温度和压力控制
在分子动力学模拟中,温度和压力是两个非常重要的热力学参数。正确的温度和压力控制可以确保模拟系统的热力学状态与实验条件相匹配,从而提高模拟结果的可靠性和准确性。LAMMPS 提供了多种方法来控制系统的温度和压力,包括恒温器(thermostats)和恒压器(barostats)。
温度控制
温度控制是通过恒温器来实现的,LAMMPS 中常用的恒温器包括 Nose-Hoover 恒温器、Berendsen 恒温器和 Langevin 恒温器。
Nose-Hoover 恒温器
Nose-Hoover 恒温器是一种基于扩展系综的方法,通过引入虚构的热浴粒子来控制系统的温度。这种方法能够精确地控制系统的温度,并且在长时间模拟中表现良好。
使用方法
# 定义 Nose-Hoover 恒温器
fix 1 all nvt temp 300.0 300.0 100.0
-
fix 1 all nvt
:定义一个编号为 1 的 Nose-Hoover 恒温器,作用于所有原子。 -
temp 300.0 300.0 100.0
:设置目标温度为 300 K,温度弛豫时间为 100 时间步长。