% desde el inicio de la
terapia con favilavir en pacientes con COVID-19 leve a los 7 y 14 días, respectivamente, y del 40.1%
y 60.3% en pacientes con COVID-19 grave a los 7 y 14 días, en comparación con las proteínas
correspondientes en el SARS-CoV.

De los cuatro genes estructurales, el SARS-CoV-2 comparte más del 90% de identidad de
aminoácidos con el SARS-CoV excepto por el gen S, que diverge. El gen de la replicasa cubre dos
tercios del genoma 5', y codifica una gran poliproteína (pplab), que se escinde proteolíticamente en
16 proteínas no estructurales que están involucradas en la transcripción y replicación del virus. Se
están desarrollando muchas plataformas de vacunas diferentes contra el SARS-CoV-2, cuyas
estrategias incluyen vectores recombinantes, ADN, ARNm en nanopartículas lipídicas, virus
inactivados, virus vivos atenuados y subunidades proteicas. Los hallazgos de la TC de tórax asociados
con pacientes infectados con COVID-19 incluyen opacidades parcheadas características que luego
progresan a infiltración y posteriormente a opacidades en vidrio esmerilado. El potencial antiviral in
vitro de los medicamentos aprobados por la FDA, es decir, Todos los médicos deben mantenerse
actualizados sobre los desarrollos recientes, incluida la propagación global de la enfermedad. Se
debe evitar viajar internacionalmente si no es esencial en este momento. Las personas deben dejar
de difundir mitos e información falsa sobre la enfermedad e intentar calmar el pánico y la ansiedad
del público

Medicamentos Antivirales:

Varias clases de fármacos antivirales comúnmente utilizados, como oseltamivir (inhibidor de

neuraminidasa), aciclovir, ganciclovir y ribavirina, no tienen ningún efecto sobre el COVID-19 y, por
lo tanto, no se recomiendan. Oseltamivir, un inhibidor de neuraminidasa, ha sido explorado en
hospitales chinos para tratar casos sospechosos de COVID-19, aunque aún falta evidencia
comprobada de eficacia contra el SARS-CoV-2 para este fármaco. Por lo tanto, el conocimiento y la
comprensión del desarrollo de vacunas basadas en la proteína S en el SARS-CoV ayudarán a
identificar posibles candidatos a vacunas basadas en la proteína S en el SARS-CoV-2. Se opina que la
historia de exposición del SARS-CoV-2 en el mercado de mariscos de Wuhan se originó a partir de la
transmisión de humano a humano en lugar de la transmisión de animal a humano; sin embargo,
dada la transferencia zoonótica en el COVID-19, es demasiado pronto para respaldar
completamente esta idea. Se requiere un análisis genético adicional.

Punto de vista sobre la Transmisión, Propagación y Emergencia del SARS-CoV-2:

El nuevo coronavirus fue identificado dentro de 1 mes (28 días) del brote. También se ha informado
de un caso de neumonía grave y disfunción multiorgánica en un niño. Este virus de murciélago
comparte más del 90% de identidad de secuencia con el SARS-CoV-2 en todos los ORFs a lo largo del
genoma, incluidos los altamente variables S y ORF8. Un caso confirmado es un caso sospechoso con
una prueba molecular positiva. El diagnóstico específico se realiza mediante pruebas moleculares
específicas en muestras respiratorias (hisopo de garganta/hisopo nasofaríngeo/esputo/aspirados
endotraqueales y lavados broncoalveolares). Se ha encontrado que el MAb humano específico de
SARS-CoV CR3022 se une al RBD de SARS-CoV-2, lo que indica su potencial como agente terapéutico.
A partir de la experiencia con varios brotes asociados con virus emergentes conocidos, una mayor
patogenicidad de un virus a menudo está asociada con una menor transmisibilidad. Algunos ratones
transgénicos humanos ACE2 incluso murieron después de la infección. En ratones de tipo salvaje, se
generó una cepa adaptada a ratones de SARS-CoV-2 con la alteración N501Y en el RBD de la proteína
S en el paso 6. Aún está por demostrar si la mayor transmisibilidad de SARS-CoV-2 en comparación
con SARS-CoV es una ganancia de función asociada con la adquisición del sitio de escisión similar a
la furina. Una distinción adicional es el gen accesorio orf8 de SARS-CoV-2, que codifica una proteína
novedosa que muestra solo un 40% de identidad de aminoácidos con ORF8 de SARS-CoV. A
diferencia de SARS-CoV, esta nueva proteína ORF8 no contiene un motivo que desencadene vías de
estrés intracelular. Es notable que se ha descubierto una variante de SARS-CoV-2 con una deleción
de 382 nucleótidos que cubre todo ORF8 en varios pacientes en Singapur, que se asemeja a las
deleciones de 29 o 415 nucleótidos en la región ORF8 observadas en variantes humanas de SARS-
CoV de la fase tardía del brote de 2002-2003. Tal deleción de ORF8 puede ser indicativa de una
adaptación humana después de la transmisión entre especies de un huésped animal en Yunnan.
Además, siete ORFs putativos que codifican proteínas accesorias están intercalados entre los genes
estructurales. Hasta el 2 de octubre de 2020, se habían informado 174 candidatos a vacunas para
COVID-19 y 51 estaban en ensayos clínicos en humanos. Por lo tanto, brindan la posibilidad para el
tratamiento y la prevención de COVID-19. Sin embargo, también pueden visualizarse partículas más
pequeñas y mucho más numerosas conocidas como partículas de aerosol, que podrían permanecer
en el aire durante mucho tiempo y luego penetrar profundamente en los pulmones cuando son
inhaladas por otra persona. La transmisión aérea también se observó en los experimentos con
hurones mencionados anteriormente. Es difícil evaluar el potencial terapéutico de un fármaco o una
combinación de fármacos para el manejo de una enfermedad basado en un tamaño de muestra tan
limitado. Los hámsters dorados también mostraron síntomas típicos después de ser infectados con
SARS-CoV-2. Los modelos animales ofrecen información importante para comprender la
patogénesis de la infección por SARS-CoV-2 y la dinámica de transmisión de SARS-CoV-2, y son
importantes para evaluar la eficacia de los tratamientos antivirales y las vacunas.

Características Clínicas y Epidemiológicas:

Parece que todas las edades de la población son susceptibles a la infección por SARS-CoV-2, y la
edad mediana de la infección es de alrededor de 50 años. Sin embargo, las manifestaciones clínicas
difieren según la edad. El coronavirus del síndrome de diarrea aguda porcina se había extendido
masivamente a todas las 34 provincias de China. Los ensayos de entrada de pseudovirus de SARS-
CoV-2 revelaron que TMPRSS2 y la catepsina L tienen efectos acumulativos con furina en la
activación de la entrada del virus. El análisis de la estructura de criomicroscopía electrónica sobre
este virus está evolucionando rápidamente, por lo que se insta a los lectores a actualizarse
regularmente. La estructura de la microscopía crioelectrónica de la proteína S de SARS-CoV-2 reveló
que su RBD está principalmente en estado de reposo, mientras que la proteína S de SARS-CoV asume
estados conformacionales igualmente erguidos y en reposo. Dado que el conocimiento sobre este
virus está evolucionando rápidamente, se insta a los lectores a actualizarse regularmente.
Diagnóstico de SARS-CoV-2 (COVID-19):

Las pruebas de ARN pueden confirmar el diagnóstico de casos de SARS-CoV-2 (COVID-19) con RT-
PCR en tiempo real o secuenciación de próxima generación. Considerando los vínculos zoonóticos
asociados con el SARS-CoV-2, el enfoque de “One Health” puede desempeñar un papel vital en las
medidas de prevención y control que se siguen para contener esta pandemia. Los pacientes con
virus tuvieron pruebas moleculares positivas en pruebas repetidas. La importación sustancial de
casos pre sintomáticos de COVID-19 desde Wuhan han resultado en brotes independientes y
autosuficientes en las principales ciudades tanto dentro del país como en todo el mundo. Sin
embargo, la transmisión comunitaria podría haber ocurrido antes de eso. El IBV, bajo el género
Gamma coronavirus, causa enfermedades del sistema respiratorio, urinario y reproductivo, con
pérdidas económicas sustanciales en pollos. De hecho, las tomografías computarizadas anormales
se han utilizado para diagnosticar COVID-19 en casos sospechosos con diagnóstico molecular
negativo; muchos de estos pacientes tuvieron pruebas moleculares positivas en pruebas repetidas
(22).

Diagnóstico Diferencial [21]:

El diagnóstico diferencial incluye todo tipo de infecciones virales respiratorias [influenza,

parainfluenza, virus respiratorio sincitial (VRS), adenovirus, metapneumovirus humano, coronavirus
no COVID-19), organismos atípicos (Mycoplasma, Chlamydia) e infecciones bacterianas. La
sensibilidad de la tomografía superior4). La mayoría de los pacientes también desarrollaron
linfopenia marcada, similar a lo observado en pacientes con SARS y MERS, y los no sobrevivientes
desarrollaron una linfopenia más severa con el tiempo en comparación con los pacientes no críticos
en UCI, los pacientes en UCI tuvieron interacciones más altas que permanecen en gran medida poco
claras. Pronto, este bloqueo fue de citocinas plasmáticas, lo que sugiere un proceso
inmunopatológico causado por una tormenta de citocinas 86857. En esta cohorte de pacientes,
alrededor del 2.3% de las personas murieron en un tiempo medio de 16 días desde el inicio de la e.
Los hombres mayores de 68 años tuvieron un mayor riesgo de insuficiencia respiratoria, lesión
cardiaca aguda e insuficiencia cardíaca que llevó a la muerte, independientemente e antecedentes
de enfermedad cardiovascular (FIG. 36)La alta similitud genética entre el SARS-CoV-2 y el RaTG13
respalda la hipótesis de que el SARS-CoV-2 probablemente se originó en murciélagos5.

En general, los hombres mayores de 60 años con comorbilidades tienen más probabilidades de
desarrollar enfermedades respiratorias graves que requieren hospitalización. Esto difiere de lo
observado en el SARS-CoV en los cinco residuos críticos para la unión al ACE2, a saber, Y455L, L486F,
N493Q, D494S y T501NS" (FIG). Dado que algunos de los primeros casos reportados en Wuhan no
tenían vínculo epidemiológico con el mercado de mariscos, se ha sugerido que el mercado puede
no ser la fuente inicial de infección humana con el SARS-CoV-2. Un estudio de Francia detectó SARS-
CoV-2 por PCR en una muestra almacenada de un paciente que tenía neumonía a finales de 2019,
lo que sugiere que SARS-CoV-2 podría haberse propagado allí mucho antes de la hora de inicio
generalmente conocida del brote en Francia. La mayoría de los pacientes se recuperaron lo
suficiente como para ser dados de alta del hospital en 2 semanas (FIG). El resultado obtenido de un
estudio clínico asociado con humanos y máquinas de cuatro pacientes infectados con COVID-19
afirmó que la terapia combinada utilizando lopinavir/ritonavir, arbidol y cápsulas de Shufeng Jiedu
(medicina tradicional china) resultó ser efectiva en el manejo de la neumonía por COVID-19 (193).
Después de la infección inicial, se ha observado la transmisión de humano a humano con una
estimación preliminar del número de reproducción (Ro) de 1.4 a 2.5 (70, 75), y recientemente se
estima que es de 2.24 a 3.58 (76). Por lo tanto, la posibilidad de que los anticuerpos neutralizantes
específicos del SARS-CoV proporcionen protección cruzada contra el COVID-19 podría ser menor.
Los pacientes de edad avanzada (>60 años) y con enfermedades preexistentes graves tienen un
mayor riesgo de desarrollar síndrome de dificultad respiratoria aguda y muerte (FIG). Los síntomas
menos comunes incluyen producción de esputo, dolor de cabeza, hemoptisis, diarrea, anorexia,
dolor de garganta, dolor en el pecho, escalofríos, náuseas y vómitos en estudios de pacientes en
China. Los trastornos olfativos y del gusto autoinformados también fueron reportados por pacientes
en Italia. Las manifestaciones tempranas de la neumonía por COVID-19 pueden no ser evidentes en
la radiografía de tórax. El secuenciamiento del genoma y la investigación filogenética revelaron que
el coronavirus causante del COVID-19 es un betacoronavirus que pertenece a los mismos subtipos
que el virus del SARS, pero aún existe en un grupo variante. Debido a estas medidas, el número
diario de nuevos casos en China comenzó a disminuir constantemente. Sin embargo, a pesar de la
tendencia decreciente en China, la propagación internacional del COVID-19 se aceleró a fines de
febrero. Tal sitio de escisión $1-$2 no se observa en todos los virus relacionados que pertenecen al
subgénero Sarbecovirus, excepto por una inserción similar de tres aminoácidos (PAA) en RmYN02,
un coronavirus derivado de murciélagos recientemente reportado de Rhinolophus malayanus en
China (FIG). En un caso sospechoso en India, la muestra adecuada debe ser enviada a laboratorios
de referencia designados en India o al Instituto Nacional de Virología en Pune. Es distinto de las
proteínas S de la mayoría de los miembros en el subgénero Sarbecovirus, compartiendo similitudes
en la secuencia de aminoácidos del 76.7-77.0% con los SARS-CoV de civetas y humanos, el artículo
ofrece una visión panorámica sobre este nuevo virus.

Aunque la inserción en RmYN02 no representa funcionalmente un sitio de escisión polibásico, apoya

la idea de que esta característica, inicialmente considerada única en el SARS-CoV-2, ha sido
adquirida de forma natural. Los ensayos de inmunohistoquímica detectaron antígeno del SARS-CoV-
2 en la vía respiratoria superior, epitelio bronquiolar y epitelio de glándulas submucosas, así como
en los neumocitos tipo I y tipo II, macrófagos alveolares y membranas hialinas en los pulmones. Los
modelos animales utilizados para estudiar la patogénesis de la infección por SARS-CoV-2 incluyen
primates no humanos (macacos rhesus, monos cínomolgos, marmosetas y monos verdes africanos),
ratones (ratones silvestres con virus adaptado a ratones y ratones transgénicos con ACE2 humano
o con inserción de ACE2 humano), hurones y hámsters dorados. En los modelos animales de
primates no humanos, la mayoría de las especies muestran características clínicas similares a las de
los pacientes con COVID-19, incluyendo la eliminación viral, la replicación viral y las respuestas del
huésped a la infección por SARS-CoV-2. Por ejemplo, en el modelo de macaco rhesus, se detectaron
cargas virales altas en la vía respiratoria superior y en 216 países y regiones de los seis continentes
habían reportado más de 20 millones de casos de COVID-19, y más de 733,000 pacientes habían
muerto. Se mostró inflamación exudativa también en algunos casos. El número de casos
confirmados aumentó repentinamente, con miles de nuevos casos diagnosticados diariamente a
finales de enero. Los genes estimulados por interferón pueden obstaculizar cada paso de la
replicación viral. Los hurones infectados con SARS-CoV-2 pueden arrojar evidencia de transmisión
local persistente o contacto con pacientes con historial de viaje similar o aquellos con infección
confirmada por COVID-19. Las anormalidades en la imagen de la tomografía computarizada de tórax
asociadas con la neumonía por COVID-19 también se han observado incluso en pacientes
asintomáticos. La ocurrencia de infecciones por COVID-19 en varios cruceros nos dio una idea
preliminar sobre el patrón de transmisión de la enfermedad. Los cruceros actúan como entornos
cerrados y proporcionan un escenario ideal para la ocurrencia de brotes respiratorios. Esta situación
representa una amenaza significativa para los viajeros, ya que hay personas de diferentes países a
bordo, lo que favorece la introducción del patógeno. Solo el tiempo dirá cómo impactará el virus en
nuestras vidas aquí en India. Recientemente se ha informado de otro coronavirus relacionado en un
murciélago Rhinolophus malayanus muestreado en Yunnan. Este nuevo virus ha sido denominado
'RmYN02'. Del mismo modo, los casos neonatales reportados hasta ahora han sido leves (20).

Diagnóstico:

Un caso sospechoso se define como aquel con fiebre, dolor de garganta y tos que tiene
antecedentes de viaje a China u otras áreas de transmisión local persistente o contacto con
pacientes con historial de viaje similar o aquellos con infección confirmada. Una considerable
protección en ratones contra un desafío letal con MERS-CoV. Se encontró neumonía intersticial y
respuestas inflamatorias en ratones jóvenes y de edad avanzada después de la infección con la cepa
adaptada a ratones. Para controlar el COVID-19, China implementó medidas de salud pública sin
precedentes. El RBD de la subunidad S1 de la proteína S tiene una capacidad superior para inducir
anticuerpos neutralizantes. La rápida replicación de SARS-CoV-2 en los pulmones puede
desencadenar una fuerte respuesta inmune. También es anormal en pacientes
asintomáticos/pacientes sin evidencia clínica de afectación del tracto respiratorio inferior. Es
importante destacar que la mayoría de la transmisión de humano a humano de SARS-CoV-2 en China
ocurrió tempranamente en grupos familiares, y en otros países también se produjeron grandes
brotes en otro tipo de entornos, como comunidades de trabajadores migrantes, mataderos y
plantas de procesamiento de carne, lo que indica la necesidad de aislar a las personas infectadas. La
transmisión nosocomial no fue la principal fuente de transmisión en China debido a la
implementación de medidas de control de infecciones en entornos clínicos. Los datos de
secuenciación de ARN de células individuales mostraron que TMPRSS2 está altamente expresado
en varios tejidos y sitios del cuerpo y se presenta con ACE2 en las células epiteliales nasales,
pulmones y ramas bronquiales, lo que explica parte del tropismo tisular de SARS-CoV-2 (REFS563).
También es la primera opción aprobada por la Unión Europea para el tratamiento de adultos y
adolescentes con neumonía que requiere oxígeno suplementario. Varios ensayos clínicos
internacionales de fase III continúan evaluando la seguridad y eficacia de remdesivir para el
tratamiento de COVID-19. Favilavir (T-705), que es un medicamento antiviral desarrollado en Japón
para tratar la influenza, ha sido aprobado en China, Rusia e India para el tratamiento de COVID-19.
Un estudio clínico en China mostró que favilavir redujo significativamente los signos de mejora de
la enfermedad en la imagen de tórax y acortó el tiempo hasta la eliminación viral. Tales anticuerpos
pueden desempeñar un papel crucial en la mejora de las respuestas humorales protectoras contra
los CoVs emergentes al apuntar a epítopos y funciones apropiadas de la proteína S. La capacidad de
neutralización cruzada de los MAb neutralizantes específicos de RBD de SARS-CoV depende
considerablemente de la similitud entre sus RBD; por lo tanto, los MAb específicos de RBD de SARS-
CoV pueden reconocerse mediante un análisis relativo del RBD de SARS-CoV-2 en comparación con
el de SARS-CoV y neutralizar cruzadamente SARS-CoV, pero no inducir síntomas clínicos graves.
Como se observó la transmisión por contacto directo y por aire en hurones y hámsters infectados,
dichos animales podrían utilizarse para modelar diferentes modos de transmisión de COVID-19
(REFS7-7). La primera instancia de esto ocurrió en 2002-2003, cuando una o incluso varios mueren,
mientras que la mayoría de las personas jóvenes y niños solo tienen enfermedades leves (no
neumonía o neumonía leve) o son asintomáticos (81.3) Es importante destacar que el riesgo de
enfermedad no fue mayor para las mujeres embarazadas. Sin embargo, los casos pueden ser
asintomáticos o incluso sin fiebre. Notablemente, el RBD de los coronavirus de pangolín de
Guangdong es altamente similar al de SARS-CoV-2. Hallazgos preliminares han sugerido una mejoría
en el estado clínico después del tratamiento. La FDA ha proporcionado orientación para el uso de
plasma de convalecientes de COVID-19 bajo una solicitud de un nuevo medicamento de
investigación de emergencia. Según la Comisión Nacional de Salud de China, el número total de
casos continuó aumentando bruscamente a principios de febrero a un ritmo promedio de más de
3,000 casos recién confirmados por día. Datos obtenidos de países como China, Japón, Tailandia