Introduction

Biochimie métabolique

Pr. Dominique Delmas

Centre de Recherche Inserm UMR U866 « Lipides, Nutrition, Cancers »

Equipe « Cancer et réponse immunitaire adaptative »
« Bioactive Molecules and Health »
Les végétaux sont capables d'oxyder une grande variété de composés (glucides, protéines et
[email protected] lipides), mais l'essentiel de la respiration des végétaux s'effectue à partir d'oses simples.

Site web: http://inserm-u866.u-bourgogne.fr/01-them.php

Introduction Introduction

Signatures métabolique et régulatrice des diabètes de type 2 Signatures métabolique et régulatrice des diabètes de type 2

 Modification du micro‐environnement tumorale

<‐> métabolisme tumorale altéré
 Production de lactate entrainant l’acidification
du micro‐environnement tumoral
 Production médiateurs/précurseurs nécessaires
pour la prolifération
Glucose

Lactate Glucose SCD1

Palmitate
AG‐CoA
mGPAT
Produits intermédiaires NADP 1‐Lyso‐PA
FASN AGPAT
NADPH
PA
Malonyl‐CoA Lipin
Lactate Pyruvate DAG
ACC
ACL PC/PE/TG
Acetyl‐CoA Citrate Acetyl‐CoA

(Icard & Lincet, 2013; Warburg et al., 1927; Sedlakova et al., 2011;
(From Zelezniak et al, PLOS 2010) Sutphen et al., 2004)
Introduction Introduction
Metabolic engineering

Signatures métabolique et régulatrice des diabètes de type 2

(From Vander Heiden & DeBerardinis, Cell 2017)

Introduction Introduction
Metabolic engineering – Microbial cell factories Metabolic engineering – Microbial cell factories
A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP
1. Contexte général 1. Contexte général

Digestion & Absorption Digestion & Absorption

Catabolisme Catabolisme

A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP
1. Contexte général Seule la cellule hépatique est capable d’effectuer toutes les 1. Contexte général
voies métaboliques

Digestion & Absorption Digestion & Absorption

Catabolisme Catabolisme

2 2

12
A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP
1. Contexte général 1. Contexte général

Les équivalents réduits NADH et FADH2

cèdent toujours leurs électrons à la chaîne Digestion & Absorption

respiratoire qui les transfère à l’oxygène et

permet simultanément la formation de l’ATP

Catabolisme

Biosynthèse

13
L'acétyl-CoA est produit seulement dans les mitochondries

A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP
1. Contexte général 1. Contexte général

16
A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP
1. Contexte général 1. Contexte général

β-Mercapto-
ethylamine

17 18
Acétyl-Coenzyme A

A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP
1. Contexte général 1. Contexte général

Acétyl-Coenzyme A Acétyl-Coenzyme A

Acide Acide
Acétate Acétyl- Acétate Acétyl-
acétique acétique

19 20
A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP
1. Contexte général 1. Contexte général
1.1. Origine de l’acétyl-CoA
a) Le catabolisme

Catabolisme des glucides : pyruvate

Catabolisme des AG : acyl-CoA

Catabolisme des AA cétogènes : AA
Acétyl-Coenzyme A
ou pyruvate

Acide Liaison thioester

Acétate Acétyl-
acétique riche en énergie

21 22

A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP
1. Contexte général 1. Contexte général
1.1. Origine de l’acétyl-CoA 1.1. Origine de l’acétyl-CoA
a) Le catabolisme des glucides: la pyruvate déshydrogénase ou PDH b) La beta-oxydation

CoA-SH CO2

23 24
A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP
1. Contexte général 1. Contexte général
1.1. Origine de l’acétyl-CoA 1.2. Devenir de l’acétyl-CoA
c) Catabolisme des Amino-Acides ou AA a) Dégradation de l’acétyl-CoA

• L’alanine, la sérine, la glycine, la thréonine et la cystéine

donnent du pyruvate qui peut servir à la néoglucogenèse

ou à la formation d'acétyl-CoA ;

• Le tryptophane est dégradé en pyruvate et acétyl-CoA ;

• La méthionine donne du pyruvate et du succinyl-CoA ;

• La phénylalanine et la tyrosine sont dégradées en

fumarate et acétyl-CoA ;

• L’isoleucine donne du succinyl-CoA et de l’acétyl-CoA ;

• L’aspartate et l’asparagine donnent de l’oxaloacétate ;

• Seules la lysine et la leucine sont purement cétogènes et

donnent exclusivement de l’acétyl-CoA.

25

A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP
1. Contexte général 1. Contexte général
1.2. Devenir de l’acétyl-CoA 1.2. Devenir de l’acétyl-CoA
b) Biosynthèse des Acides Gras c) Biosynthèse du cholestérol
A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP
1. Contexte général 1. Contexte général
1.2. Devenir de l’acétyl-CoA
d) Biosynthèse des corps cétoniques

Digestion & Absorption Alcool

Catabolisme

30

A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP
2. Rappel des 2 voies principales du métabolisme des glucides CM Mme Rosnoblet 2. Rappel des 2 voies principales du métabolisme des glucides CM Mme Rosnoblet
a) Le catabolisme des sucres

Digestion & Absorption Catabolisme: ensemble des réactions enzymatiques de

dégradation de macromolécules en molécules de faible
taille.

Catabolisme
A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP
2. Rappel des 2 voies principales du métabolisme des glucides CM Mme Rosnoblet 2. Rappel des 2 voies principales du métabolisme des glucides CM Mme Rosnoblet
a) Le catabolisme des sucres a) Le catabolisme des sucres

Catabolisme: ensemble des réactions enzymatiques de Catabolisme: ensemble des réactions enzymatiques de
dégradation de macromolécules en molécules de faible dégradation de macromolécules en molécules de faible
taille. taille.
Ces réactions s'effectuent avec une libération d'énergie Ces réactions s'effectuent avec une libération d'énergie
libre dont une partie est stockée sous forme d'ATP et de libre dont une partie est stockée sous forme d'ATP et de
transporteurs d'électrons réduits que sont NAD(P)H et transporteurs d'électrons réduits que sont NAD(P)H et
FADH2. FADH2.
Les voies cataboliques aboutissent, après oxydation
complète, à des produits terminaux communs tels que
CO2et H2O et conduisent à la synthèse d'ATP.

A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP
2. Rappel des 2 voies principales du métabolisme des glucides CM Mme Rosnoblet 2. Rappel des 2 voies principales du métabolisme des glucides CM Mme Rosnoblet
a) Le catabolisme des sucres a) Le catabolisme des sucres
La glycolyse La fermentation lactique
La décarboxylation oxydative
La fermentation alcoolique

Glucose + 2 ADP + 2 Pi + 2 NAD+ -----> 2 pyruvate + 2 ATP + 2 H2O + 2 NADH,H+

A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP
2. Rappel des 2 voies principales du métabolisme des glucides CM Mme Rosnoblet 2. Rappel des 2 voies principales du métabolisme des glucides CM Mme Rosnoblet
b) L’anabolisme des sucres b) L’anabolisme des sucres
La néoglucogenèse

Anabolisme : ensemble des réactions enzymatiques de

biosynthèse de macromolécules ou de leurs précurseurs.
Ces réactions nécessitent un apport d'énergie libre
fournie généralement par l'hydrolyse de l'ATP et/ou par
le pouvoir réducteur du NAD(P)H et du FADH2.

2 pyruvate + 4 ATP + 2 GTP + 2 NADH,H+ + 4 H2O ---------> Glucose + 4 ADP + 2 GDP + 6 Pi + 2 NAD+ + 2 H+

A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP
2. Rappel des 2 voies principales du métabolisme des glucides CM Mme Rosnoblet 3. Le métabolisme des protéines et des amino-acides
b) L’anabolisme des sucres
La voie des pentoses phosphates Vue d’ensemble du métabolisme des protéines et des AA

Environnement Organisme

Biosynthèse Protéines
Protéines du bol
alimentaire
Purines
AA Pyrimidines
Porphyrines

Ammoniac Squelette carboné

Urée

Vert: partie oxydative : série de réactions qui oxydent le glucose-6P, réduisent le NADP+ en NADPH Pyruvate
Acétoacétate Alpha-cétoglutarate
et aboutissent à la formation du ribulose-5-phosphate Succinyl-CoA Cycle de Krebs
Violet: partie non oxydative : réactions réversibles d'isomérisation et d'épimérisation Acétyl-CoA Fumarate
Oxaloacétate
Jaune: partie non oxydative : réactions de transcétolisation et de transaldolisation
A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP
3. Le métabolisme des protéines et des amino-acides 3. Le métabolisme des protéines et des amino-acides

Digestion & Absorption

Catabolisme
Les protéines sont constituées de longues chaînes d’AA qui
sont construites au niveau des ribosomes dans le
cytoplasme/RE.
L'information concernant la séquence des AA se trouve dans
l'ADN du noyau ; elle est transmise par l'ARNm du noyau vers
le cytoplasme.

Seuls 20 des AA sont incorporés dans les protéines et sont

désignés comme des AA protéinogènes

A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP
3. Le métabolisme des protéines et des amino-acides 3. Le métabolisme des protéines et des amino-acides

Toutes nos cellules, même les érythrocytes, sont en mesure de synthétiser les protéines.

Elles produisent les protéines dont elles ont besoin pour leur propre fonctionnement, ou

qui sont nécessaires dans le milieu extracellulaire, par exemple les collagènes.
Toutes les protéines sont
dégradées en tripeptides,
dipeptides et AA
Les acides aminés nécessaires à cette synthèse sont retirés du plasma sanguin où leur
Les AA sont absorbés par les
concentration individuelle est relativement constante.
cellules intestinales grâce à un
mécanisme de transport actif
secondaires et sont ensuite
Lorsque des protéines sont dégradées en acides aminés, dont la cellule n'a pas besoin,
libérés dans la circulation
sanguine ceux-ci seront transformés en d'autres acides aminés ou libérés dans la circulation

sanguine.

43 44
A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP
3. Le métabolisme des protéines et des amino-acides 3. Le métabolisme des protéines et des amino-acides

Le foie dispose en abondance d'enzymes

spécialisés dans la transformation des
acides aminés: les aminotransférases

Le foie synthétise également de l'urée à

partir des groupements aminés des acides
aminés dégradés.

Le transport de l'ammoniac (NH3) formé

à partir de la dégradation des acides
aminés à la périphérie, se fait sous forme
de glutamine dans le plasma.
Au cours du jeûne, il y a besoin d'acides aminés dans le foie pour la néoglucogenèse. Les
protéines du muscle sont alors dégradées et les acides aminés ainsi formés sont convertis en
alanine, laquelle est libérée dans la circulation sanguine pour gagner le foie.

45 46

A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP
3. Le métabolisme des protéines et des amino-acides 3. Le métabolisme des protéines et des amino-acides
3.1. Le métabolisme des protéines 3.1. Le métabolisme des protéines
a) Biosynthèse des protéines : l’anabolisme a) Biosynthèse des protéines : l’anabolisme

-Voie cytoplasmique: les protéines qui restent à l’intérieur de la

cellule sont synthétisées jusqu’à la fin sur les ribosomes libres ;

- Voie sécrétoire: les protéines qui sont intégrées dans la

membrane cellulaire ou destinées à l’exportation sont introduites
dans le RE au cours de la synthèse.
- La biosynthèse des protéines s’effectue au niveau des
ribosomes suivant les indications fournies par l’ADN.
- Environ 400 g de protéines sont formés de cette façon par jour.

Peptide
signal
A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP
3. Le métabolisme des protéines et des amino-acides 3. Le métabolisme des protéines et des amino-acides
3.1. Le métabolisme des protéines 3.1. Le métabolisme des protéines
a) Biosynthèse des protéines : l’anabolisme b) Dégradation des protéines: le catabolisme

Protéines à destination intracellulaire :

Les enzymes de dégradation des protéines :
- Protéines pour le cytoplasme ;
Peptidases appartenant à la classe des hydrolases
- Protéines des mitochondries ;
- Protéines pour le noyau ;
- Protéines pour les peroxysomes. Peptidase

Protéines à destination extracellulaire :

- Protéines d'exportation ;
• les enzymes digestifs ;
- Protéines des membranes ; • les peptidases extracellulaires (ayant des fonctions spécifiques) ;
- Protéines pour le RE et le Golgi; • les peptidases intracellulaires (par exemple, dans les lysosomes).

- Protéines des lysosomes.

A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP
3. Le métabolisme des protéines et des amino-acides 3. Le métabolisme des protéines et des amino-acides
3.1. Le métabolisme des protéines 3.1. Le métabolisme des protéines
b) Dégradation des protéines: le catabolisme b) Dégradation des protéines: le catabolisme

2 possibilités intracellulaires de dégradation des protéines :

Les peptidases et protéines se subdivisent en fonction de leur site de coupure :

• Les exopeptidases interviennent aux extrémités des chaînes peptidiques. On distingue les 1. Les protéasomes, grandes machines de dégradation protéique, dégradent des protéines marquées

carboxypeptidases qui libèrent un acide aminé à l'extrémité du peptide possédant une fonction par une protéine spéciale appelée ubiquitine, par un mécanisme ATP-dépendant.

2. Les lysosomes dégradent les protéines par un mécanisme ATP-indépendant.

carboxyl libre et les aminopeptidases qui libèrent un acide aminé à partir de l'extrémité du peptide

possédant une fonction amine libre.

• Les endopeptidases coupent les chaînes peptidiques en leur milieu. Les protéinases sont des

endopeptidases.
A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP
3. Le métabolisme des protéines et des amino-acides 3. Le métabolisme des protéines et des amino-acides
3.1. Le métabolisme des protéines 3.1. Le métabolisme des protéines
b) Dégradation des protéines: le catabolisme b) Dégradation des protéines: le catabolisme

2 possibilités intracellulaires de dégradation des protéines : 2 possibilités intracellulaires de dégradation des protéines :

A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP
3. Le métabolisme des protéines et des amino-acides 3. Le métabolisme des protéines et des amino-acides
3.1. Le métabolisme des protéines 3.2. Le métabolisme des Amino-Acides : Stratégie générale
b) Dégradation des protéines: le catabolisme

Cas particuliers des protéines extracellulaires: les glycoprotéines et l’albumine

Les glycoprotéines

Dans les parois des vaisseaux se trouvent des neuraminidases,

qui clivent le NANA terminal (N-acétyl-neuraminate).

Le galactose, qui était l'avant-dernier sucre, est maintenant à

l'extrémité et signale que la glycoprotéine altérée doit être enlevée

de la circulation sanguine.

Les 8 AA essentiels non synthétisés : Le Très Lyrique Tristan Fait Vachement Méditer Iseult
A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP
3. Le métabolisme des protéines et des amino-acides 3. Le métabolisme des protéines et des amino-acides
3.2. Le métabolisme des Amino-Acides : Stratégie générale 3.2. Le métabolisme des Amino-Acides : Stratégie générale

Aldolisations Métabolisme
Décarboxylations des AA
Désaminations
Transaminations

NH3 Noyau

Un coenzyme commun aux 3 réactions: le pyridoxal phosphate ou PALP

57 58

A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP
3. Le métabolisme des protéines et des amino-acides 3. Le métabolisme des protéines et des amino-acides
3.2. Le métabolisme des Amino-Acides : Stratégie générale 3.2. Le métabolisme des Amino-Acides : Stratégie générale
a) La vitamine B6 a) La vitamine B6

La PALP est libérée dans La vitB6 est absorbée sous

les vaisseaux sanguins et la forme déphosphorylée et
atteints les tissus par sa de façon passive au niveau
liaison à l’albumine de l’intestin grêle et de
l’iléon
ou Pyridoxine

Liaison ester

Pyridoxamine phosphate (PAMP) Les 3 formes de la vitB6 sont ensuite

59 phosphorylées par une pyridoxal kinase (PDXK)
pour donner PALP et PAMP
 A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP
3. Le métabolisme des protéines et des amino-acides 3. Le métabolisme des protéines et des amino-acides
3.2. Le métabolisme des Amino-Acides : Stratégie générale 3.2. Le métabolisme des Amino-Acides : Stratégie générale
a) La vitamine B6 b) Les transaminations

La PALP est libérée dans La vitB6 est absorbée sous

les vaisseaux sanguins et la forme déphosphorylée et Aldolisations Métabolisme
atteints les tissus par sa de façon passive au niveau des AA
liaison à l’albumine Décarboxylations
Besoin journalier  2mg de l’intestin grêle et de
l’iléon Désaminations
Transaminations

NH3 Noyau

Un coenzyme commun aux 3 réactions: le pyridoxal phosphate ou PALP

Les 3 formes de la vitB6 sont ensuite
phosphorylées par une pyridoxal kinase (PDXK) 62
pour donner PALP et PAMP

A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP
3. Le métabolisme des protéines et des amino-acides 3. Le métabolisme des protéines et des amino-acides
3.2. Le métabolisme des Amino-Acides : Stratégie générale 3.2. Le métabolisme des Amino-Acides : Stratégie générale
b) Les transaminations b) Les transaminations
Le mécanisme :

1. Transfert du
groupement aminé sur le
Transfert du groupement aminé PALP
via une transaminase spécifique
ou amino tranférase
4. Transfert du
groupement aminé à
un acide -cétonique

2. Formation d’une
base de Schiff

3. L’AA1 devient un acide -

63 cétonique
Le PALP devient PAMP
 A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP
3. Le métabolisme des protéines et des amino-acides 3. Le métabolisme des protéines et des amino-acides
3.2. Le métabolisme des Amino-Acides : Stratégie générale 3.2. Le métabolisme des Amino-Acides : Stratégie générale
b) Les transaminations b) Les transaminations
Le mécanisme : Le mécanisme :

Formation d’une
fonction imine
(C=N)
1
AA1 PALP Acide Cétonique 1 PAMP

1 2 Acide Cétonique 2 PAMP AA2 PALP

2
2
Bilan :
1. Transfert du groupement aminé sur le PALP 2. Transfert du groupement aminé à un acide -cétonique
Transaminase
Bilan : spécifique
Transaminase (PALP)
spécifique
(PALP)
AA1 Acide Cétonique 2 Acide Cétonique 1 AA2

A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP
3. Le métabolisme des protéines et des amino-acides 3. Le métabolisme des protéines et des amino-acides
3.2. Le métabolisme des Amino-Acides : Stratégie générale 3.2. Le métabolisme des Amino-Acides : Stratégie générale
b) Les transaminations b) Les transaminations
L’ASAT (Aspartate AminoTransférase) ou GOT (Glutamate Oxalo-acétate Transaminase) : L’ALAT (Alanine AminoTransférase) ou GPT (Glutamate Pyruvate transaminase) :

Cœur essentiellement, foie, muscle, rein

Foie essentiellement, cœur, muscle, rein

A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP
3. Le métabolisme des protéines et des amino-acides 3. Le métabolisme des protéines et des amino-acides
3.2. Le métabolisme des Amino-Acides : Stratégie générale 3.2. Le métabolisme des Amino-Acides : Stratégie générale
b) Les transaminations b) Les transaminations

Transamination Transamination

Désamination
oxydative

A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP
3. Le métabolisme des protéines et des amino-acides 3. Le métabolisme des protéines et des amino-acides
3.2. Le métabolisme des Amino-Acides : Stratégie générale 3.2. Le métabolisme des Amino-Acides : Stratégie générale
b) Les transaminations c) Les désaminations: la désamination oxydative

Transamination Transamination

Désamination Désamination
oxydative oxydative
Métabolisme
Décarboxylations des AA
Désaminations
Transaminations

NH3 Noyau

Cycle de
l’urée

Un coenzyme commun aux 3 réactions: le pyridoxal phosphate ou PALP

A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP
3. Le métabolisme des protéines et des amino-acides 3. Le métabolisme des protéines et des amino-acides
3.2. Le métabolisme des Amino-Acides : Stratégie générale 3.2. Le métabolisme des Amino-Acides : Stratégie générale
c) La désamination oxydative : la glutamate déshydrogènase ou GLDH c) La désamination oxydative : la glutamate déshydrogènase ou GLDH
GLDH

GLDH
Liaison
imine
Le mécanisme :

1. Oxydation

2. Hydrolyse

A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP
3. Le métabolisme des protéines et des amino-acides 3. Le métabolisme des protéines et des amino-acides
3.2. Le métabolisme des Amino-Acides : Stratégie générale 3.2. Le métabolisme des Amino-Acides : Stratégie générale
c) La désamination oxydative : la glutamate déshydrogènase ou GLDH d) L’hydrolyse par les amidases : la glutaminase

Intoxication par l’ammoniaque

GLDH

Sécrétion du NH4+ Synthèse de l’urée

Seule la réaction catalysée par la GLDH est réversibles, toutes les autres
désamination oxydative sont irréversibles

La formation et la sécrétion d’ammoniaque maintiennent l’équilibre acido-basique

 A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP
3. Le métabolisme des protéines et des amino-acides 3. Le métabolisme des protéines et des amino-acides
3.2. Le métabolisme des Amino-Acides : Stratégie générale 3.2. Le métabolisme des Amino-Acides : Stratégie générale
e) La décarboxylation des AA en amines biogènes e) La décarboxylation des AA en amines biogènes

Aldolisations Métabolisme
Décarboxylations des AA
Désaminations
Transaminations

NH3 Noyau

Un coenzyme commun aux 3 réactions: le pyridoxal phosphate ou PALP

77

A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP
3. Le métabolisme des protéines et des amino-acides 3. Le métabolisme des protéines et des amino-acides
3.2. Le métabolisme des Amino-Acides : Stratégie générale 3.2. Le métabolisme des Amino-Acides : Stratégie générale
e) La décarboxylation des AA en amines biogènes e) La décarboxylation des AA en amines biogènes
Les amines biogènes : 1. Biosynthèse Les amines biogènes : 1. Biosynthèse

2. Dégradation
 A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP
3. Le métabolisme des protéines et des amino-acides 3. Le métabolisme des protéines et des amino-acides
3.2. Le métabolisme des Amino-Acides : Stratégie générale 3.2. Le métabolisme des Amino-Acides : Stratégie générale
e) La décarboxylation des AA en amines biogènes e) La décarboxylation des AA en amines biogènes
3. Les mono-amines oxydases ou MAO 4. Les principales amines biogènes

 Le GABA (provenant du glutamate), ou y-amino-butyric acid;

2 isoenzymes:
 L'histamine (provenant de l'histidine) produite dans les mastocytes ;
MAO-A dans le SNC où elle dégrade la
noradrénaline et la sérotonine  La dopamine (provenant de la L-DOPA) est un neurotransmetteur ;
MAO-B principalement dans le foie et aussi
dans le cerveau où elle dégrade la dopamine  La sérotonine (provenant du 5-hydroxytryptophane), ou 5-hydroxytryptoptamine ;

 La sérotonine peut donner naissance à la mélatonine, produite dans l'épiphyse ;

 La cystéamine et la taurine (provenant de la cystéine) ;

 L'éthanolamine (provenant de la serine) ;

 La cadavérine (provenant de la lysine).

A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP
3. Le métabolisme des protéines et des amino-acides 3. Le métabolisme des protéines et des amino-acides
3.2. Le métabolisme des Amino-Acides : Stratégie générale 3.2. Le métabolisme des Amino-Acides : Stratégie générale
f) L’aldolisation f) L’aldolisation

Aldolisations Métabolisme
Décarboxylations des AA
Désaminations
Transaminations

NH3 Noyau

Un coenzyme commun aux 3 réactions: le pyridoxal phosphate ou PALP

A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP
3. Le métabolisme des protéines et des amino-acides 3. Le métabolisme des protéines et des amino-acides
3.2. Le métabolisme des Amino-Acides : Stratégie générale 3.2. Le métabolisme des Amino-Acides
3.2.1 L’anabolisme
Protéines
Biosynthèse Les AA non indispensables sur le plan nutritionnel ont des voies de biosynthèse
AA Synthèse des protéines
courtes.
Dégradation
La glutamate synthase, la glutamine synthétase et les transaminases occupent des
positions centrales dans la biosynthèse des AA.

Conjointement elles ont pour effet de catalyser la transformation de l’ion

NH3 Squelette hydrocarboné
ammonium inorganique en atome d’azote alpha-aminé organique de différents AA.

Cycle de CO2 Glucose Acétyl-CoA Corps cétoniques

l’urée

Le squelette hydrocarboné peut être utilisé pour des voies

cataboliques ou anaboliques
Urée

Elimination de l’organisme

A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP
3. Le métabolisme des protéines et des amino-acides 3. Le métabolisme des protéines et des amino-acides
3.2. Le métabolisme des Amino-Acides 3.2. Le métabolisme des Amino-Acides
3.2.1 L’anabolisme 3.2.1 L’anabolisme
a) Biosynthèse de l’alanine b) Biosynthèse de l’aspartate

ALAT

Cœur essentiellement, foie, muscle, rein

Formation de l’alanine par transamination du pyruvate.
Formation de l’alanine par transamination de l’oxaloacétate.
Le donneur du groupement aminé peut être le glutamate ou l’aspartate.
Le groupement aminé est donné par le glutamate,
L’autre produit sera alors l’alpha-cétoglutarate ou l’oxaloacétate
A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP
3. Le métabolisme des protéines et des amino-acides 3. Le métabolisme des protéines et des amino-acides
3.2. Le métabolisme des Amino-Acides 3.2. Le métabolisme des Amino-Acides
3.2.1 L’anabolisme 3.2.1 L’anabolisme
c) Biosynthèse de l’asparagine d) Biosynthèse du glutamate

GLDH

Asparagine
synthétase

L’amination réductrice de l’alpha-cétoglutarate est catalysée par la glutamate désydrogénase.

Ce n'est pas le NH3 libre mais la glutamine qui donne l'atome d'azote de la fonction amide.

A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP
3. Le métabolisme des protéines et des amino-acides 3. Le métabolisme des protéines et des amino-acides
3.2. Le métabolisme des Amino-Acides 3.2. Le métabolisme des Amino-Acides
3.2.1 L’anabolisme 3.2.1 L’anabolisme
e) Biosynthèse de la glutamine e) Biosynthèse de la glutamine

Les fonctions importantes de la glutamine :

- don d'azote pour la biosynthèse des noyaux pyrimidiques (N-3) et puriques (N-3 et N-9) ;
Asparagine
synthétase

Glutamine
synthétase

Première réaction de novo de la

synthèse des nucléotides puriques
A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP
3. Le métabolisme des protéines et des amino-acides 3. Le métabolisme des protéines et des amino-acides
3.2. Le métabolisme des Amino-Acides 3.2. Le métabolisme des Amino-Acides
3.2.1 L’anabolisme 3.2.1 L’anabolisme
e) Biosynthèse de la glutamine e) Biosynthèse de la glutamine

Les fonctions importantes de la glutamine : Les fonctions importantes de la glutamine :

- don d'azote pour la biosynthèse des noyaux pyrimidiques (N-3) et puriques (N-3 et N-9) ; - don d'azote pour la biosynthèse des noyaux pyrimidiques (N-3) et puriques (N-3 et N-9) ;

- don du groupement amine de la guanine pour le GMP ; - don du groupement amine de la guanine pour le GMP ;

- don de -NH2 dans la biosynthèse des osamines ;

Par une réaction de transfert d’un groupement –NH2 à

partir de la glutamine sur le fructose-6-phosphate, il se
forme de la glucosamine-6-phosphate.

Le groupement amine venant se substituer au

groupement cétone provient de la glutamine.
Cette substitution nécessite une molécule d’ATP et
aboutit à la formation de GMP.

A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP
3. Le métabolisme des protéines et des amino-acides 3. Le métabolisme des protéines et des amino-acides
3.2. Le métabolisme des Amino-Acides 3.2. Le métabolisme des Amino-Acides
3.2.1 L’anabolisme 3.2.1 L’anabolisme
e) Biosynthèse de la glutamine e) Biosynthèse de la glutamine

Les fonctions importantes de la glutamine : Les fonctions importantes de la glutamine :

- don d'azote pour la biosynthèse des noyaux pyrimidiques (N-3) et puriques (N-3 et N-9) ; - don d'azote pour la biosynthèse des noyaux pyrimidiques (N-3) et puriques (N-3 et N-9) ;

- don du groupement amine de la guanine pour le GMP ; - don du groupement amine de la guanine pour le GMP ;

- don de -NH2 dans la biosynthèse des osamines ; - don de -NH2 dans la biosynthèse des osamines ;

- don du groupement amide au cours de la biosynthèse de l'asparagine ; - don du groupement amide au cours de la biosynthèse de l'asparagine ;

- formation de l'ion ammonium (NH4+), jouant un rôle important dans la régulation du pH.
A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP
3. Le métabolisme des protéines et des amino-acides 3. Le métabolisme des protéines et des amino-acides
3.2. Le métabolisme des Amino-Acides 3.2. Le métabolisme des Amino-Acides
3.2.1 L’anabolisme 3.2.1 L’anabolisme
e) Biosynthèse de la glutamine f) Biosynthèse de la proline

Les fonctions importantes de la glutamine :

- don d'azote pour la biosynthèse des noyaux pyrimidiques (N-3) et puriques (N-3 et N-9) ;

- don du groupement amine de la guanine pour le GMP ;

- don de -NH2 dans la biosynthèse des osamines ;

- don du groupement amide au cours de la biosynthèse de l'asparagine ;

- formation de l'ion ammonium (NH4+), jouant un rôle important dans la régulation du pH.

La proline est formée à partir du glutamate

en inversant la séquence des réactions du
catabolisme de la proline.

A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP
3. Le métabolisme des protéines et des amino-acides 3. Le métabolisme des protéines et des amino-acides
3.2. Le métabolisme des Amino-Acides 3.2. Le métabolisme des Amino-Acides
3.2.1 L’anabolisme 3.2.1 L’anabolisme
g) Biosynthèse de la sérine h) Biosynthèse de la glycine

Sérine hydroxy
-méthyl-transférase
A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP
3. Le métabolisme des protéines et des amino-acides 3. Le métabolisme des protéines et des amino-acides
3.2. Le métabolisme des Amino-Acides 3.2. Le métabolisme des Amino-Acides
3.2.1 L’anabolisme 3.2.1 L’anabolisme
h) Biosynthèse de la glycine i) Biosynthèse des AA semi-essentiels : la tyrosine et la cystéine

A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP
3. Le métabolisme des protéines et des amino-acides 3. Le métabolisme des protéines et des amino-acides
3.2. Le métabolisme des Amino-Acides 3.2. Le métabolisme des Amino-Acides
3.2.1 L’anabolisme 3.2.1 L’anabolisme
i) Biosynthèse des AA semi-essentiels : la tyrosine et la cystéine i) Biosynthèse des AA semi-essentiels : la tyrosine et la cystéine

Les fonctions importantes de la cystéine :

- transfert de groupements soufrés par

l'intermédiaire du PAPS (3’-phospho-
adénosine-5’-phospho-sulfate) ;
- formation des ponts disulfures dans les
protéines.

Adrénaline Mélanine Noradrénaline

A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP
3. Le métabolisme des protéines et des amino-acides 3. Le métabolisme des protéines et des amino-acides
3.2. Le métabolisme des Amino-Acides 3.2. Le métabolisme des Amino-Acides
3.2.1 L’anabolisme 3.2.1 L’anabolisme
j) Biosynthèse des AA parfois essentiels : l’arginine et l’histidine k) Biosynthèse des AA essentiels (ou indispensables)

•les acides aminés à chaîne ramifiée, la valine, la leucine et l'isoleucine ;

•les acides aminés aromatiques, la phénylalanine et le tryptophane ;

•l'acide aminé à chaîne latérale basique, la lysine ;

•l'acide aminé soufré, la méthionine ;

•l'acide aminé alcool, la thréonine.

Les 8 AA essentiels non synthétisés : Le Très Lyrique Tristan Fait Vachement Méditer Iseult

L’arginine est produit au cours du cycle de l’urée

A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP
3. Le métabolisme des protéines et des amino-acides 3. Le métabolisme des protéines et des amino-acides
3.2. Le métabolisme des Amino-Acides 3.2. Le métabolisme des Amino-Acides
3.2.2 Le catabolisme des protéines et de l’azote des AA 3.2.2 Le catabolisme des protéines et de l’azote des AA

• Chez l'adulte normal les apports azotés sont égaux aux pertes. Toutes les protéines sont dégradées en
tripeptides, dipeptides et AA
• Bilan positif : quantité d'azote ingérée supérieure à celle excrétée (croissance et grossesse).
Les AA sont absorbés par les cellules intestinales
• Bilan azoté négatif : la perte d'azote dépasse les apports (après une intervention chirurgicale, lors grâce à un mécanisme de transport actif
d'un cancer à un stade avancé et en cas de kwashiorkor). secondaires et sont ensuite libérés dans la
circulation sanguine
• Chez l'être humain, le turnover quotidien correspond à 1 à 2 % des protéines corporelles totales,

surtout des protéines musculaires •La susceptibilité d'une protéine à être dégradée est
• De forts taux de dégradation protéique caractérisent les tissus soumis à un réarrangement exprimée par sa demi-vie (t1/2): temps nécessaire

structural. pour que sa concentration initiale diminue de 50 %.

•Les « enzymes de ménage » banales: t1/2 >100h
• Environ 75 % des acides aminés libérés sont réutilisés. L'azote en excès est transformé en urée
heures
•Nombreuses enzymes clés régulatrices ont une
demi-vie de 0,5 à 2 heures.
A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP
3. Le métabolisme des protéines et des amino-acides 3. Le métabolisme des protéines et des amino-acides
3.2. Le métabolisme des Amino-Acides 3.2. Le métabolisme des Amino-Acides
3.2.2 Le catabolisme des protéines et de l’azote des AA 3.2.2 Le catabolisme des protéines et de l’azote des AA
Protéines a) Le cycle de l’urée

Biosynthèse Flux global de l’azote dans le catabolisme des AA

AA Synthèse des protéines

Dégradation

Transamination

NH3 Squelette hydrocarboné

La synthèse de l’urée nécessite :
Désamination
oxydative -3 mole d’ATP ;
Cycle de CO2 Glucose Acétyl-CoA Corps cétoniques
l’urée - 1 mole d’ions ammonium ;
- 1mole d’azote du groupement alpha aminé de l’aspartate.
Le squelette hydrocarboné peut être utilisé pour des voies
cataboliques ou anaboliques Cycle de
Urée l’urée

Elimination de l’organisme

A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP
3. Le métabolisme des protéines et des amino-acides 3. Le métabolisme des protéines et des amino-acides
3.2. Le métabolisme des Amino-Acides 3.2. Le métabolisme des Amino-Acides
3.2.2 Le catabolisme des protéines et de l’azote des AA 3.2.2 Le catabolisme des protéines et de l’azote des AA
a) Le cycle de l’urée a) Le cycle de l’urée

La biosynthèse de l'urée est un

N-Acétyl-glutamate
processus cyclique :

- 2 réactions dans la mitochondrie

- les autres réactions dans le cytosol

A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP
3. Le métabolisme des protéines et des amino-acides 3. Le métabolisme des protéines et des amino-acides
3.2. Le métabolisme des Amino-Acides 3.2. Le métabolisme des Amino-Acides
3.2.2 Le catabolisme des protéines et de l’azote des AA 3.2.2 Le catabolisme des protéines et de l’azote des AA
a) Le cycle de l’urée a) Le cycle de l’urée
Production du carbamyl-phosphate : la carbamyl-phosphate synthétase I

 La carbamyl-phosphate synthétase I amorce la

 L'ornithine consommée dans la réaction
biosynthèse de l’urée
2 est régénérée dans la réaction 5.
N-Acétyl-glutamate  Formation d’un carbamyl phosphate à partir de
 Il n'y a ni perte ni gain net d'ornithine,
NH3 et d’un CO2 en présence de 2 ATP. Un
de citrulline, d'argininosuccinate ou
phosphate est incorporé dans le produit, un autre
d'arginine.
est hydrolysé et libéré.
 Cependant, il y a consommation d'ions
 Le carbamyl-phosphate est anhydride mixte.
ammonium, de C02, d'ATP et d'aspartate
 L'activité de la carbamylphosphate synthétase I

dépend de la concentration du N-acétylglutamate.

A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP
3. Le métabolisme des protéines et des amino-acides 3. Le métabolisme des protéines et des amino-acides
3.2. Le métabolisme des Amino-Acides 3.2. Le métabolisme des Amino-Acides
3.2.2 Le catabolisme des protéines et de l’azote des AA 3.2.2 Le catabolisme des protéines et de l’azote des AA
a) Le cycle de l’urée a) Le cycle de l’urée
Production du carbamyl-phosphate : la carbamyl-phosphate synthétase I Production de la citrulline: le transporteur de l’ornithine et l’ornithine transcarbamylase
 Le jeûne augmente les concentrations des enzymes,  L‘entrée et la sortie des 2 AA non protéinogènes,

probablement pour faire face à la production accrue l'ornithine dans la mitochondrie et la citrulline hors de la

d'ammoniac qui accompagne l'augmentation de la mitochondrie, nécessitent un système de transport dans

dégradation des protéines. la membrane interne mitochondriale

N-Acétyl-glutamate
 Le gène NAGS code la N-acétylglutamate synthétase qui  Le syndrome d'hyperornithiniémie,

catalyse la condensation de l'acétyl-CoA avec le d'hyperammoniémie et d'homocitrullinurie (syndrome

glutamate. HHH) résulte de la mutation du gène ORNT1 qui code

 Des défauts de ce gène entraînent une grave Transporteur le transporteur d'ornithine de la membrane

hyperammoniémie. mitochondriale.
Citrulline
 Des dysfonctionnements de la carbamylphosphate
synthétase I sont responsables de la maladie métabolique
assez rare appelée « hyperammoniémie de type 1 ».
A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP
3. Le métabolisme des protéines et des amino-acides 3. Le métabolisme des protéines et des amino-acides
3.2. Le métabolisme des Amino-Acides 3.2. Le métabolisme des Amino-Acides
3.2.2 Le catabolisme des protéines et de l’azote des AA 3.2.2 Le catabolisme des protéines et de l’azote des AA
a) Le cycle de l’urée a) Le cycle de l’urée
Production de la citrulline: le transporteur de l’ornithine et l’ornithine transcarbamylase Production de l’arginosuccinate : L’argininosuccinique synthase

 Le carbamyl-phosphate réagit avec l'omithine dans la

 Le deuxième atome d'azote va être incorporé sous
mitochondrie pour former la citrulline.
forme d'aspartate qui réagit avec la citrulline pour
 L'enzyme catalysant la réaction est l'omithine-carbamyl
former de l'arginino-succinate, en présence d'ATP.
transferase (OCT).
 Cette réaction, catalysée par l'arginino-succinate
 « L'hyperarnmoniémie de type 2 » liée au chromosome

X reflète un défaut de l'ornithine transcarbamylase. synthétase qui libère un pyrophosphate de l'ATP,

consomme deux liaisons riches en énergie.

A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP
3. Le métabolisme des protéines et des amino-acides 3. Le métabolisme des protéines et des amino-acides
3.2. Le métabolisme des Amino-Acides 3.2. Le métabolisme des Amino-Acides
3.2.2 Le catabolisme des protéines et de l’azote des AA 3.2.2 Le catabolisme des protéines et de l’azote des AA
a) Le cycle de l’urée a) Le cycle de l’urée
Production de la L-Arginine : l’argininosuccinase ou argininosuccinate lyase Production de l’urée : l’arginase

 L'arginino-succinase clive l'arginino-succinate en

 L'arginase hydrolyse l'arginine en ornithine et iso-urée.
fumarate et arginine.
Celle-ci se transforme spontanément en urée.
 Le fumarate peut alors gagner le cycle du citrate.
 L'hyperargininémie est une maladie autosomique récessive
 Défaut métabolique de l'argininosuccinase: acidurie
du gène de l'arginase. Les taux d'arginine sont élevés dans le
argininosuccinique accompagnée de taux élevés
sang et le liquide céphalo-rachidien.
d'argininosuccinate dans le sang, le liquide céphalo-
rachidien et l'urine est associée à l'apparition de cheveux  L'ornithine et la lysine sont des inhibiteurs puissants de

secs et cassants (trichorrhexie noueuse). l'arginase, ils sont compétitifs avec l'arginine
A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP
3. Le métabolisme des protéines et des amino-acides 3. Le métabolisme des protéines et des amino-acides
3.2. Le métabolisme des Amino-Acides 3.2. Le métabolisme des Amino-Acides
3.2.2 Le catabolisme des protéines et de l’azote des AA 3.2.2 Le catabolisme des protéines et de l’azote des AA
a) Le cycle de l’urée a) Le cycle de l’urée
Bilan: CO2 + NH3 + 3 ATP + ASP + 2 H20 Résumé:
 Les humains dégradent chaque jour 1 à 2 % de leurs protéines corporelles, à des vitesses très variables
selon les protéines et l'état physiologique.
Urée + 2 ADP + 2 Pi + AMP + PPi + Fumarate  De nombreuses protéines intracellulaires sont dégradées suite à l'attachement d'ubiquitine. Des récepteurs
à la surface des cellules hépatiques lient et internalisent les asialoglycoprotéines circulantes destinées à
être dégradées par les protéases lysosomiales.
 L’ammoniac est hautement toxique. Les poissons excrètent directement NH3, les oiseaux convertissent
NH3 en acide urique. Les autres vertébrés supérieurs transforment NH3 en urée.
 La transamination canalise l'azote des acides alpha-aminés vers le glutamate.
 La L-glutamate déshydrogénase (GDH) coupe une position centrale dans le métabolisme azoté.
 La glutamine synthétase convertit NH3 en glutamine non toxique. La glutaminase libère ensuite NH3
pour servir à la synthèse de l'urée.
 Les atomes de l'urée proviennent de NH3, CO2 et de l’azote du groupement aminé de l'aspartate.
 Les réactions ont lieu en partie dans la matrice mitochondriale et en partie dans le cytoplasme. Des
erreurs nées du métabolisme sont associées à chaque réaction cycle de l'urée.
 Des maladies métaboliques sont associées à des défauts de chacune des enzymes du cycle de l'urée, du
Relations entre le cycle de l’urée et le cycle des acides tricarboxyliques transporteur membranaire de l'ornithine, et de la N-acétylglutamate synthétase.

A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP
3. Le métabolisme des protéines et des amino-acides 3. Le métabolisme des protéines et des amino-acides
3.2. Le métabolisme des Amino-Acides 3.2. Le métabolisme des Amino-Acides
3.2.3 Le catabolisme du squelette carboné des AA 3.2.3 Le catabolisme du squelette carboné des AA
Protéines a) Devenir des squelettes carbonés des AA
Biosynthèse
AA Synthèse des protéines
AA glucoformateurs

Dégradation AA Cétogènes

NH3 Squelette hydrocarboné

Cycle de CO2 Glucose Acétyl-CoA Corps cétoniques

l’urée

Le squelette hydrocarboné peut être utilisé pour des voies

cataboliques ou anaboliques
Urée

Elimination de l’organisme
A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP
3. Le métabolisme des protéines et des amino-acides 3. Le métabolisme des protéines et des amino-acides
3.2. Le métabolisme des Amino-Acides 3.2. Le métabolisme des Amino-Acides
3.2.3 Le catabolisme du squelette carboné des AA 3.2.3 Le catabolisme du squelette carboné des AA
b) La famille C3: Alanine, Sérine, Cystéine c) La famille C4: Asparte et Asparagine
Le carrefour du pyruvate Le carrefour de l’oxalo-acétate

A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP
3. Le métabolisme des protéines et des amino-acides 3. Le métabolisme des protéines et des amino-acides
3.2. Le métabolisme des Amino-Acides 3.2. Le métabolisme des Amino-Acides
3.2.3 Le catabolisme du squelette carboné des AA 3.2.3 Le catabolisme du squelette carboné des AA
d) La famille C5: Glutamine, Proline, Arginine, Histidine e) La Méthionine, l’Isoleucine et la Valine
Le carrefour de l’alpha cétoglutarate Le carrefour du succinyl-CoA
A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP
3. Le métabolisme des protéines et des amino-acides 3. Le métabolisme des protéines et des amino-acides
3.2. Le métabolisme des Amino-Acides 3.2. Le métabolisme des Amino-Acides
3.2.3 Le catabolisme du squelette carboné des AA 3.2.3 Le catabolisme du squelette carboné des AA
e) La phénylalanine et la tyrosine a) Devenir des squelettes carbonés des AA

Produits du catabolisme des acides aminés glucogènes et cétogènes

Un déficit en phénylalanine hydroxylase

provoque une phénylcétonurie.

A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP
3. Le métabolisme des protéines et des amino-acides 3. Le métabolisme des protéines et des amino-acides
3.3. Le rôle des différents organes dans le métabolisme des Amino-Acides 3.3. Le rôle des différents organes dans le métabolisme des Amino-Acides

Le foie dispose en abondance d'enzymes

spécialisés dans la transformation des
acides aminés: les aminotransférases

Le foie synthétise également de l'urée à

partir des groupements aminés des acides
aminés dégradés.

Le transport de l'ammoniac (NH3) formé

à partir de la dégradation des acides
aminés à la périphérie, se fait sous forme
de glutamine dans le plasma.

132
A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP
3. Le métabolisme des protéines et des amino-acides 3. Le métabolisme des protéines et des amino-acides
3.3. Le rôle des différents organes dans le métabolisme des Amino-Acides 3.3. Le rôle des différents organes dans le métabolisme des Amino-Acides

Pyruvate Alanine Alanine Pyruvate

Glutamate KG KG Glutamate

133 134

A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP
4. Le métabolisme des lipides et des Acides Gras 4. Le métabolisme des lipides et des Acides Gras
4.1. Nomenclature
4.1.1 Les acides gras ou AG
a) Les AG saturés ou acides anoïques

Partie non‐polaire hydrophobe (R) Partie polaire hydrophile ‐ COOH

n-hexadécanoïque = acide palmitique

A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP
4. Le métabolisme des lipides et des Acides Gras 4. Le métabolisme des lipides et des Acides Gras
4.1. Nomenclature 4.1. Nomenclature
4.1.1 Les acides gras ou AG 4.1.1 Les acides gras ou AG
a) Les AG saturés ou acides anoïques a) Les AG saturés ou acides anoïques

Nombre de carbones Nom systématique Nom usuel

4 n-butanoïque butyrique
6 n-hexanoïque caproïque
8 n-octanoïque caprylique
10 n-décanoïque caprique
12 n-dodécanoïque laurique
14 n-tétradécanoïque myristique
16 n-hexadécanoïque palmitique
18 n-octadécanoïque stéarique
20 n-éicosanoïque arachidique
22 n-docosanoïque béhénique
24 n-tétracosanoïque lignocérique

A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP
4. Le métabolisme des lipides et des Acides Gras 4. Le métabolisme des lipides et des Acides Gras
4.1. Nomenclature 4.1. Nomenclature
4.1.1 Les acides gras ou AG 4.1.1 Les acides gras ou AG
b) Les AG insaturés ou acides ènoïques b) Les AG insaturés ou acides ènoïques

‐  (numérotation à partir de l’extrémité carboxylique)

‐  (numérotation à partir du dernier carbone)
A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP
4. Le métabolisme des lipides et des Acides Gras 4. Le métabolisme des lipides et des Acides Gras
4.1. Nomenclature 4.1. Nomenclature
4.1.1 Les acides gras ou AG 4.1.1 Les acides gras ou AG
b) Les AG insaturés ou acides ènoïques b) Les AG insaturés ou acides ènoïques

AG non essentiel

AG essentiels: non
synthétisés par
l’organisme

AG semi-essentiel:
synthétisés à partir
des acides linoléique
et linolénique

A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP
4. Le métabolisme des lipides et des Acides Gras 4. Le métabolisme des lipides et des Acides Gras
4.1. Nomenclature 4.1. Nomenclature
4.1.1 Les acides gras ou AG 4.1.2 Les glycérolipides
c) Les AG à nombre de C pairs ou impairs a) Les triacylglycérides ou triglycérides (TG)

La dégradation des acides gras pairs produit de l’acétyl-CoA

formé de deux carbones.

La dégradation des acides gras impairs donne un propionyl-CoA.

Le propionyl-CoA donnera du succinyl-CoA, constituant
intermédiaire du cycle de Krebs.

La plupart des acides gras de l'organisme sont pairs et leur

catabolisme produit de l'acétyl-CoA.
A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP
4. Le métabolisme des lipides et des Acides Gras 4. Le métabolisme des lipides et des Acides Gras
4.1. Nomenclature 4.1. Nomenclature
4.1.2 Les glycérolipides 4.1.2 Les glycérolipides
a) Les triacylglycérides ou triglycérides (TG) a) Les triacylglycérides ou triglycérides (TG)

O
1
CH2OH
O 1
CH2 – O – C – R1
2 O
HCOH + 3 HO–C–R
R
2 Triacylglycérol
3 acides gras H – C – O – C – R2
3 O
CH2OH
Glycérol 3
CH2 – O – C – R3

A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP
4. Le métabolisme des lipides et des Acides Gras 4. Le métabolisme des lipides et des Acides Gras
4.1. Nomenclature 4.1. Nomenclature
4.1.2 Les glycérolipides 4.1.2 Les glycérolipides
b) Les glycérophospholipides b) Les glycérophospholipides

Phosphatidyl sérine

Phosphatidyl
éthanolamine
A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP
4. Le métabolisme des lipides et des Acides Gras 4. Le métabolisme des lipides et des Acides Gras
4.1. Nomenclature 4.1. Nomenclature
4.1.2 Les glycérolipides 4.1.2 Les glycérolipides
b) Les glycérophospholipides c) Les cardiolipines

Exemple de nomenclature:
O
1 CH2-O-C
O 18:1, 9 = acide oléique
2 CH
C-O
O CH3
+
20:4,5,8,11,14
= acide 3 CH2-O P O-CH2-CH2-N CH3
arachidonique O- CH3

phosphocholine Cardiolipine
1‐oléyl,2‐arachidonyl,3‐phosphocholine Glycérol

X2

A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP
4. Le métabolisme des lipides et des Acides Gras 4. Le métabolisme des lipides et des Acides Gras
4.1. Nomenclature 4.1. Nomenclature
4.1.3 Les sphingolipides 4.1.3 Les sphingolipides
a) Les sphingophosphatides
A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP
4. Le métabolisme des lipides et des Acides Gras 4. Le métabolisme des lipides et des Acides Gras
4.1. Nomenclature 4.1. Nomenclature
4.1.3 Les sphingolipides 4.1.4 Les isoprénoïdes
b) Les glycolipides

A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP
4. Le métabolisme des lipides et des Acides Gras 4. Le métabolisme des lipides et des Acides Gras
4.2. Digestion des lipides 4.2. Digestion des lipides
4.2.1 Absorption digestive 4.2.1 Absorption digestive
1. La digestion dans la cavité buccale: 1. La digestion dans la cavité buccale:
présence d’une lipase sécrétée par la langue présence d’une lipase sécrétée par la langue

2. La digestion stomacale: émulsification des

lipides grâce au mouvement péristaltique stomacal

Les produits de
dégradation de lipides
forment des micelles avec
les acides biliaires et sont
finalement absorbés par
les cellules intestinales
A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP
4. Le métabolisme des lipides et des Acides Gras 4. Le métabolisme des lipides et des Acides Gras
4.2. Digestion des lipides 4.2. Digestion des lipides
4.2.1 Absorption digestive 4.2.2 Transport des lipides dans le sang
1. La digestion dans la cavité buccale:
présence d’une lipase sécrétée par la langue

2. La digestion stomacale: émulsification des

Le plasma dispose de 2 modes de transport :
lipides grâce au mouvement péristaltique stomacal
3. La digestion intestinale: présence d’une 1. Les protéines plasmatique dont l’albumine
enzyme, la colipase facilitant la digestion des
2. Les lipoprotéines
lipides

A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP
4. Le métabolisme des lipides et des Acides Gras 4. Le métabolisme des lipides et des Acides Gras
4.3. Le catabolisme des AG
4.3.1 Activation des AG
Acyl-CoA synthétase

Acyl-CoA
L’actéyl-CoA carrefour des voies anaboliques Bilan:
synthétase RCOO- + HSCoA + ATP +
et cataboliques des lipides et AG
H2 O

RCO-SCoA + AMP + 2Pi +

2H+
A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP
4. Le métabolisme des lipides et des Acides Gras 4. Le métabolisme des lipides et des Acides Gras
4.3. Le catabolisme des AG 4.3. Le catabolisme des AG
4.3.2 Transport des AG activés 4.3.3 Beta-Oxydation des AG saturés à nombre pair de C

Acyl-CoA Carnitine

Acyl-carnitine
transférase

HSCoA Acyl-carnitine

A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP
4. Le métabolisme des lipides et des Acides Gras 4. Le métabolisme des lipides et des Acides Gras
4.3. Le catabolisme des AG 4.3. Le catabolisme des AG
4.3.3 Beta-Oxydation des AG saturés à nombre pair de C 4.3.3 Beta-Oxydation des AG saturés à nombre pair de C
A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP
4. Le métabolisme des lipides et des Acides Gras 4. Le métabolisme des lipides et des Acides Gras
4.3. Le catabolisme des AG 4.3. Le catabolisme des AG
4.3.3 Beta-Oxydation des AG saturés à nombre pair de C 4.3.3 Beta-Oxydation des AG saturés à nombre pair de C

Bilan:

RCOSCoA + FAD + H2O + NAD+ + HSCoA

RCO-SCoA (n-2C) + CH3COSCoA + FADH2 +

NADH,H+

Bilan:

RCOSCoA + FAD + H2O + NAD+ + HSCoA RCO-SCoA (n-2C) + CH3COSCoA + FADH2 + NADH,H+

A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP
4. Le métabolisme des lipides et des Acides Gras 4. Le métabolisme des lipides et des Acides Gras
4.3. Le catabolisme des AG 4.3. Le catabolisme des AG
4.3.3 Beta-Oxydation des AG saturés à nombre pair de C 4.3.3 Beta-Oxydation des AG saturés à nombre pair de C
La répétition du cycle de la beta-oxydation Un exemple l’acide palmitique: C16:0

Acyl-CoA déshydrogénase

Beta ceto-thiolase

Enoyl-CoA hydratase
ou crotonase

L-3-hydroxyacyl-CoA déshydrogénase
 A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP
4. Le métabolisme des lipides et des Acides Gras 4. Le métabolisme des lipides et des Acides Gras
4.3. Le catabolisme des AG 4.3. Le catabolisme des AG
4.3.3 Beta-Oxydation des AG saturés à nombre pair de C 4.3.3 Beta-Oxydation des AG saturés à nombre pair de C
Un exemple l’acide palmitique: C16:0

Pour un acide gras à 16 atomes de carbone (acide palmitique)

Transformation en palmityl-CoA: consommation de deux

liaisons riches en énergie (équivalent de deux ATP).

Energie produite sous forme d’ATP:

7 x 1 FADH2 (chaîne respiratoire) = 7 x 2 ATP = 14 ATP

7 x 1 NADH + H+ (chaîne respiratoire) = 7 x 3 ATP = 21 ATP

8 acétyl-CoA (cycle de Krebs) = 8 x 12 ATP = 96 ATP

Total = 96 + 21 + 14 – 2 = 129 ATP

A titre de comparaison:
Oxydation du glucose = 38 ATP. Rendement pour 16 C
(glucose 6C, palmitate 16C) = 38 x 16/6 = 101 ATP soit 80% du
rendement énergétique de l’oxydation de l’acide palmitique.

A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP
4. Le métabolisme des lipides et des Acides Gras 4. Le métabolisme des lipides et des Acides Gras
4.3. Le catabolisme des AG 4.3. Le catabolisme des AG
4.3.4 Beta-Oxydation des AG saturés à nombre impair de C 4.3.4 Beta-Oxydation des AG saturés à nombre impair de C
a) Conversion du propionyl-CoA en D-méthylmalonyl-CoA
β-oxydation
CH3-(CH2)15-COSCoA CH3-(CH2)-COSCoA
Acide Propionyl-CoA
heptadécaénoïque
7 CH3-COSCoA
Acétyl-CoA

La dégradation des acides gras impairs donne un propionyl-CoA.

Le propionyl-CoA donnera du succinyl-CoA, constituant
intermédiaire du cycle de Krebs.
La plupart des acides gras de l'organisme sont pairs et leur
catabolisme produit de l'acétyl-CoA.
Le résidu propionyl d’un AG à nombre impair d’atomes de carbone
est la seule partie d’un AG qui soit glucogénique.
A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP
4. Le métabolisme des lipides et des Acides Gras 4. Le métabolisme des lipides et des Acides Gras
4.3. Le catabolisme des AG 4.3. Le catabolisme des AG
4.3.4 Beta-Oxydation des AG saturés à nombre impair de C 4.3.4 Beta-Oxydation des AG saturés à nombre impair de C
b) Conversion du D-méthylmalonyl-CoA en L-méthylmalonyl-CoA c) Formation du succinyl-CoA

A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP
4. Le métabolisme des lipides et des Acides Gras 4. Le métabolisme des lipides et des Acides Gras
4.3. Le catabolisme des AG 4.3. Le catabolisme des AG
4.3.5 Beta-Oxydation des AG insaturés 4.3.5 Beta-Oxydation des AG insaturés
2 enzymes supplémentaires :

2 cis 3 trans
3 trans 3 trans
 A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP
4. Le métabolisme des lipides et des Acides Gras 4. Le métabolisme des lipides et des Acides Gras
4.3. Le catabolisme des AG 4.3. Le catabolisme des AG
4.3.5 Beta-Oxydation des AG insaturés 4.3.5 Beta-Oxydation des AG à très longue chaines (C20 et C22)
La β-oxydation peroxisomiale et pathologies associées

Syndrome cérébro-hépato-rénal de Zellweger :

absence de peroxysomes dans tous les tissus

H20  Accumulation des acides polyèniques en C26 à

C38 dans le tissu cérébral

Catalase

A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP
4. Le métabolisme des lipides et des Acides Gras 4. Le métabolisme des lipides et des Acides Gras
4.3. Le catabolisme des AG 4.3. Le catabolisme des AG
4.3.5 Beta-Oxydation des AG à très longue chaines (C20 et C22) 4.3.5 Beta-Oxydation des AG à très longue chaines (C20 et C22)
La β-oxydation peroxisomiale et pathologies associées La β-oxydation peroxisomiale et β-oxydation mitochondriale
(acide lignocérique = C 24:0)
R-CH2-CH2-COOH Cytosol
ALDP
VLACS

CoA-SH Membrane du
peroxysome

H20 H20

Adrénoleucodystrophie liée à l’X :

Déficience en ALDP (Adrenoleukodystrophy Protein).

Catalase La mutation du gène ABCD1 localisé sur le Catalase

chromosome X entraînant un déficit de la bêta-

oxydation dans le peroxysome avec accumulation

d‘AGTLC (augmentation de l’acide cérotique C26:0)

 Accumulation des acides gras à très longues chaines

dans le cerveau avec démyélinisation progressive du

SNC et une insuffisance surrénale périphérique

A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP
4. Le métabolisme des lipides et des Acides Gras 4. Le métabolisme des lipides et des Acides Gras
4.3. Le catabolisme des AG 4.4. La cétogenèse
4.3.6 Régulation des beta-Oxydations 4.4.1 Biosynthèse des corps cétoniques
Malony-CoA
Acide hydroxybutyrique

Acide acéto-acétique

Acétone

A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP
4. Le métabolisme des lipides et des Acides Gras 4. Le métabolisme des lipides et des Acides Gras
4.4. La cétogenèse 4.4. La cétogenèse
4.4.1 Biosynthèse des corps cétoniques 4.4.1 Biosynthèse des corps cétoniques
a) Formation d’acéto-acétate b) Formation de beta-hydroxybutyrate
A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP
4. Le métabolisme des lipides et des Acides Gras 4. Le métabolisme des lipides et des Acides Gras
4.4. La cétogenèse 4.4. La cétogenèse
4.4.1 Biosynthèse des corps cétoniques 4.4.1 Biosynthèse des corps cétoniques
c) Formation d’acétone d) Interrelations entre les corps cétoniques

A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP
4. Le métabolisme des lipides et des Acides Gras 4. Le métabolisme des lipides et des Acides Gras
4.4. La cétogenèse 4.4. La cétogenèse
4.4.1 Biosynthèse des corps cétoniques 4.4.1 Biosynthèse des corps cétoniques
e) Schéma d’ensemble e) Schéma d’ensemble
A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP
4. Le métabolisme des lipides et des Acides Gras 4. Le métabolisme des lipides et des Acides Gras
4.4. La cétogenèse 4.4. La cétogenèse
4.4.1 Biosynthèse des corps cétoniques 4.4.1 Biosynthèse des corps cétoniques
e) Schéma d’ensemble f) Formation, utilisation et excrétion des corps cétoniques
Voies
principales
Voies
secondaires

A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP
4. Le métabolisme des lipides et des Acides Gras 4. Le métabolisme des lipides et des Acides Gras
4.4. La cétogenèse 4.4. La cétogenèse
4.4.1 Biosynthèse des corps cétoniques 4.4.1 Biosynthèse des corps cétoniques
g) Transport des corps cétoniques à partir du foie et mécanisme de leur h) Régulation de la cétogenèse
utilisation et de leur oxydation dans les tissus extrahépatiques
1. Les AG libres issus de la lipolyse sont les précurseurs des
corps cétoniques dans le foie
A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP
4. Le métabolisme des lipides et des Acides Gras 4. Le métabolisme des lipides et des Acides Gras
4.4. La cétogenèse 4.4. La cétogenèse
4.4.1 Biosynthèse des corps cétoniques 4.4.1 Biosynthèse des corps cétoniques
h) Régulation de la cétogenèse h) Régulation de la cétogenèse
1. Les AG libres issus de la lipolyse sont les précurseurs des
corps cétoniques dans le foie

2. Après leur absorption par le foie, les acides gras libres

sont :
soit beta-oxydés en C02 ou en corps cétoniques,
soit estérifiés en triacylglycérols et en phospholipides.

Un contrôle exerce sur l'entrée des acides gras dans

la voie oxydative, par la carnitine
palmitoyltransférase I (CPT-I), et le reste des acides
gras absorbés est estérifié

A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP
4. Le métabolisme des lipides et des Acides Gras 4. Le métabolisme des lipides et des Acides Gras
4.4. La cétogenèse 4.4. La cétogenèse
4.4.1 Biosynthèse des corps cétoniques 4.4.2 Dégradation des corps cétoniques
h) Régulation de la cétogenèse
1. Les AG libres issus de la lipolyse sont les précurseurs des
corps cétoniques dans le foie

2. Après leur absorption par le foie, les acides gras libres

sont :
soit beta-oxydés en C02 ou en corps cétoniques,
soit estérifiés en triacylglycérols et en phospholipides.

Un contrôle exerce sur l'entrée des acides gras dans

la voie oxydative, par la carnitine
palmitoyltransférase I (CPT-I), et le reste des acides
gras absorbés est estérifié

3. L’acétyl-CoA formé au cours de la beta-oxydation est

oxydé dans le cycle de l'acide citrique ou il entre dans la
voie de la cétogenèse pour donner des corps cétoniques.
A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP
4. Le métabolisme des lipides et des Acides Gras 4. Le métabolisme des lipides et des Acides Gras
4.4. La cétogenèse 4.4. La cétogenèse
4.4.3 Modulation des corps cétoniques 4.4.3 Modulation des corps cétoniques
Jeûne prolongé et coma diabétique : Jeûne prolongé et coma diabétique :
- Formation d’acétyl-CoA à partir d’acéto-acétate lors d’un jeûne prolongé
Glycémie: 1g /litre (5,5 mmole/l)
Varie entre 1 et 1,4 g/l deux heures après un repas.
Varie entre 0,8 et 1,26 g/l à jeun le matin.
Il y a diabète lorsque la glycémie à jeun est > ou = à 1,26g/l (OMS).
Hypoglycémie: glycémie < à 0,45g/l.
Glycémie atteint 1,60 g/l : glycosurie

Diabète de type I: 10% des diabètes, 0,25% de la population en France.

Causé par la destruction des cellules β du pancréas d’où l’incapacité à sécréter de l’insuline.
Traitement : injections d’insulines rapide et lente et analogues.

Diabète de type II: environ 2 millions de personnes en France, 3% de la population, augmentation

de 3% par an.
Caractérisé par une résistance à l’insuline et une carence relative de sécrétion d’insuline, l’une ou
l’autre de ces caractéristiques pouvant dominer à un degré variable.
Traitement par régime diététique seul, par médicament antidiabétique oral et/ou par injections
d’insuline.

A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP
4. Le métabolisme des lipides et des Acides Gras 4. Le métabolisme des lipides et des Acides Gras
4.5. L’anabolisme des AG 4.5. L’anabolisme des AG
4.5.1 Biosynthèse des AG saturés 4.5.1 Biosynthèse des AG saturés
a) La production de malonyl-CoA est l’étape limitante de la synthèse des AGs
 S’effectue dans le cytosol et/ou dans le réticulum endoplasmique (cellules animales/levures)

 Formation principalement du palmitate

 Réactions supplémentaires permettent l’allongement des AGs et la désaturation qui s’effectuent

dans le réticulum endoplasmique (RE)

b) Régulation multilatérale de l’activité de l’acétyl-CoA carboxylase
 Synthèse se fait en 3 étapes:

-Activation

- Elongation

- Terminaison
 A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP
4. Le métabolisme des lipides et des Acides Gras 4. Le métabolisme des lipides et des Acides Gras
4.5. L’anabolisme des AG 4.5. L’anabolisme des AG
4.5.1 Biosynthèse des AG saturés 4.5.1 Biosynthèse des AG saturés
c) La Fatty Acid Synthase FAS ou Acide Gras Synthase 1er tour: formation du butyryl-ACP (4 C)

Acétyl-Coenzyme A

A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP
4. Le métabolisme des lipides et des Acides Gras 4. Le métabolisme des lipides et des Acides Gras
4.5. L’anabolisme des AG 4.5. L’anabolisme des AG
4.5.1 Biosynthèse des AG saturés 4.5.1 Biosynthèse des AG saturés
1er tour: formation du butyryl-ACP (4 C) 1er tour: formation du butyryl-ACP (4 C)

Condensation de
l'acétyl-ACP et du Déshydratation du β-
malony-ACP hydroxybutyryl-ACP

Réduction de l'acétoacyl-
ACP en β-hydroxybutyryl- Réduction de la
ACP double liaison par
le NADPH,H+
A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP
4. Le métabolisme des lipides et des Acides Gras 4. Le métabolisme des lipides et des Acides Gras
4.5. L’anabolisme des AG 4.5. L’anabolisme des AG
4.5.1 Biosynthèse des AG saturés 4.5.1 Biosynthèse des AG saturés
2ème tour: élongation du butyryl-ACP de 2C par condensation avec le malonyl-ACP Bilan de la synthèse en palmitate

8 Acétyl-CoA + 14 NADPH, H+ + 7 ATP + 7 H+

L’élongation va se poursuivre avec l’apport d’unités
dicarbonées à partir du malonyl.

L’acétyl-CoA ne sert qu’a amorcer le 1er cycle.

Pour la synthèse du palmitate, il faut 7 cycle d’élongation.

Palmitate + 8 CoA + 14 NADP+ + 7 ADP + 7 Pi + 6 H2O
Lorsque l’acyl-ACP a une certaine longueur (16C), il se
produit une hydrolyse et l’AG est libéré.

A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP
4. Le métabolisme des lipides et des Acides Gras 4. Le métabolisme des lipides et des Acides Gras
4.5. L’anabolisme des AG 4.5. L’anabolisme des AG
4.5.1 Biosynthèse des AG saturés 4.5.1 Biosynthèse des AG saturés
d) Parallélisme entre beta-oxydation et biosynthèse des AGs d) Parallélisme entre beta-oxydation et biosynthèse des AGs

Intermédiaires activés
‐oxydation : R‐CO‐S‐CoA
Biosynthèse :
‐Procarytotes R‐CO‐S‐ACP
‐ Eucaryotes R‐CO‐S‐Pan‐Enz cad R‐CO‐S‐ AG synthase
A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP
4. Le métabolisme des lipides et des Acides Gras 4. Le métabolisme des lipides et des Acides Gras
4.5. L’anabolisme des AG 4.5. L’anabolisme des AG
4.5.1 Biosynthèse des AG saturés 4.5.2 Biosynthèse des AG saturés à longue chaîne et insaturés
e) La voie de pentoses phosphates, principales sources de NADPH a) L’élongation

Générateurs
de NADPH

Voie des pentoses-P

Isocitrate déshydrogénase
Enzyme malique

A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP
4. Le métabolisme des lipides et des Acides Gras 4. Le métabolisme des lipides et des Acides Gras
4.5. L’anabolisme des AG 4.5. L’anabolisme des AG
4.5.2 Biosynthèse des AG saturés à longue chaîne et insaturés 4.5.2 Biosynthèse des AG saturés à longue chaîne et insaturés
b) Les désaturases c) Voie 1 : Famille partant de l’acide palmitique

9 désaturase 9 désaturase

6 désaturase

4
9
5
15 12 9
6
5 désaturase
Végétaux Animaux
A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP
4. Le métabolisme des lipides et des Acides Gras 4. Le métabolisme des lipides et des Acides Gras
4.5. L’anabolisme des AG 4.5. L’anabolisme des AG
4.5.2 Biosynthèse des AG saturés à longue chaîne et insaturés 4.5.2 Biosynthèse des AG saturés à longue chaîne et insaturés
d) Voie 2 : Famille partant de l’acide linoléique e) Voie 3 : Famille partant de l’acide linolénique

Conduit à des Ag très poly-

insaturés
6 désaturase
6 désaturase

5 désaturase

5 désaturase

4 désaturase

Acide docosahexènoïque

A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP
4. Le métabolisme des lipides et des Acides Gras 4. Le métabolisme des lipides et des Acides Gras
4.6. L’anabolisme des TAG 4.6. L’anabolisme des TAG

Glycérol
A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP
4. Le métabolisme des lipides et des Acides Gras 4. Le métabolisme des lipides et des Acides Gras
4.6. L’anabolisme des TAG 4.6. L’anabolisme des TAG
a) Activation du glycérol a) Activation du glycérol
Glycérol Glycérol

A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP
4. Le métabolisme des lipides et des Acides Gras 4. Le métabolisme des lipides et des Acides Gras
4.6. L’anabolisme des TAG 4.6. L’anabolisme des TAG
b) Formation des TAG à partir du glycérol-3-phosphate b) Formation des TAG à partir du glycérol-3-phosphate
Glycérol Glycérol-3-phosphate Glycérol Phosphatidate
(habituellement saturé) 2-mono-acyl-glycérol
Acyl-CoA
Monoacylglycérol
Acyltransférase

CoA

(habituellement insaturé)
A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP
4. Le métabolisme des lipides et des Acides Gras 5. Le métabolisme de l’alcool
4.7. Le catabolisme des TAG

Digestion & Absorption Alcool

Catabolisme

A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP
5. Le métabolisme de l’alcool

Digestion & Absorption Alcool

Catabolisme

a) Dégradation par le cycle du citrate

b) Biosynthèse des AGs
c) Biosynthèse du cholestérol
d) Biosynthèse des corps cétoniques
A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP
6. Le cycle de Krebs ou cycle du citrate ou cycle des acides tricarboxyliques

Digestion & Absorption Alcool Digestion & Absorption Alcool

Catabolisme Catabolisme

2 2

A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP
6. Le cycle de Krebs ou cycle du citrate ou cycle des acides tricarboxyliques 6. Le cycle de Krebs ou cycle du citrate ou cycle des acides tricarboxyliques
6.1. Fonction catabolique du cycle de Krebs
a) Décarboxylation oxydative du pyruvate

CoA-SH CO2
A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP
6. Le cycle de Krebs ou cycle du citrate ou cycle des acides tricarboxyliques 6. Le cycle de Krebs ou cycle du citrate ou cycle des acides tricarboxyliques
6.1. Fonction catabolique du cycle de Krebs 6.1. Fonction catabolique du cycle de Krebs
b) Le cycle de Krebs: une suite fermée de 9 réactions b) Le cycle de Krebs: une suite fermée de 9 réactions
Réaction 1: formation du citrate

A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP
6. Le cycle de Krebs ou cycle du citrate ou cycle des acides tricarboxyliques 6. Le cycle de Krebs ou cycle du citrate ou cycle des acides tricarboxyliques
6.1. Fonction catabolique du cycle de Krebs 6.1. Fonction catabolique du cycle de Krebs
b) Le cycle de Krebs: une suite fermée de 9 réactions b) Le cycle de Krebs: une suite fermée de 9 réactions
Réaction 2: formation de l’isocitrate Réaction 3: oxydation de l’isocitrate en KG
A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP
6. Le cycle de Krebs ou cycle du citrate ou cycle des acides tricarboxyliques 6. Le cycle de Krebs ou cycle du citrate ou cycle des acides tricarboxyliques
6.1. Fonction catabolique du cycle de Krebs 6.1. Fonction catabolique du cycle de Krebs
b) Le cycle de Krebs: une suite fermée de 9 réactions b) Le cycle de Krebs: une suite fermée de 9 réactions
Réaction 4: oxydation de l’KG en succinyl-CoA Réaction 5: formation du succinate

H20

A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP
6. Le cycle de Krebs ou cycle du citrate ou cycle des acides tricarboxyliques 6. Le cycle de Krebs ou cycle du citrate ou cycle des acides tricarboxyliques
6.1. Fonction catabolique du cycle de Krebs 6.1. Fonction catabolique du cycle de Krebs
b) Le cycle de Krebs: une suite fermée de 9 réactions b) Le cycle de Krebs: une suite fermée de 9 réactions
Réaction 6: oxydation du succinate en fumarate Réaction 7: hydratation du fumarate en malate

H20 H20
A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP
6. Le cycle de Krebs ou cycle du citrate ou cycle des acides tricarboxyliques 6. Le cycle de Krebs ou cycle du citrate ou cycle des acides tricarboxyliques
6.1. Fonction catabolique du cycle de Krebs 6.1. Fonction catabolique du cycle de Krebs
b) Le cycle de Krebs: une suite fermée de 9 réactions b) Le cycle de Krebs: une suite fermée de 9 réactions
Réaction 8: oxydation du malate en oxaloacétate Bilan :

Acétyl-CoA + 3 NAD+ + FAD

+ GDP + Pi + 2H20

2CO2 + 3 NADH,H+ + FADH2

+ GTP + HSCoA

H20 H20

A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP
6. Le cycle de Krebs ou cycle du citrate ou cycle des acides tricarboxyliques 6. Le cycle de Krebs ou cycle du citrate ou cycle des acides tricarboxyliques
6.2. Fonctions anaboliques du cycle de Krebs 6.2. Fonctiona anaboliques du cycle de Krebs
a) Biosynthèse des AA
 A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP
6. Le cycle de Krebs ou cycle du citrate ou cycle des acides tricarboxyliques 6. Le cycle de Krebs ou cycle du citrate ou cycle des acides tricarboxyliques
6.2. Fonctions anaboliques du cycle de Krebs 6.2. Fonctions anaboliques du cycle de Krebs
b) Biosynthèse du glucose c) Biosynthèse des AG et du cholestérol

La navette du malate

Phosphoènol-pyruvate

Néoglucogenèse

Glucose

A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP
6. Le cycle de Krebs ou cycle du citrate ou cycle des acides tricarboxyliques 6. Le cycle de Krebs ou cycle du citrate ou cycle des acides tricarboxyliques
6.3. Réactions anaplérotiques du cycle de Krebs 6.4. Régulations du cycle de Krebs

Aspartate
 A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP
7. Bilan intermédiaire à la suite de la glycolyse et du cycle de Krebs 8. La mitochondrie, un organite essentiel au métabolisme

Devenir du NADH,H+ Devenir du FADH2

A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP
8. La mitochondrie, un organite essentiel au métabolisme 8. La mitochondrie, un organite essentiel au métabolisme
8.1. Principes de la chaîne respiratoire

Membrane
interne

Membrane
externe

Espace Espace intermembranaire

matriciel

Espace
intermembranaire
A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP
8. La mitochondrie, un organite essentiel au métabolisme 8. La mitochondrie, un organite essentiel au métabolisme
8.1. Principes de la chaîne respiratoire 8.1. Principes de la chaîne respiratoire
a) Vue d’ensemble de la chaîne respiratoire b) Flux des électrons à travers les complexes de la chaîne respiratoire

A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP
8. La mitochondrie, un organite essentiel au métabolisme 8. La mitochondrie, un organite essentiel au métabolisme
8.1. Principes de la chaîne respiratoire 8.1. Principes de la chaîne respiratoire
b) Flux des électrons à travers les complexes de la chaîne respiratoire b) Flux des électrons à travers les complexes de la chaîne respiratoire
A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP
8. La mitochondrie, un organite essentiel au métabolisme 8. La mitochondrie, un organite essentiel au métabolisme
8.1. Principes de la chaîne respiratoire 8.2. Théorie chimiosmotique de la phosphorylation oxydative
b) Flux des électrons à travers les complexes de la chaîne respiratoire

Espace
intermembranaire

Membrane
interne

Matrice
mitochondriale

A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP
8. La mitochondrie, un organite essentiel au métabolisme 8. La mitochondrie, un organite essentiel au métabolisme
8.3. Sites de l’inhibition de la chaîne respiratoire 8.4. Navette du glycérophosphate
A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP A. Le mé
métabolisme: une source de production d’
d’ATP
8. La mitochondrie, un organite essentiel au métabolisme 8. La mitochondrie, un organite essentiel au métabolisme
8.5. Navette du malate 8.6. Navette de la créatine phosphate des muscles cardiaque et squelettique