Fundamentos de biologia
molecular
 DNA
Molécula da vida
 molécula simples e
repetitiva
Genes >> DNA >>
isolados, alterados,
reproduzidos aos
milhões,
transplantados para
outro organismo vivo
» NOVO CAPÍTULO
NA ENGENHARIA
GENÉTICA
Chromosomes
1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 X Y
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• DNA + proteínas (histonas) » organização estrutural
• nucleossomo
• solenóide
• alças no esqueleto de proteínas não histônicas
• Compactação do DNA » variável » máximo na divisão celular
DNA
DNA
maior que o necessário para codificar as 100.000 diferentes proteínas
2 a 3% efetivamente codifica proteínas
expressão diferenciada de genes dependendo da fase do
desenvolvimento e tipo de tecido
 controle genético eficiente para definir a ativação de genes »
seqüências promotoras
seqüências promotoras e genes reguladores
genes reguladores
Células Humanas
Estrutura química simples e não variável nos diversos organismos »
seqüência de nucleotídeos
nucleotídeos
• Nucleotídeos
• 1 base nitrogenada » Purina (A, G), Pirimidina (C, T) - DNA; RNA
(Uracil - U)
• Pentose » Desoxirribose - DNA; Ribose - RNA
• Grupo Fosfato (PO4)
DNA > Auto-duplicação ou auto-replicação
Auto-duplicação ou auto-replicação
Quebra das pontes de hidrogênio
 União de nucleotídeos - DNA polimerase
 semiconservativa - moléculas recém-formadas são idênticas
 Garante a transmissão do material genético de uma células para as
descendentes
 Comanda a Síntese de proteínas
Ácidos nucléicos
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Estrutura molecular - proposta por Watson e Crick - 1953
Estrutura molecular - proposta por Watson e Crick - 1953
 DNA
DNA
 duas cadeias polinucleotídicas em espiral, antiparalelas - 5’-3’, 3’-5’
 estabilidade da dupla hélice » interação entre as bases complementares » pontes de
hidrogênio- duplas entre A e T e triplas entre C e G
 associação de bases » base grande (purica) + base pequena (pirimidica) » A - T; G - C
» maior estabilidade
 proporção A/T = G/C
 “Longa cadeia de nucleotídeos, semelhante a uma escada de corda enrolada em
hélice, com os açúcares e fosfatos formando os corrimões e as bases os degraus”
DNA: a base molecular das
mutações
 RNA
RNA
 Composição química »Ribose e Uracil
 Estrutura molecular
Uma cadeia de nucleotídeos
Composição de bases NÃO restrita às igualdades G=C e A=U
 Em circunstâncias especiais » dupla hélice » RNAt
RNA - Tipos e funções
 Transcritos no molde de DNA » RNA-polimerase
 Mesma estrutura básica
 Tamanhos diferentes
 Seqüências de bases desiguais » funções específicas
 RNAm; RNAt; RNAr
Código Genético
Código Genético
 relação entre seqüência de bases
nitrogenadas e a seqüência de
aminoácidos na proteína
 Unidade de informação genética ou
códon » trincas
 Bases agrupadas 3 a 3 » 64 arranjos
» 20 aminoácidos diferentes ->
somente algumas trincas especificam
aminoácidos ou aminoácidos devem
ser especificados por mais de um tipo
de trinca » “código genético é
degenerado ou redundante”
 É universal - os mesmos
aminoácidos são codificados pelas
mesmas trincas em todos os
organismos
 Há códons de iniciação e terminação
DNA C A A C G T C C G A C A A G T
RNAm G U U G C A G G C U G U U C A
Proteína valina alanina glicina cisteína serina
Síntese de proteínas
SÍNTESE DE PROTEÍNAS
exons introns
Transcrito primário
Aproximação dos exons
Remoção dos introns e junção
dos exons
RNAm
+
Modificações pós traducionais
Modificações pós traducionais
São as unidades funcionais do DNA cromossômico
Cada gene não só codifica a estrutura de algum
produto celular, com também transporta consigo os
botões de controle que determinam, quando onde e
quanto cada produto será sintetizado.
Genes
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Exon 1
Exon 1 Exon 2
Exon 2 Exon 3
Exon 3 Exon 4
Exon 4
Intron 1
Intron 1 Intron 2
Intron 2 Intron 3
Intron 3
5’
5’ 3’
3’
Eukaryote
Eukaryote
Prokaryote
Prokaryote
5’
5’ 3’
3’
Promoter region
Promoter region
• TATA box
TATA box
• CAAT box (in mammals)
CAAT box (in mammals)
• GC box (GGGCGGG)
GC box (GGGCGGG)
Initiation codon
Initiation codon
Polyadenylation
Polyadenylation
signal
signal
AATAA
AATAA
Promoter region
Promoter region
• Shine-Dalgarno box (AGGAGG)
Shine-Dalgarno box (AGGAGG)
• Pribnow box (TATAAT)
Pribnow box (TATAAT)
• -35 site (TTGACA)
-35 site (TTGACA)
Initiation codon
Initiation codon Stop codon
Stop codon
A variação hereditária do genoma é a base da genética humana e médica
Alelos: formas alternativas de informações genéticas em um determinado
locus
Genótipo: Constituição genética do indivíduo - pode ser relativo ao conjunto
(em todos os loci) ou em um locus isolado
Fenótipo: expressão observável de um genótipo como um caracter
morfológico, bioquímico ou molecular
Homozigoto: par de alelos idênticos
Heterozigoto: alelos diferentes - um normal e um alterado
Heterozigoto composto: alelos mutantes diferentes
Aplicados para o indivíduo ou genótipo
Erros na replicação do DNA  fonte de variabilidade  componente
essencial no processo de evolução
 Mutações: alterações do material genético de um organismo
Espontâneas
 Induzidas - agentes mutagênicos
Classificação Mecanismo
do genoma Não disjunção dos cromossomos
dos Cromossomos Rearranjo dos cromossomos
dos genes mutação de pares de bases
Tipos de mutações nas doenças
Tipos de mutações nas doenças
genéticas humanas
genéticas humanas
Substituição de nucleotídeos (puntiformes)
Substituição de nucleotídeos (puntiformes)
De sentido trocado - troca de aminoácidos
Sem sentido - “Stop codon” prematuro
Alteram sítio de “splicing”
Deleções e Inserções
Deleções e Inserções
Mudança da matriz de leitura
Deleções e inserções de códons
Duplicações de genes
Inserção de elementos repetidos Thompson &Thompson
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Transição: substituição de uma purina por outra purina ou de
uma pirimidina por outra pirimidina (A – G e C – T)
DNA: AGA TGA CGG TTT GCA
RNA: UCU ACU GCC AAA CGU
Proteína: -Ser—Thr—Ala—Lys—Arg-
Transição A - G
DNA: GGA TGA CGG TTT GCA
RNA: CCU ACU GCC AAA CGU
Proteína: -Pro—Thr—Ala—Lys—Arg-
Transversão: substituição de uma purina por uma pirimidina
ou vice-versa ( A ou G – C ou T)
Transversão A - T
RNA: UCU ACU GCC AAA CGU
Proteína: -Ser—Thr—Ala—Lys—Arg-
DNA: AGA TGA CGG TTT GCA
DNA: TGA TGA CGG TTT GCA
RNA: ACU ACU GCC AAA CGU
Proteína: -Thr—Thr—Ala—Lys—Arg-
Transversão que provoca a anemia falciforme
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DNA: AGA TGA CGG TTT GCA
RNA: UCU ACU GCG AAA AGU
Proteína: -Ser—Thr—Ala—Lys—Arg-
Inserção de T
DNA: AGT ATG ACG GTT TGC A...
RNA: UCA UAC UGC CAA ACG U...
Proteína: -Ser—Tyr—Cys—Glu—Thr---
Mutação de mudança organizacional (adição ou deleção):
- alteram a estrutura de leitura de todas as trincas de pb
Deleção de T
DNA: AGT ATG ACG GTT TGC A...
RNA: UCA UAC UGC CAA ACG U...
Proteína: -Ser—Tyr—Cys—Glu—Thr---
DNA: AGT AGA CGG TTT GCA
RNA: UCA UCU GCC AAA CGU
Proteína: -Ser—Ser—Ala—Lys—Arg---
SOMÁTICAS X GERMINATIVAS
Efeitos sobre o fenótipo:
•Nenhum
•Pequeno
•Grande
“Uma mutação não é útil nem prejudicial em abstrato, só pode ser útil ou
prejudicial em algum ambiente”.
Th. Dobzhansky
DOENÇAS GENÉTICAS DAS CÉLULAS SOMÁTICAS
• Indivíduos geneticamente “normais” ao nascimento - Doenças >
mutações nas células somáticas
• Fatores ambientais: Vírus
Radiação
Agentes Químicos
Danos ao material genético
• CÂNCER
• ENVELHECIMENTO
CELULAR
Origem das doenças genéticas
Doença genética
genes
meio ambiente
•DOENÇAS MONOGÊNICAS
 Causadas por alterações em um único gene
 Mutação presente em homozigose ou
heterozigose
Exemplos: hemofilia, anemia falciforme,
talassemias,
•DOENÇAS MULTIFATORIAIS
 Fatores ambientais - estresse, cigarro, dieta, etc...
 Recorrência familiar mas sem padrão de
transmissão típico
 Freqüência maior que as doenças monogênicas
 Exemplos: Doenças coronárias, esquizofrenia,
asma, diabetes
•DOENÇAS
CROMOSSôMICAS
Deficiência ou excesso de
cromossomos inteiros ou de
•segmentos cromossômicos - erros
na divisão celular
Envolvem muitos genes
Manifestam-se como Síndrome -
afetam vários órgãos e sistemas
Fenótipo alterado > desequilíbrio
do material genético
• > nenhum gene
obrigatoriamente anormal
Exemplos: S. Down, Trissomia do
18, S. de Turner, S. Klinefelter
POLIMORFISMO
POLIMORFISMO
•Ocorrência de múltiplos alelos num lócus onde pelo menos dois
Ocorrência de múltiplos alelos num lócus onde pelo menos dois
alelos aparecem com freqüências superiores a 1%
alelos aparecem com freqüências superiores a 1%
Proteína
Com efeito no fenótipo
Sem efeito no fenótipo
DNA
Marcadores genéticos Thompson &Thompson
PADRÕES DE HERANÇA
PADRÕES DE HERANÇA
• AUTOSSÔMICO
AUTOSSÔMICO
•LIGADO AO CROMOSSOMO SEXUAL
LIGADO AO CROMOSSOMO SEXUAL
•Dominantes
Dominantes
•Recessivos
Recessivos
Homozigose
Homozigose
Heterozigose
Heterozigose

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  • 1. Fundamentos de biologia molecular  DNA Molécula da vida  molécula simples e repetitiva Genes >> DNA >> isolados, alterados, reproduzidos aos milhões, transplantados para outro organismo vivo » NOVO CAPÍTULO NA ENGENHARIA GENÉTICA
  • 2. Chromosomes 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 X Y
  • 4. • DNA + proteínas (histonas) » organização estrutural • nucleossomo • solenóide • alças no esqueleto de proteínas não histônicas • Compactação do DNA » variável » máximo na divisão celular
  • 5. DNA DNA maior que o necessário para codificar as 100.000 diferentes proteínas 2 a 3% efetivamente codifica proteínas expressão diferenciada de genes dependendo da fase do desenvolvimento e tipo de tecido  controle genético eficiente para definir a ativação de genes » seqüências promotoras seqüências promotoras e genes reguladores genes reguladores Células Humanas
  • 6. Estrutura química simples e não variável nos diversos organismos » seqüência de nucleotídeos nucleotídeos • Nucleotídeos • 1 base nitrogenada » Purina (A, G), Pirimidina (C, T) - DNA; RNA (Uracil - U) • Pentose » Desoxirribose - DNA; Ribose - RNA • Grupo Fosfato (PO4) DNA > Auto-duplicação ou auto-replicação Auto-duplicação ou auto-replicação Quebra das pontes de hidrogênio  União de nucleotídeos - DNA polimerase  semiconservativa - moléculas recém-formadas são idênticas  Garante a transmissão do material genético de uma células para as descendentes  Comanda a Síntese de proteínas Ácidos nucléicos
  • 8. Estrutura molecular - proposta por Watson e Crick - 1953 Estrutura molecular - proposta por Watson e Crick - 1953  DNA DNA  duas cadeias polinucleotídicas em espiral, antiparalelas - 5’-3’, 3’-5’  estabilidade da dupla hélice » interação entre as bases complementares » pontes de hidrogênio- duplas entre A e T e triplas entre C e G  associação de bases » base grande (purica) + base pequena (pirimidica) » A - T; G - C » maior estabilidade  proporção A/T = G/C  “Longa cadeia de nucleotídeos, semelhante a uma escada de corda enrolada em hélice, com os açúcares e fosfatos formando os corrimões e as bases os degraus”
  • 9. DNA: a base molecular das mutações
  • 10.  RNA RNA  Composição química »Ribose e Uracil  Estrutura molecular Uma cadeia de nucleotídeos Composição de bases NÃO restrita às igualdades G=C e A=U  Em circunstâncias especiais » dupla hélice » RNAt RNA - Tipos e funções  Transcritos no molde de DNA » RNA-polimerase  Mesma estrutura básica  Tamanhos diferentes  Seqüências de bases desiguais » funções específicas  RNAm; RNAt; RNAr
  • 11. Código Genético Código Genético  relação entre seqüência de bases nitrogenadas e a seqüência de aminoácidos na proteína  Unidade de informação genética ou códon » trincas  Bases agrupadas 3 a 3 » 64 arranjos » 20 aminoácidos diferentes -> somente algumas trincas especificam aminoácidos ou aminoácidos devem ser especificados por mais de um tipo de trinca » “código genético é degenerado ou redundante”  É universal - os mesmos aminoácidos são codificados pelas mesmas trincas em todos os organismos  Há códons de iniciação e terminação
  • 12. DNA C A A C G T C C G A C A A G T RNAm G U U G C A G G C U G U U C A Proteína valina alanina glicina cisteína serina
  • 14. SÍNTESE DE PROTEÍNAS exons introns Transcrito primário Aproximação dos exons Remoção dos introns e junção dos exons RNAm +
  • 16. São as unidades funcionais do DNA cromossômico Cada gene não só codifica a estrutura de algum produto celular, com também transporta consigo os botões de controle que determinam, quando onde e quanto cada produto será sintetizado. Genes
  • 19. Exon 1 Exon 1 Exon 2 Exon 2 Exon 3 Exon 3 Exon 4 Exon 4 Intron 1 Intron 1 Intron 2 Intron 2 Intron 3 Intron 3 5’ 5’ 3’ 3’ Eukaryote Eukaryote Prokaryote Prokaryote 5’ 5’ 3’ 3’ Promoter region Promoter region • TATA box TATA box • CAAT box (in mammals) CAAT box (in mammals) • GC box (GGGCGGG) GC box (GGGCGGG) Initiation codon Initiation codon Polyadenylation Polyadenylation signal signal AATAA AATAA Promoter region Promoter region • Shine-Dalgarno box (AGGAGG) Shine-Dalgarno box (AGGAGG) • Pribnow box (TATAAT) Pribnow box (TATAAT) • -35 site (TTGACA) -35 site (TTGACA) Initiation codon Initiation codon Stop codon Stop codon
  • 20. A variação hereditária do genoma é a base da genética humana e médica Alelos: formas alternativas de informações genéticas em um determinado locus Genótipo: Constituição genética do indivíduo - pode ser relativo ao conjunto (em todos os loci) ou em um locus isolado Fenótipo: expressão observável de um genótipo como um caracter morfológico, bioquímico ou molecular Homozigoto: par de alelos idênticos Heterozigoto: alelos diferentes - um normal e um alterado Heterozigoto composto: alelos mutantes diferentes Aplicados para o indivíduo ou genótipo
  • 21. Erros na replicação do DNA  fonte de variabilidade  componente essencial no processo de evolução  Mutações: alterações do material genético de um organismo Espontâneas  Induzidas - agentes mutagênicos Classificação Mecanismo do genoma Não disjunção dos cromossomos dos Cromossomos Rearranjo dos cromossomos dos genes mutação de pares de bases
  • 22. Tipos de mutações nas doenças Tipos de mutações nas doenças genéticas humanas genéticas humanas Substituição de nucleotídeos (puntiformes) Substituição de nucleotídeos (puntiformes) De sentido trocado - troca de aminoácidos Sem sentido - “Stop codon” prematuro Alteram sítio de “splicing” Deleções e Inserções Deleções e Inserções Mudança da matriz de leitura Deleções e inserções de códons Duplicações de genes Inserção de elementos repetidos Thompson &Thompson
  • 25. Transição: substituição de uma purina por outra purina ou de uma pirimidina por outra pirimidina (A – G e C – T) DNA: AGA TGA CGG TTT GCA RNA: UCU ACU GCC AAA CGU Proteína: -Ser—Thr—Ala—Lys—Arg- Transição A - G DNA: GGA TGA CGG TTT GCA RNA: CCU ACU GCC AAA CGU Proteína: -Pro—Thr—Ala—Lys—Arg-
  • 26. Transversão: substituição de uma purina por uma pirimidina ou vice-versa ( A ou G – C ou T) Transversão A - T RNA: UCU ACU GCC AAA CGU Proteína: -Ser—Thr—Ala—Lys—Arg- DNA: AGA TGA CGG TTT GCA DNA: TGA TGA CGG TTT GCA RNA: ACU ACU GCC AAA CGU Proteína: -Thr—Thr—Ala—Lys—Arg-
  • 27. Transversão que provoca a anemia falciforme
  • 29. DNA: AGA TGA CGG TTT GCA RNA: UCU ACU GCG AAA AGU Proteína: -Ser—Thr—Ala—Lys—Arg- Inserção de T DNA: AGT ATG ACG GTT TGC A... RNA: UCA UAC UGC CAA ACG U... Proteína: -Ser—Tyr—Cys—Glu—Thr--- Mutação de mudança organizacional (adição ou deleção): - alteram a estrutura de leitura de todas as trincas de pb
  • 30. Deleção de T DNA: AGT ATG ACG GTT TGC A... RNA: UCA UAC UGC CAA ACG U... Proteína: -Ser—Tyr—Cys—Glu—Thr--- DNA: AGT AGA CGG TTT GCA RNA: UCA UCU GCC AAA CGU Proteína: -Ser—Ser—Ala—Lys—Arg---
  • 31. SOMÁTICAS X GERMINATIVAS Efeitos sobre o fenótipo: •Nenhum •Pequeno •Grande “Uma mutação não é útil nem prejudicial em abstrato, só pode ser útil ou prejudicial em algum ambiente”. Th. Dobzhansky
  • 32. DOENÇAS GENÉTICAS DAS CÉLULAS SOMÁTICAS • Indivíduos geneticamente “normais” ao nascimento - Doenças > mutações nas células somáticas • Fatores ambientais: Vírus Radiação Agentes Químicos Danos ao material genético • CÂNCER • ENVELHECIMENTO CELULAR
  • 33. Origem das doenças genéticas Doença genética genes meio ambiente •DOENÇAS MONOGÊNICAS  Causadas por alterações em um único gene  Mutação presente em homozigose ou heterozigose Exemplos: hemofilia, anemia falciforme, talassemias, •DOENÇAS MULTIFATORIAIS  Fatores ambientais - estresse, cigarro, dieta, etc...  Recorrência familiar mas sem padrão de transmissão típico  Freqüência maior que as doenças monogênicas  Exemplos: Doenças coronárias, esquizofrenia, asma, diabetes •DOENÇAS CROMOSSôMICAS Deficiência ou excesso de cromossomos inteiros ou de •segmentos cromossômicos - erros na divisão celular Envolvem muitos genes Manifestam-se como Síndrome - afetam vários órgãos e sistemas Fenótipo alterado > desequilíbrio do material genético • > nenhum gene obrigatoriamente anormal Exemplos: S. Down, Trissomia do 18, S. de Turner, S. Klinefelter
  • 34. POLIMORFISMO POLIMORFISMO •Ocorrência de múltiplos alelos num lócus onde pelo menos dois Ocorrência de múltiplos alelos num lócus onde pelo menos dois alelos aparecem com freqüências superiores a 1% alelos aparecem com freqüências superiores a 1% Proteína Com efeito no fenótipo Sem efeito no fenótipo DNA Marcadores genéticos Thompson &Thompson
  • 35. PADRÕES DE HERANÇA PADRÕES DE HERANÇA • AUTOSSÔMICO AUTOSSÔMICO •LIGADO AO CROMOSSOMO SEXUAL LIGADO AO CROMOSSOMO SEXUAL •Dominantes Dominantes •Recessivos Recessivos Homozigose Homozigose Heterozigose Heterozigose