UNIVERSITE CADI AYYAD
FACULTE DES SCIENCES ET TECHNIQUES
GUELIZ-MARRAKECH
Département De Biologie
TD BIOCHIMIE
ACIDES NUCLEIQUES
Exercice 1*
On traite trois oligoribonucléotides par une base forte (KOH ou NaOH) diluée
et par diverses enzymes.
Quels sont les produits obtenus pour chaque traitement ?
Séquences pApUpGpUpCpAp UpCpApCpGp pCpApUpCpG
Traitement
NaOH ou KOH
diluée
RNase T1
RNase T2
Phosphodiestérase
de
venin de serpent.
Phosphodiestérase
de
Rate de boeuf.
Exercice 2*
Soit le polynucléotide : pApGpCpTpCpTpCpApC-OH
1- Ecrire la structure détaillée des 2 nucléotides 5' et 3'.
2- Ce petit fragment provient-il d'un ARN ou d'un ADN ? Pourquoi ?
3- Ecrire la séquence complémentaire.
4- Comment se fait l'appariement entre les 2 séquences complémentaires
a- Quel type de liaison ?
b- Donner un exemple.
5- On a mesuré la densité optique de la solution contenant le double brin à 260 nm.
A=1.0. Quelques instants plus tard cette densité optique est mesurée à nouveau
à la même longueur d'onde, A=1,30
a- Quel traitement a-t-on fait subir à la solution entre les deux mesures ?
b- Que doit-on faire pour retrouver la valeur de DO du départ (A=1,0)
Exercice 3*
Pour déterminer la structure d'un oligoribonucléotide composé de
4A,3G,4C,2U, nous avons procédé aux expériences suivantes :
1) Le traitement par la phosphodiéstérase de venin de serpent (P.D.V.S) après
action d'une phosphomonoesterase (P.M.E) libère au bout d'un temps donné
successivement : pCet pG.
2) Le traitement par la phosphodiésterase de rate de bœuf (P.D.R.B) après
action d'une phosphomonoestérase (P.M.E) libère au bout d'un temps donné et
successivement Ap et Cp.
3) L'hydrolyse par la Ribonucléase T1 (Rnase T1) donne : Cp, CpApGp,
UpApCpGp, pApCpUpApGp.
4) L'hydrolyse par la Ribonucléase T2 (Rnase T2) donne : pAp, GpCp, CpUpAp,
GpUpAp, CpGpCpAp.
- Donner la structure de cet oligoribonucléotide en indiquant à l'aide
d'abréviations, notées dans le texte, les sites de coupure des différentes enzymes
utilisées.
Exercice 4
L’hydrolyse d’un oligonucléotide par la ribonucléoase T1 donne : Ap, un
pentanucléotide contenant de l’Uracile, de la cytosine et de la guanine, et un
trinucléotide (A,G, U). par ailleurs, une hydrolyse de l’oligonucléotide entier par la
ribonucléase pancréatique donne Cp, 2Up et 3 dinucléotides GpAp, GpCp, ApUp.
Proposer les divers cas de structures possibles pour cet oliganucléotide.
Exercice 5
Un oligoriboncléotide a pour composition en bases :3A, 3G, 3U, 2C.
a) Le traitement par la phosphodiestérase de venin de serpent donne au bout d’un
temps court une petite quantité de pC.
b) l’hydrolyse par la ribonucléase pancréatique de boeuf donne C, Up, un
dinucléotide GpUp, un trinucléotide contenant A,G,U et un tétranucléotide
contenant C, G, 2A.
c) l’hydrolyse par la ribonucléase T1 donne Gp, un dinucléotide UpC, un
trinucléotide CpApGp et un pentanucléotide UpUpApApGp.
Déterminer la structure de cet oligoribonucléotide.
Exercice 6*
L’ADN des noyaux cellulaires d’un tissu animal mesure 0,68 m.
a) Combien contient-il de nucléotides ?
b) Calculer son poids moléculaires.
L’analyse de cet ADN après hydrolyse totale donne un rapport molaire A/G = 2
On compare cet ADN à un ADN bactérien dont le rapport est égale A/G = 4.
c- Calculer le % de A,G, C et T dans les 2 cas
d- Lequel des deux aura-t-il le point de fusion le plus élevé ? Pourquoi ?
