Entamoeba hartmanni es un parásito protozoario que se encuentra de forma no patógena en el intestino grueso humano. Se diferencia de E. histolytica principalmente por su menor tamaño. Aunque inicialmente se consideró una variedad de E. histolytica, hoy se reconoce como una especie distinta. Generalmente no causa enfermedad y su presencia indica contaminación fecal.