La Central de Equipos y Esterilización (CEYE) se encarga de obtener, preparar, esterilizar y distribuir el material médico-quirúrgico de manera continua. La CEYE cuenta con áreas roja, azul y verde para recepción, selección y almacenamiento de materiales respectivamente. Realiza esterilización por vapor, gas-plasma de peróxido de hidrógeno, óxido de etileno y radiaciones para esterilizar diversos materiales de forma segura.