3. Importância do Diagnóstico Laboratorial
• Diferenciação de agentes que causam a mesma
síndrome clínica
• Identificação de patógenos novos
• Diferenciação de fases de doença
• Triagem e avaliação de tecidos e órgãos
• Imunidade pós vacinal
• Vigilância epidemiológica
• Estudo epidemiológico
• Iniciar tratamento específico
4. Tipos de métodos diagnósticos
Métodos Direitos
Pesquisam elementos
da partícula viral
(antígenos, genoma,
partícula inteira)
Métodos
Indireitos
Pesquisam
RESPOSTA do
hospedeiro
(Anticorpos)
5. Tipos de métodos diagnósticos
Métodos Clássicos
Isolamento viral em
sistema hospedeiro
Métodos Rápidos
Imonológicos
Biologia Molecular
Microscopia eletrônica
25. Diagnóstico rápido
Inibição da Hemaglutinação:
- Capacidade de alguns vírus
em aglutinar hemácias é
bloqueada por anticorpos
específicos contra
determinado vírus
quantificação!
- Rápida, fácil execução,
identifica exatamente um
vírus;
- Restrito
28. Reação em cadeia da polimerase - PCR
Ampliar o número de determinada sequência
de DNA
Mimetizando a duplicação in vivo!
29. • Aquecimento – Resfriamento cíclico
• Temperatura máxima ~100°C
• Temperatura de desnaturação ~95°C
• Temperatura ótima Taqpolimerase ~72°C
• Anelamento: variável
In vitro
http://biologiateista.blogspot.com.br/2010/09/complexidade-da-vida-parte-i-dna.html
Reação em cadeia da polimerase - PCR
30. • Primers (iniciadores) DNA:
• Senso e Anti-senso
• Complementariedade à sequência alvo do
gene: desenhados!
• Permitem a ação da Taq
In vitro
http://www.pcrstation.com/pcr-primer/
Reação em cadeia da polimerase - PCR
32. PC
.
In vitro
Água autoclavada e deionizada: completa o volume
final da reação
Tampão 10X concentrado: 10 mM Tris-HCl pH 8,0 ,
50mM KCl mantém o pH ótimo para a reação
Cloreto de Magnésio (MgCl2): otimiza a atividade da
Taq polimerase. Concentração: 0,5 a 2,5 mM
dNTP mix
10x buffer MgCl2 Taq pol
Reação em cadeia da polimerase - PCR
34. PC
Ciclagem (30 – 40x)
Desnaturação do DNA (95°C – 30’’ a 1’)
Temperatura de anelamento variável
Extensão 72°C (30’’ a 1’)
Desnaturação Inicial
95° 10’
Extensão Final
72°C 7’
Temperatura de anelamento ~5°C abaixo da Tm (melting Temperature) do primer;
Para calcular Tm de um primer : 2 (A + T) + 4 (G + C)
Reação em cadeia da polimerase - PCR
40. Variações do PCR: Nested
Nested PCR pode ser uma alternativa para
melhorar a especificidade e a sensibilidade da
PCR
1o PCR: primers externos
Produto do 1o PCR :
template para o 2º PCR
2o PCR: primers internos
Produto do 2º PCR
41. - Para vírus de genoma RNA, pesquisa de RNAm
-Realização da reação de
transcrição reversa ->
Transcriptase Reversa
-Cuidados a tomar durante o
preparo do c-DNA
Variações do PCR: RT-PCR
42. Ensaio quantitativo, rápido, dispensa
realização do gel
Variações do PCR: PCR em tempo real
Baseado na emissão de fluorescência e detecção
por Laser
• TaqMan
• Syber Green
• Molecular beacon
45. Sybr Green®
Novaes et al 2004
http://www.gene-quantification.de/chemistry.html
46. Quantificação: Curva de calibração
a partir de concentrações
conhecidas de DNA
Representação de um plot da
amplificação em tempo real:
3 fases
linha basal: não houve
clivagem suficente do
corante-repórter para que se
possa detectar a
fluorescência
fase log: a quantidade de
amplicon dobra a cada ciclo
fase platô: não há mais
aumento no número de
ampliconsxx
PCR em Tempo Real