CYCLE TRICARBOXYLIQUE
DE KREBS
Pr. P. Lopez Sall
Licence 2 Pharmacie
OBJECTIFS
- Ecrire les différentes réactions du cycle de Krebs
- Etablir le bilan énergétique
- Citer les principaux inhibiteurs
- Décrire les mécanismes de régulation
- Ecrire les réactions de réamorçage
PLAN
Introduction
I. Différentes étapes du cycle
II. Bilan énergétique
III. Régulation
IV. Réamorçage du cycle
V. Relations entre le cycle de Krebs et les différentes voies
métaboliques
Conclusion
INTRODUCTION
Respiration cellulaire désigne processus moléculaires impliquant:
Consommation O2
Formation CO2
Respiration se déroule en plusieurs étapes parmi lesquelles:
Dégradation molécules en unités dicarbonées = acétylCoA,
Origine des molécules = coupure de composés énergétiques:
Catabolismes glucides (glycolyse)
Catabolisme AG (β -oxydation).
Dégradation acétylCoA en CO2 en H+ et e- , riches en énergie, pris en charge/
coenzymes oxydoréduction grâce à processus cyclique dénommé :
Cycle tricarboxylique
Cycle de Krebs
Cycle de l’acide citrique
I. DIFFÉRENTES ETAPES DU CYCLE
Réactions cycle
Localisation: Mitochondries
Enzymes = enzymes solubles dissoutes dans liquide situé dans espace
mitochondrial central.
Exception = succinyl (ou succinate) déshydrogénase fixée à la surface
interne membrane mitochondriale interne, au contact chaines de transport e-
.
Point de départ cycle = entrée reste acétique / combinaison avec
oxaloacétate (AOA).
Terme de cycle
Régénération oxaloacétate
Oxydation totale reste acétique (acétylCoA).
I. DIFFÉRENTES ETAPES DU CYCLE
I.1 Condensation de l’acétyl CoA avec l’acide oxalo-acétique (AOA)
Condensation catalysée /citrate synthase selon la réaction
Réaction irréversible, ΔG’O = -7700 cal/mol
I. DIFFÉRENTES ETAPES DU CYCLE
I.2. Isomérisation de l’acide citrique en acide isocitrique
Déshydratation ac citrique en ac cis aconitique suivie de hydratation en
isocitrate.
Action Aconitase, en présence Fe2+ (chélatant citrate).
Inhibition compétitive Aconitase /acide fluorocitrique .
I. DIFFÉRENTES ETAPES DU CYCLE
I.3. Décarboxylation oxydative de l’acide isocitrique
Oxydation fonction alcool IIaire ac isocitrique /isocitrate déshydrogénase
Mg2+ = cofacteur minéral
Isocitrate déshydrogénase = enzyme allostérique activée / ADP et inhibée
/ATP et NADH.
I. DIFFÉRENTES ETAPES DU CYCLE
I.4. Décarboxylation oxydative de l’ac. α cétoglutarique
Transformation ac α cétoglutarique sous dépendance de complexe
enzymatique = α- cétoglutarate déshydrogénase
α- cétoglutarate déshydrogénase constitué de plusieurs protéines
enzymatiques et coenzymes.
I. DIFFÉRENTES ETAPES DU CYCLE
I.5. Formation de l’acide succinique
Energie supplémentaire contenue dans succinyl CoA récupérée pour
formation ATP / mécanisme de couplage catalysé/ succinyl CoA
synthétase.
Phosphate minéral relie coenzyme A et ac succinique
Fixation radical H2PO3 / GDP et formation de GTP)
Utilisation GTP formé pour régénération ATP
Formation succinate = seule réaction du cycle → régénération nucléoside
triphosphate sans passer /chaines de transport e-.
I. DIFFÉRENTES ETAPES DU CYCLE
Réaction catalysée / succinyl CoA synthétase ou succinyl thiokinase
I. DIFFÉRENTES ETAPES DU CYCLE
I.6 Oxydation de l’ac succinique en ac fumarique
Succinyl-déshydrogénase = flavoprotéine (solidement liée membranes
mitochondriales) réalise oxydation ac succinique en ac fumarique
(isomère trans)
Inhibiteur compétitif = ac malonique
I. DIFFÉRENTES ETAPES DU CYCLE
I.7. Hydratation de l’ac fumarique en ac malique
Hydratation réalisée / fumarase (enzyme groupe hydratases) aboutit à
formation de acide malique (alcool IIaire).
I. DIFFÉRENTES ETAPES DU CYCLE
I.8. Oxydation de l’ac malique en ac oxaloacétique
Cofacteur métallique: Zn2+
I. DIFFÉRENTES ETAPES DU CYCLE
pH physiologique, équilibre en faveur formation malate
Utilisation oxaloacétate pour nouveau tour de cycle → transformation
malate
Composé départ cycle tricarboxylique régénéré
Carbones du reste acétique, transformés en CO2
Formation coenzymes oxydoréduction hydrogénés.
II. BILAN DU CYCLE DE L’ACIDE CITRIQUE
Bilan général du cycle peut se résumer par le schéma suivant:
II. BILAN DU CYCLE DE L’ACIDE CITRIQUE
Equation réaction globale:
AcétylCoA + 2 H2O + 3 NAD+ + FAD + ADP + Pi
↓
2 CO2 + 3 NADH, H+ + FADH2 + ATP + CoASH
II. BILAN DU CYCLE DE L’ACIDE CITRIQUE
Cycle du glyoxylate
II. BILAN DU CYCLE DE L’ACIDE CITRIQUE
Formation:
Quatre (4) molécules de coenzymes sous forme réduite
Un (1) Composé à liaison phosphate riche en énergie, GTP
Elimination deux (2) carbones du reste acétique, entièrement oxydé en
CO2.
Deux (2) carbones oxydés empruntés à AOA, pour premier tour de cycle
(mise en évidence /marquage acétyl CoA sur reste acétique).
Coenzymes réduits utilisés/chaines d’oxydation cellulaire mitochondriale,
Réoxydation coenzymes → régénération ATP.
NADH, H+ → 3 ATP
FADH2 → 2 ATP.
II. BILAN DU CYCLE DE L’ACIDE CITRIQUE
Bilan énergétique catabolisme chainon acétyl:
3 NDH,H+ Réoxydation chaine respiratoire 3 X 3 ATP = 9ATP
3 X 2,5 ATP = 7,5 ATP
1 FADH2 Réoxydation chaine respiratoire 2 ATP
1,5 ATP
1 GTP 1 ATP
Total: 12 ATP (10 ATP)
Formation 12 ATP : fonctionnement cycle acide citrique couplé à celui
chaines d’oxydation cellulaire.
Voie métabolique aérobie lorsque cycle fonctionne en totalité.
III. REGULATION DU CYCLE
Trois niveaux de contrôle/ mécanismes de régulation allostérique.
Citrate synthase inactivée/ATP
ATP ↑ constante Michaelis enzyme → ↓tion affinité enzyme.
Quantité suffisante ATP → arrêt fonctionnement cycle.
Isocitrate déshydrogénase activée /ADP et inhibée/ NADH, H+ ( déplace
NAD+ de l’enzyme)
α cétoglutarate déshydrogénase inhibée / produits formés /son action
Succinyl CoA
NADH, H+.
III. REGULATION DU CYCLE
Régulation cycle permet couplage étroit entre:
Chaines mitochondriales transport e-
Production NADH, H+
Accumulation NADH,H+ → arrêt cycle acide citrique jusqu'à ce que capital
NAD+ soit reconstitué /oxydations mitochondriales.
Consommation ATP / cellule régule fonctionnement:
Cycle de Krebs
Chaines oxydation coenzymes lui étant couplé sous le contrôle de accumulation
de NADH, H+.
IV. REAMORÇAGE DU CYCLE DE KREBS.
Condition déroulement cycle de Krebs dans sa totalité:
Présence composé intermédiaire en quantité suffisante dans la cellule.
Conditions non remplies, plusieurs réactions mises en jeu pour donner
naissance à Acide oxaloacétique (AOA).
Réactions de remplissage = réactions anaplérotiques
IV. REAMORÇAGE DU CYCLE DE KREBS
Carboxylation du pyruvate en oxaloacétate
CH3-CO-COO- + CO2 + ATP -OOC-CH
2-CO-COO
- + ADP + Pi
Pyruvate carboxylase
IV. REAMORÇAGE DU CYCLE DE KREBS
Formation de AOA à partir de PEP
PEP + CO2 + GDP Oxaloacétate + GTP
Phosphoénol pyruvate
carboxykinase
V. RELATIONS ENTRE CYCLE DE L’ACIDE CITRIQUE ET AUTRES
VOIES MÉTABOLIQUES
Cycle de Krebs = source de précurseurs biosynthétiques.
Fonction essentielle cycle acide citrique
Cataboliser radicaux acétyles activés sous forme d’acétyl CoA.
Utilisation certains intermédiaires du cycle à d’autres fins:
α cétoglutarate et oxaloacétate = précurseurs formation:
Acide glutamique,
Acide aspartique
Divers AA.
V. RELATIONS ENTRE CYCLE DE L’ACIDE CITRIQUE ET AUTRES
VOIES MÉTABOLIQUES
Succinyl CoA = précurseurs biosynthèse hème (succinyl CoA + Gly →
ac . aminolevulinique ----→ 1ère étape synthèse porphyrines)
Acétyl CoA précurseur synthèse AG.
AOA = intermédiaire de néoglucogenèse.
Cycle tricarboxylique constitue carrefour métabolique d’importance
fondamentale grâce à:
Fonction amphibolique → source de molécules pour processus
anaboliques (Σthèse , AG, AA, glycogenèse ).
V. RELATIONS ENTRE CYCLE DE L’ACIDE CITRIQUE ET AUTRES
VOIES MÉTABOLIQUES
CONCLUSION
Cycle acide citrique =
Centre métabolique
Carrefour métabolique.
CK = porte d’entrée du métabolisme aérobie de toute molécule susceptible
d’être transformée en groupe acétyle (ou en acide di carboxylique)
CK = importante source de précurseurs:
Formes de mise en réserve molécules énergétiques,
Eléments de synthèse de nombreuses autres molécules telles que AA,
bases nucléotidiques, cholestérol et porphyrine (hème)
