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BIOMOLECULAS

   AMINOACIDOS
AMINOACIDOS
•    Componentes estructurales de las
     proteínas
•    Cientos de aminoácidos naturales

•    contienen (estructura general):
     Átomo de carbono central al que
     están unidos:
a)   Un grupo amino; R—NH2

b)   Un grupo carboxilo: R---COOH
c)   Un grupo R :
•    Un átomo de hidrogeno
•    Grupo hidrocarbonado ( isopropilo)
•    Derivado hidocarbonado
     (hidroximetileno)
d)   Un átomo de hidrogeno
AMINOACIDOS
               CLASIFICACION
•    De acuerdo con la posición del grupo amino
     con referencia al grupo carboxilo:

A.   Alfa
B.   Beta
C.   gamma
AMINOACIDOS ALFA
   Clase mas frecuente
   El grupo amino esta unido al
    átomo de carbono ( carbono
    alfa), inmediatamente
    adyacente al grupo carboxilo

   Unido al carbono central alfa
    esta otro grupo , cadena
    lateral o grupo R
    (propiedades químicas;
    hidrófobas o hidrófilas,
    interacción de grupos R;
    función biológica)
AMINOACIDOS
   Aminoácidos beta ;
•   El grupo amino esta unido al
    carbono segundo a partir del
    grupo carboxilo



   Aminoácido gamma:
•   El grupo amino esta unido al
    carbono tercero a partir del
    grupo carboxilo
AMINOACIDOS
       Bloque de construcción de las
        proteínas
       Su secuencia determina la
        configuración tridimensional
        final de la proteína
       Moléculas anfóteras; pueden
        actuar como ácido o como base

     Clasificación:

1.      Aminoácidos estándar
2.      Aminoácidos no estándar
       Modificación química
       No se encuentran en proteínas
AMINOACIDOS
•   20 aminoácidos alfa que se
    encuentran habitualmente en
    las proteínas

•   Tienen la misma estructura
    general con excepción de la
    prolina ( grupo amino
    secundario, formada por un
    cierre de anillo entre el grupo
    R y el nitrógeno amida)
AMINOACIDOS ESTANDAR
                 CLASIFICACION
    De acuerdo con su capacidad para
     interaccionar con el agua ( cuatro clases) :

1.   Aminoácidos neutros apolares
2.   Aminoácidos neutros polares
3.   Aminoácidos ácidos
4.   Aminoácidos básicos
AMINOACIDOS ESTANDAR
                     NEUTROS APOLARES
    Contienen grupos R hidrocarbonados
    Los grupos R no tienen carga positiva o
     negativa                                    1.  Glicina
    Hidrófobos : interaccionan poco con el      2. Alanina
     agua
    Importantes para el mantenimiento de la     3. Valina
     estructura tridimencional
                                                 4. Leucina
o    Tipos de cadenas hidrocarbonadas:           5. Isoleucina

1.   Aromáticos : estructura ciclicas(benceno)   6. Fenilalanina
                                                 7. Tiptofano
                    hidrocarburos insaturados
2.   Alifáticos: no aromáticos (metano,          8. Metionina
                 ciclohexano )                   9. Cisteina
                 cadenas laterales ( átomos de
                 azufre)                         10. prolina
                 grupo sulfhidrilo ( -SH)
AMINOACIDOS NEUTROS POLARES
   AROMATICOS Y ALIFATICOS
AMINOACIDOS NEUTROS
              POLARES
•     Poseen grupos funcionales capaces
      de formar enlaces de hidrogeno
•     Interaccionan fácilmente con el agua       Serina
•     Hidrófilos o amantes del agua

     Presencia del grupo OH:                     Treonina
a.    Participa en enlaces hidrogeno
      ( estabilidad de estructura proteica)
b.    Formación del Ester fosfato de
      tirosina
                                                 Tirosina
c.    Puntos de unión de hidratos de
      carbono ( serina y treonina)
                                                 Asparagina
     Presencia de un grupo amida ( muy
     polar)
     enlaces hidrogeno no dan estabilidad        glutamina
AMINOACIDOS HIDROFILOS O AMANTES DEL AGUA
              (GRUPOS –OH, R-C-NH2)

    Grupo –OH




    Grupo R-C-NH2
•    Derivados amida de los
     aminoácidos ácidos:
      ácido aspartico
      ácido glutámico
AMINOACIDOS ACIDOS
   Poseen cadenas laterales
    con grupos carboxilato
   Cadenas laterales
    cargadas negativamente a
    PH fisiológico

   Ácido aspartico ;
    aspartato
   Ácido glutámico;
    glutamato
AMINOACIDOS BASICOS
   A PH fisiológico llevan una carga
    positiva
   Pueden formar enlaces iónicos con los
    aminoácidos ácidos
    La lisina:
o   Grupo amino en la cadena lateral,
o   Acepta un protón del agua para el
    ácido conjugado (-NH3+)
o   Oxidación ; enlaces Inter. e
    intramoleculares
    La arginina:
o   Grupo guanidino;
o   No actúa en reacciones ácido- base
    Histidina:
o   Base débil, actividad catalítica de
    enzimas
AMINOACIDOS ESENCIALES
   En la naturaleza 300 aminoácidos       1.   Fenilalanina
    diferentes
                                           2.   Leucina
   Los seres vivos 20 aminoácidos         3.   Isoleucina
    para sintetizar proteínas              4.   Metionina
                                           5.   Lisina
   9 son esenciales para el ser humano
    (debido a que sus cadenas laterales    6.   Treonina
    o aromáticas no pueden ser             7.   Valina
    sintetizadas por el ser humano, o la
    secuencia de átomos de azufre o        8.   Triptofano
    grupos amino dentro de la cadena       9.   histidina
    de átomos de carbono que los
    forman
AMINOACIDOS
                  FUNCIONES
            (ACTIVIDAD BIOLOGICA)

1.   Su secuencia determina la configuración
     tridimensional final de cada proteína ( mas
     importante
2.   Mensajeros químicos ( aminoácidos alfa)
3.   Precursores de diversas moléculas complejas
     que contienen nitrógeno
4.   Intermediarios metabólicos
AMINOACIDO
             ACTIVIDAD BIOLOGICA
            MENSAJEROS QUIMICOS
    Aminoácidos alfa o derivados :

1.   Glicina
2.   El ácido gamma- amino butírico (GABA), derivado
     de la glutamina
3.   Serótina
4.   Melatonina( derivado del triptofano)
5.   Tiroxina ( derivado de la tirosina)
6.   Ácido indol acético ( derivado del triptofano: plantas)
AMINOACIDOS
       ACTIVIDAD BIOLOGICA
PRECURSORES DE MOLECULAS COMPLEJAS


   Las bases nitrogenadas; componentes de los
    nucleótidos y ácidos nucleicos
   El hemo
   clorofila
AMMINOACIDOS
           ACTIVIDAD BIOLOGICA
       INTERMEDIARIOS METABOLICOS


     Ciclo de la urea (mecanismo de eliminación de
     desechos nitrogenados):

1.   Arginina
2.   Citrulina
3.   Ornitina
AMINOACIDOS MODIFICADOS DE LAS
             PROTEINAS
•   Residuos de aminoácidos se forman tras la síntesis de la
    cadena polipeptídica:

   Ácido gamma – carboxiglutamico: une el calcio de la
    protombina
   4 hidroxiprolina y la 5 – hidroxiprolina: componente
    mas importante del colageno ( proteina mas abundante
    del tejido conjuntivo)
   Fosforilación de aminoácidos con grupos OH: enzima
    glucógeno sintetaza
AMINOACIDOS
       MOLECULAS ASIMETRICAS O QUIRALES

    Carbonos asimétricos o quírales:
     los carbonos alfa de 19 de los 20 aminoácidos
     estándar; unidos a 4 grupos diferentes ( hidrogeno,
     amino, carboxilo y R )

    Moléculas que pueden existir como:

A.   Esteroisómeros
B.   Enantiomeros
AMINOACIDOS
      MOLECULAS ASIMETRICAS
   Esteroisómeros;
•   Moléculas que solo se
    diferencian en la disposición
    espacial de sus átomos

   Enantiomeros:
•   Imágenes especulares una de
    otra
•   Se diferencian por la posición
    del grupo amino y del átomo
    de hidrogeno
AMINOACIDOS
                  ENANTIOMEROS
    Propiedades físicas idénticas
    Isomeros ópticos:
                    desvían la
     dirección de la luz polarizada
     plana en direcciones opuestas
A.   D gliceraldehido dextrógiro (+):
     desvía la luz en el sentido de las
     agujas del reloj
B.   L gliceraldehido levógiro (-)
     desvía la luz en sentido opuesto

     En las proteínas solo se
     encuentran los aminoácidos L
AMINOACIDOS
                                 TITULACION
    Los aminoácidos contienen grupos
     ionizables
    La forma iónica de estas moléculas en
     disolución depende del PH

a)   Efecto del PH sobre la estructura del
     aminoácido
b)   Determina la reactividad de las cadenas
     laterales del aminoácido

     Punto isoeléctrico: al PH donde un
     aminoácido no tiene carga neta y es
     eléctricamente neutra, en este punto son
     memos solubles

     Las moléculas neutras que llevan un
     numero igual de cargas positivas y
     negativas se les denomina;zwitteriones
AMINOACIDOS
              REACCIONES
    Las reacciones que pueden experimentar los
     aminoácidos son determinadas por sus grupos
     funcionales:

A.   Formación de enlaces peptídicos
B.   Formación de puentes disulfuro
AMINOACIDOS
                       REACCIONES
              FORMACION DE ENLACES PEPTICOS
   Enlaces peptídicos: son enlaces amida,
    que se forman cuando el par de
    electrones sin compartir del átomo de
    nitrógeno alfa-amino de un aminoácido
    ataca al carbono alfa- carboxilo de otro
    aminoácido en una reacción de
    sustitución núcleofila
    La reacción elimina una molécula de
    agua ( deshidratación)

   Residuos de aminoácidos: los
    aminoácidos unidos
   Residuo N-Terminal: el residuo de
    aminoácido con el grupo amino libre
    ( se escribe a la izquierda)
   Residuo C-Terminal: el residuo de
    aminoácido con el grupo carboxilo
    libre( aparece a la derecha)
AMINOACIDOS REACCIONES
      ENLACES PEPTIDICOS
   Los polipéptidos:
o   polímeros lineales formados
    por aminoácidos unidos
    por enlaces peptídicos        H2N-Tyr-Ala-Cys-Gly-COOH
   Dipéptido: la unión de dos
    moléculas de aminoácido
   El prefijo revela el numero de Tirosilalanilcisteinilglicina
    residuos
   Los péptidos se nombran
    utilizando su secuencia de
    aminoácidos iniciando por su
    residuo N-Terminal
POLIPETIDOS
               ENLACE PEPTIDICO
•   Estructura tridimensional bien
    definida
•   Conformación nativa de la
    molécula ( orden o secuencia de
    aminoácidos)
•   Se pliegan en una única forma
    biológicamente activa
•   Carácter rígido del enlace peptídico
    ( limita el numero de posibilidades
    conformacionales)
•   Los enlaces peptídicos tienen un
    carácter parcial de doble enlace
    ( híbridos de resonancia)
AMINOACIDOS
                      REACCIONES
                OXIDACION DE LA CISTEINA
o   El grupo sulfhídrico de la
    cisteina es muy reactivo
o   La reacción mas común es de
    oxidación reversible que
    forma un puente disulfuro
o   Puente de disulfuro: cuando
    dos residuos de cisteina
    forman un enlace disulfuro
o   Los puentes disulfuro ayudan
    a estabilizar muchos
    polipéptidos y proteínas
PEPTIDOS
   Polipéptidos cortos con una longitud inferior a 50
    aminoácidos

   Moléculas señalizadoras que utilizan organismos
    multicelulares para regular actividades complejas

   Coordinación de procesos bioquímicas

   Interrelación dinámica entre procesos opuestos
PEPTIDOS
   Protección de células de los         Glutation
    radicales libres
   Regulación de la ingestión de
    alimentos y peso corporal
•   Estimuladores del apetito            Neuropeptido Y, galanina
•   Inhibidores del apetito              Colocistocinina
                                         Hormona estimulante de melanocitos
•   Disminución de la expresión de       Leptina
    genes
                                         Vasopresina (antidiurética)
   Regulación de la presión sanguínea
                                         Factor natri urético atrial
   Estimulo de leche y contracción
    uterina                              oxitócica
   Alivian el dolor, placenteras        Pépticos opiáceos ( encefálinas)
   Percepción del dolor                 Sustancia P y bradiquinina

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  • 1. BIOMOLECULAS AMINOACIDOS
  • 2. AMINOACIDOS • Componentes estructurales de las proteínas • Cientos de aminoácidos naturales • contienen (estructura general): Átomo de carbono central al que están unidos: a) Un grupo amino; R—NH2 b) Un grupo carboxilo: R---COOH c) Un grupo R : • Un átomo de hidrogeno • Grupo hidrocarbonado ( isopropilo) • Derivado hidocarbonado (hidroximetileno) d) Un átomo de hidrogeno
  • 3. AMINOACIDOS CLASIFICACION • De acuerdo con la posición del grupo amino con referencia al grupo carboxilo: A. Alfa B. Beta C. gamma
  • 4. AMINOACIDOS ALFA  Clase mas frecuente  El grupo amino esta unido al átomo de carbono ( carbono alfa), inmediatamente adyacente al grupo carboxilo  Unido al carbono central alfa esta otro grupo , cadena lateral o grupo R (propiedades químicas; hidrófobas o hidrófilas, interacción de grupos R; función biológica)
  • 5. AMINOACIDOS  Aminoácidos beta ; • El grupo amino esta unido al carbono segundo a partir del grupo carboxilo  Aminoácido gamma: • El grupo amino esta unido al carbono tercero a partir del grupo carboxilo
  • 6. AMINOACIDOS  Bloque de construcción de las proteínas  Su secuencia determina la configuración tridimensional final de la proteína  Moléculas anfóteras; pueden actuar como ácido o como base Clasificación: 1. Aminoácidos estándar 2. Aminoácidos no estándar  Modificación química  No se encuentran en proteínas
  • 7. AMINOACIDOS • 20 aminoácidos alfa que se encuentran habitualmente en las proteínas • Tienen la misma estructura general con excepción de la prolina ( grupo amino secundario, formada por un cierre de anillo entre el grupo R y el nitrógeno amida)
  • 8. AMINOACIDOS ESTANDAR CLASIFICACION  De acuerdo con su capacidad para interaccionar con el agua ( cuatro clases) : 1. Aminoácidos neutros apolares 2. Aminoácidos neutros polares 3. Aminoácidos ácidos 4. Aminoácidos básicos
  • 9. AMINOACIDOS ESTANDAR NEUTROS APOLARES  Contienen grupos R hidrocarbonados  Los grupos R no tienen carga positiva o negativa 1. Glicina  Hidrófobos : interaccionan poco con el 2. Alanina agua  Importantes para el mantenimiento de la 3. Valina estructura tridimencional 4. Leucina o Tipos de cadenas hidrocarbonadas: 5. Isoleucina 1. Aromáticos : estructura ciclicas(benceno) 6. Fenilalanina 7. Tiptofano hidrocarburos insaturados 2. Alifáticos: no aromáticos (metano, 8. Metionina ciclohexano ) 9. Cisteina cadenas laterales ( átomos de azufre) 10. prolina grupo sulfhidrilo ( -SH)
  • 10. AMINOACIDOS NEUTROS POLARES AROMATICOS Y ALIFATICOS
  • 11. AMINOACIDOS NEUTROS POLARES • Poseen grupos funcionales capaces de formar enlaces de hidrogeno • Interaccionan fácilmente con el agua  Serina • Hidrófilos o amantes del agua Presencia del grupo OH:  Treonina a. Participa en enlaces hidrogeno ( estabilidad de estructura proteica) b. Formación del Ester fosfato de tirosina  Tirosina c. Puntos de unión de hidratos de carbono ( serina y treonina)  Asparagina Presencia de un grupo amida ( muy polar) enlaces hidrogeno no dan estabilidad  glutamina
  • 12. AMINOACIDOS HIDROFILOS O AMANTES DEL AGUA (GRUPOS –OH, R-C-NH2)  Grupo –OH  Grupo R-C-NH2 • Derivados amida de los aminoácidos ácidos: ácido aspartico ácido glutámico
  • 13. AMINOACIDOS ACIDOS  Poseen cadenas laterales con grupos carboxilato  Cadenas laterales cargadas negativamente a PH fisiológico  Ácido aspartico ; aspartato  Ácido glutámico; glutamato
  • 14. AMINOACIDOS BASICOS  A PH fisiológico llevan una carga positiva  Pueden formar enlaces iónicos con los aminoácidos ácidos La lisina: o Grupo amino en la cadena lateral, o Acepta un protón del agua para el ácido conjugado (-NH3+) o Oxidación ; enlaces Inter. e intramoleculares La arginina: o Grupo guanidino; o No actúa en reacciones ácido- base Histidina: o Base débil, actividad catalítica de enzimas
  • 15. AMINOACIDOS ESENCIALES  En la naturaleza 300 aminoácidos 1. Fenilalanina diferentes 2. Leucina  Los seres vivos 20 aminoácidos 3. Isoleucina para sintetizar proteínas 4. Metionina 5. Lisina  9 son esenciales para el ser humano (debido a que sus cadenas laterales 6. Treonina o aromáticas no pueden ser 7. Valina sintetizadas por el ser humano, o la secuencia de átomos de azufre o 8. Triptofano grupos amino dentro de la cadena 9. histidina de átomos de carbono que los forman
  • 16. AMINOACIDOS FUNCIONES (ACTIVIDAD BIOLOGICA) 1. Su secuencia determina la configuración tridimensional final de cada proteína ( mas importante 2. Mensajeros químicos ( aminoácidos alfa) 3. Precursores de diversas moléculas complejas que contienen nitrógeno 4. Intermediarios metabólicos
  • 17. AMINOACIDO ACTIVIDAD BIOLOGICA MENSAJEROS QUIMICOS  Aminoácidos alfa o derivados : 1. Glicina 2. El ácido gamma- amino butírico (GABA), derivado de la glutamina 3. Serótina 4. Melatonina( derivado del triptofano) 5. Tiroxina ( derivado de la tirosina) 6. Ácido indol acético ( derivado del triptofano: plantas)
  • 18. AMINOACIDOS ACTIVIDAD BIOLOGICA PRECURSORES DE MOLECULAS COMPLEJAS  Las bases nitrogenadas; componentes de los nucleótidos y ácidos nucleicos  El hemo  clorofila
  • 19. AMMINOACIDOS ACTIVIDAD BIOLOGICA INTERMEDIARIOS METABOLICOS Ciclo de la urea (mecanismo de eliminación de desechos nitrogenados): 1. Arginina 2. Citrulina 3. Ornitina
  • 20. AMINOACIDOS MODIFICADOS DE LAS PROTEINAS • Residuos de aminoácidos se forman tras la síntesis de la cadena polipeptídica:  Ácido gamma – carboxiglutamico: une el calcio de la protombina  4 hidroxiprolina y la 5 – hidroxiprolina: componente mas importante del colageno ( proteina mas abundante del tejido conjuntivo)  Fosforilación de aminoácidos con grupos OH: enzima glucógeno sintetaza
  • 21. AMINOACIDOS MOLECULAS ASIMETRICAS O QUIRALES  Carbonos asimétricos o quírales: los carbonos alfa de 19 de los 20 aminoácidos estándar; unidos a 4 grupos diferentes ( hidrogeno, amino, carboxilo y R )  Moléculas que pueden existir como: A. Esteroisómeros B. Enantiomeros
  • 22. AMINOACIDOS MOLECULAS ASIMETRICAS  Esteroisómeros; • Moléculas que solo se diferencian en la disposición espacial de sus átomos  Enantiomeros: • Imágenes especulares una de otra • Se diferencian por la posición del grupo amino y del átomo de hidrogeno
  • 23. AMINOACIDOS ENANTIOMEROS  Propiedades físicas idénticas  Isomeros ópticos: desvían la dirección de la luz polarizada plana en direcciones opuestas A. D gliceraldehido dextrógiro (+): desvía la luz en el sentido de las agujas del reloj B. L gliceraldehido levógiro (-) desvía la luz en sentido opuesto En las proteínas solo se encuentran los aminoácidos L
  • 24. AMINOACIDOS TITULACION  Los aminoácidos contienen grupos ionizables  La forma iónica de estas moléculas en disolución depende del PH a) Efecto del PH sobre la estructura del aminoácido b) Determina la reactividad de las cadenas laterales del aminoácido Punto isoeléctrico: al PH donde un aminoácido no tiene carga neta y es eléctricamente neutra, en este punto son memos solubles Las moléculas neutras que llevan un numero igual de cargas positivas y negativas se les denomina;zwitteriones
  • 25. AMINOACIDOS REACCIONES  Las reacciones que pueden experimentar los aminoácidos son determinadas por sus grupos funcionales: A. Formación de enlaces peptídicos B. Formación de puentes disulfuro
  • 26. AMINOACIDOS REACCIONES FORMACION DE ENLACES PEPTICOS  Enlaces peptídicos: son enlaces amida, que se forman cuando el par de electrones sin compartir del átomo de nitrógeno alfa-amino de un aminoácido ataca al carbono alfa- carboxilo de otro aminoácido en una reacción de sustitución núcleofila La reacción elimina una molécula de agua ( deshidratación)  Residuos de aminoácidos: los aminoácidos unidos  Residuo N-Terminal: el residuo de aminoácido con el grupo amino libre ( se escribe a la izquierda)  Residuo C-Terminal: el residuo de aminoácido con el grupo carboxilo libre( aparece a la derecha)
  • 27. AMINOACIDOS REACCIONES ENLACES PEPTIDICOS  Los polipéptidos: o polímeros lineales formados por aminoácidos unidos por enlaces peptídicos H2N-Tyr-Ala-Cys-Gly-COOH  Dipéptido: la unión de dos moléculas de aminoácido  El prefijo revela el numero de Tirosilalanilcisteinilglicina residuos  Los péptidos se nombran utilizando su secuencia de aminoácidos iniciando por su residuo N-Terminal
  • 28. POLIPETIDOS ENLACE PEPTIDICO • Estructura tridimensional bien definida • Conformación nativa de la molécula ( orden o secuencia de aminoácidos) • Se pliegan en una única forma biológicamente activa • Carácter rígido del enlace peptídico ( limita el numero de posibilidades conformacionales) • Los enlaces peptídicos tienen un carácter parcial de doble enlace ( híbridos de resonancia)
  • 29. AMINOACIDOS REACCIONES OXIDACION DE LA CISTEINA o El grupo sulfhídrico de la cisteina es muy reactivo o La reacción mas común es de oxidación reversible que forma un puente disulfuro o Puente de disulfuro: cuando dos residuos de cisteina forman un enlace disulfuro o Los puentes disulfuro ayudan a estabilizar muchos polipéptidos y proteínas
  • 30. PEPTIDOS  Polipéptidos cortos con una longitud inferior a 50 aminoácidos  Moléculas señalizadoras que utilizan organismos multicelulares para regular actividades complejas  Coordinación de procesos bioquímicas  Interrelación dinámica entre procesos opuestos
  • 31. PEPTIDOS  Protección de células de los Glutation radicales libres  Regulación de la ingestión de alimentos y peso corporal • Estimuladores del apetito Neuropeptido Y, galanina • Inhibidores del apetito Colocistocinina Hormona estimulante de melanocitos • Disminución de la expresión de Leptina genes Vasopresina (antidiurética)  Regulación de la presión sanguínea Factor natri urético atrial  Estimulo de leche y contracción uterina oxitócica  Alivian el dolor, placenteras Pépticos opiáceos ( encefálinas)  Percepción del dolor Sustancia P y bradiquinina