Este documento describe las diferencias entre metabolitos primarios y secundarios en plantas. Los metabolitos primarios son indispensables para el desarrollo de la planta y incluyen carbohidratos, proteínas y lípidos. Los metabolitos secundarios se derivan de los primarios y tienen distribuciones más limitadas, aunque algunos juegan roles ecológicos importantes como pigmentos que atraen polinizadores o compuestos que protegen a la planta.