分子动力学仿真软件：GROMACS_（12）.常见问题与故障排除

常见问题与故障排除

在使用分子动力学仿真软件 GROMACS 进行二次开发时，经常会遇到各种问题。本节将详细介绍一些常见的问题及其解决方法，帮助开发者在开发过程中更顺利地进行。

1. 编译问题

1.1 缺少依赖库

问题描述：在编译 GROMACS 时，如果系统缺少某些依赖库，编译过程会失败并显示错误信息。

解决方法：首先，确保所有必要的依赖库都已安装。常见的依赖库包括 MPI、FFTW、GMXAPI 等。可以通过以下命令安装这些依赖库：

# 安装 MPI

sudo apt-get install libopenmpi-dev



# 安装 FFTW

sudo apt-get install libfftw3-dev