La biotecnología ambiental utiliza microorganismos y plantas para limpiar el medio ambiente contaminado. Un ejemplo es la biorremediación, que usa bacterias, hongos y algas para degradar contaminantes orgánicos en suelos y aguas. Esto es más barato que otros métodos y destruye los contaminantes, aunque requiere más tiempo. La biorremediación se aplica comúnmente para limpiar derrames de petróleo.