100% found this document useful (12 votes)
135 views

Computational Hemodynamics Theory, Modelling and Applications full text download

The document is a preface and introduction to the book 'Computational Hemodynamics: Theory, Modelling and Applications,' which explores the integration of computational modeling and simulation in cardiovascular studies. It highlights the emergence of Computational Hemodynamics (CHD) as a crucial field for understanding blood flow mechanics and improving medical treatments through advanced technologies. The book aims to provide accessible knowledge for students from various backgrounds, covering fundamental concepts, applications, and practical demonstrations in CHD.
Copyright
© © All Rights Reserved
We take content rights seriously. If you suspect this is your content, claim it here.
Available Formats
Download as PDF, TXT or read online on Scribd
100% found this document useful (12 votes)
135 views

Computational Hemodynamics Theory, Modelling and Applications full text download

The document is a preface and introduction to the book 'Computational Hemodynamics: Theory, Modelling and Applications,' which explores the integration of computational modeling and simulation in cardiovascular studies. It highlights the emergence of Computational Hemodynamics (CHD) as a crucial field for understanding blood flow mechanics and improving medical treatments through advanced technologies. The book aims to provide accessible knowledge for students from various backgrounds, covering fundamental concepts, applications, and practical demonstrations in CHD.
Copyright
© © All Rights Reserved
We take content rights seriously. If you suspect this is your content, claim it here.
Available Formats
Download as PDF, TXT or read online on Scribd
You are on page 1/ 16

Computational Hemodynamics Theory, Modelling and

Applications

Visit the link below to download the full version of this book:

https://medipdf.com/product/computational-hemodynamics-theory-modelling-and-appl
ications/

Click Download Now


Jiyuan Tu Kelvin Kian Loong Wong
School of Aerospace Mechanical and School of Aerospace Mechanical and
Manufacturing Engineering Manufacturing Engineering
RMIT University RMIT University
Bundoora Bundoora
Victoria Victoria
Australia Australia

Kiao Inthavong
School of Aerospace Mechanical and
Manufacturing Engineering
RMIT University
Bundoora
Victoria
Australia

ISSN 1618-7210 ISSN 2197-5647 (electronic)


Biological and Medical Physics, Biomedical Engineering
ISBN 978-94-017-9593-7    ISBN 978-94-017-9594-4 (eBook)
DOI 10.1007/978-94-017-9594-4

Library of Congress Control Number: 2014954751

Springer Dordrecht Heidelberg New York London


© Springer Science+Business Media Dordrecht 2015
This work is subject to copyright. All rights are reserved by the Publisher, whether the whole or part of
the material is concerned, specifically the rights of translation, reprinting, reuse of illustrations, recita-
tion, broadcasting, reproduction on microfilms or in any other physical way, and transmission or in-
formation storage and retrieval, electronic adaptation, computer software, or by similar or dissimilar
methodology now known or hereafter developed.
The use of general descriptive names, registered names, trademarks, service marks, etc. in this publica-
tion does not imply, even in the absence of a specific statement, that such names are exempt from the
relevant protective laws and regulations and therefore free for general use.
The publisher, the authors and the editors are safe to assume that the advice and information in this book
are believed to be true and accurate at the date of publication. Neither the publisher nor the authors or the
editors give a warranty, express or implied, with respect to the material contained herein or for any errors
or omissions that may have been made.

Printed on acid-free paper

Springer is part of Springer Science+Business Media (www.springer.com)


Preface

Traditionally, cardiovascular studies have been limited to medical textbooks and


courses, taught by medical experts. Now, computational modeling and simulation
has infiltrated the medical field which has advanced to a point where it can be cat-
egorized into its own sub fields. The use of Computational Fluid Dynamics (CFD)
for modeling cardiovascular flow leads to a new field of study known as computa-
tional biomedical engineering. In particular when we model blood as a biofluid and
compute its flow, we establish a branch termed as Computational Haemodynamics
(CHD). This new field of engineering constitutes important knowledge in the study
of blood flow mechanics, surgical and medical treatment, and design of biomedical
devices. This has only been possible through the emergence of advanced technolo-
gies in medical imaging, and computers. Since the fundamental principles of CHD
are based on CFD, these two terms are quite similar and used interchangeably in
this book.
This book is designed to convey information pitched at an appropriate level of
knowledge to new students with a diverse background of medicine, physiology,
pharmaceutical science, mechanical engineering, and mathematics. This book can-
not deliver the entire scope of knowledge that is related to cardiovascular modeling.
Rather, it provides an important link between traditional engineering and computa-
tional fields with the medical field. For example, an undergraduate who is trained in
engineering can selectively read the relevant chapters of the book that provides new
knowledge on the computational simulation or medical aspects.
There is a diverse range of CFD books in the market are written with different
levels of complexity. To ensure the reader is not overwhelmed by overly advanced
mathematical notation and theory, this book describes fundamental mathematical
ideas, coupled with sufficient description and backed up with examples. It is intui-
tive and systematically structured for enhancing the learning process and allowing
students to be able to quickly use CFD practically. Nevertheless, a fundamental
knowledge of calculus such as basic anti- and differentiation is still required prior to
reading the book. With the hands on practice and reading, this book can enable CFD
beginners to efficiently perform reliable CFD simulations for the CHD applications.
The book begins with Chap. 1, which prepares the reader for an overview of
CHD, its advantages and disadvantages, a preliminary understanding of CHD, and

v
vi Preface

its numerous applications in the cardiovascular system. It aims to initiate curiosity


and stimulate creativity for the reader to think of possible solutions to engineering
problems related to cardiovascular flow.
In Chap. 2, the human cardiovascular system is presented concisely. By provid-
ing the description of the cardiovascular anatomy and physiology at an elementary
level, this chapter is useful for readers that have previously not received any form of
medical training. An understanding of the cardiovascular anatomy provides a basis
for an accurate computational fluid flow setup for geometrical reconstruction based
on medical imaging, definition of the relevant anatomical structures, and determin-
ing cardiovascular flow boundary conditions.
Medical image reconstruction of the cardiovascular anatomy is covered in
Chap. 3, which introduces the reader to medical imaging, geometrical reconstruc-
tion, manufacturing or reverse engineering, and Computer-Aided Design (CAD).
The book steps through all of the processes from medical image scanning (MRI or
CT scans) through to segmentation, and leading to model reconstruction. Important
features of each process with informative description of the approach used or avail-
able software are given in detail.
Chap. 4 presents the fundamentals of haemodynamics, firstly introducing the
properties of blood and then its flow properties. Since blood flow is enclosed by
the arterial walls, it is an example of the well-established internal pipe flow theory.
This incorporates the laws of fluid dynamics and its interaction with solid surfaces.
Characteristic flow features of blood flow in different regions of the circulatory
system are presented to exemplify its behaviour.
In Chap. 5, the governing equations of fluid flow, i.e. the Navier-Stokes equa-
tions are introduced. Each term in the equations is described in such a way that the
reader can appreciate its physical interpretation and impact on the flow. A brief
introduction to turbulence and its modelling is also given, which is quite unusual
for this type of book. However we feel that since cardiovascular flows through
stenosed arteries and some medical devices will exhibit some form of turbulence,
it is worth mentioning here. A summary of the different turbulence models is given
with guidelines on setting up the different models. A derivation of the equations for
solid dynamics is given with an emphasis on the elastic properties of arteries. The
discretisation of the continuum equations for the fluid and solid dynamics onto dis-
crete points in a computational domain are shown using the more well-known meth-
ods that include the Finite Difference, Finite Volume, and Finite Element Methods.
These methods are solved algebraically using both direct and iterative methods.
The coupling of the fluid and solid domains produce the Fluid-Structure-Interaction
(FSI). This takes place at a shared interface where the fluid and solid meet. Force
loadings and structural deformation results are passed from one analysis to the other
and the coupling approaches are described. A major difficulty with FSI is the stabil-
ity and convergence and these issues are discussed.
Description of mesh development for different anatomies are described in
Chap. 6. The discretised equations from Chap. 5 are transferred to a correspond-
ing discrete set of points in flow field where solutions of the flow variables such
as the velocity, pressure, temperature, and deformation are performed. Both static
Preface vii

and fluid-structure-interaction meshing are presented. Generation of a quality mesh


requires both a good sense of creativity and technical knowledge. Therefore, this
chapter provides guidelines to the reader prior to delving into the interesting ex-
periments of meshing different anatomical models. Different types of mesh and its
setup for simplified and more advanced geometries are illustrated without present-
ing overly complicated mathematical algorithms. Furthermore guidelines and best
practices are given for developing quality meshes and material presented will give
the reader an introduction into mesh creation.
Having laid the groundwork to establish a strong theoretical base, Chap. 7 ap-
plies the foundational knowledge and putting them into practice through selected
demonstrative applications. The entire process from scans to the final data analy-
sis is shown. The examples include models of a stenosed carotid artery, patient
specific carotid bifurcations, stented artery, and cardiac chamber. Post-processing
techniques are presented which involves converting the raw data into graphical rep-
resentations.
Computational simulations increase in complexity when it considers blood flow
within elastic wall structures of the cardiovascular system. Chap. 8 presents some
FSI cardiovascular applications to provide the reader with an overview of some
developments in this emerging field. FSI is being used as a demonstration of practi-
cality of achieving a higher physiological realism in haemodynamics analysis over
simple rigid wall assumptions. Applications include atherosclerosis in carotid bifur-
cation, calcified plaque rupture, aortic aneurysm, as well as coronary artery bypass
graft.
The book culminates with Chap. 9 that explores the future trends and more ad-
vanced modelling techniques. While the detailed treatment of these advanced tech-
niques are beyond the scope of this book, it is hoped that the chapter will stimulate
further enthusiasm in the advancing capability and innovative use of CFD and FEM
for studies related to computational haemodynamics.

 Jiyuan Tu
 Kiao Inthavong
 Kelvin Kian Loong Wong
Acknowledgements

The authors are grateful to Springer, particularly Thijs van Vlijmen for reviewing,
endorsing, and supporting the idea of publishing this book, and to Sara Germans
for assisting in a smooth completion of our project. The authors like to thank re-
search students and colleagues working in the CFD Group at RMIT University for
their hard work and contribution. Special thanks are given to Pongpat Thavornpat-
tanapong and Jingliang Dong who have provided worked examples in geometric
modelling, meshing and simulations for this book. We would like to thank Dr Sher-
man Cheung, Prof David Reutens, Prof Thanh Phan, Dr Songlin Ding, Dr Huafeng
Li and Mr Nelson Choi for their early contribution of patient-specific geometric
reconstruction and CFD simulation, and are grateful to Dr William Yang for his
experimental validation of our simulations.
Prof Tu wants to dedicate this book to the memory of his former supervisors, Prof
Zhong-Yi Hua, former President of Fudan University, who died in a heart attack,
and Prof Shi-Jin Pang who died in a stroke. He would like to express his gratitude to
his wife, Xue, and his son, Tian for their understanding and support. Dr Inthavong
wishes to acknowledge the immense support, contributions, and fruitful discussions
from Laura Frances Portaro; and the constant challenges posed by Antonino Intha-
vong. He would like to dedicate this book to Samuel August Schmidt for the many
nights of online discussions on research, science, and all things academic—until
our next discussion. Dr Wong would like to thank his life mentors—Prof Dhanjoo
N. Ghista, Prof Jagannath Mazumdar and Prof Derek Abbott for their advice and
guidance in his research of computational hemodynamics. He expresses thanks to
his wife, Xindan for her understanding and support during the course of his career
when this book is being written.
Finally, to those that the authors have failed to mention but have been involved
in one way or another, the authors would like to take this opportunity of expressing
their deepest appreciation.

 Jiyuan Tu
 Kiao Inthavong
 Kelvin Kian Loong Wong

ix
Contents

1 Computational Haemodynamics—An Introduction�������������������������������� 1


1.1 What is Computational Haemodynamics (CHD)���������������������������������� 1
1.2 Advantages of CHD������������������������������������������������������������������������������ 3
1.3 Applications in the Cardiovascular System������������������������������������������� 4
1.3.1 CHD as a Research Tool������������������������������������������������������������ 4
1.3.2 CHD as a Training Tool������������������������������������������������������������� 5
1.3.3 Examination of Atherosclerosis������������������������������������������������� 6
1.3.4 Plaque Rupture Risk Assessment���������������������������������������������� 8
1.3.5 Preoperative Assessment of Atherosclerotic Arteries���������������� 9
1.3.6 Surgical Treatment of Atherosclerotic Arteries������������������������� 12
1.3.7 Preoperative Assessment of Aneurysm������������������������������������� 16
1.3.8 Assessment of Medical Devices������������������������������������������������ 17
1.4 Summary����������������������������������������������������������������������������������������������� 18
1.5 Review Questions���������������������������������������������������������������������������������� 19

2 The Human Cardiovascular System���������������������������������������������������������� 21


2.1 Introduction������������������������������������������������������������������������������������������� 21
2.1.1 Functions of the Circulatory System����������������������������������������� 21
2.1.2 Organization of the Cardiovascular System������������������������������ 23
2.2 Physiology of the Cardiovascular System��������������������������������������������� 25
2.2.1 Anatomy of the Heart���������������������������������������������������������������� 25
2.2.2 Cardiac Cycle���������������������������������������������������������������������������� 26
2.2.3 Physiology of the Aorta������������������������������������������������������������� 27
2.2.4 Physiology of the Carotid Bifurcation�������������������������������������� 28
2.2.5 Physiology of the Coronary Arteries����������������������������������������� 31
2.2.6 Physiology of the Vascular Network����������������������������������������� 32
2.2.7 Blood����������������������������������������������������������������������������������������� 34
2.3 Disease of the Cardiovascular System�������������������������������������������������� 35
2.3.1 Atherosclerosis�������������������������������������������������������������������������� 35
2.3.2 Calcification of Lesions in Plaque�������������������������������������������� 36
xi
xii Contents

2.3.3 Aneurysm���������������������������������������������������������������������������������� 38
2.3.4 Thrombosis�������������������������������������������������������������������������������� 39
2.3.5 Stroke���������������������������������������������������������������������������������������� 40
2.4 Summary����������������������������������������������������������������������������������������������� 41
2.5 Review Questions���������������������������������������������������������������������������������� 42

3 Geometric Model Reconstruction��������������������������������������������������������������� 43


3.1 Introduction������������������������������������������������������������������������������������������� 43
3.2 Medical Image Acquistion�������������������������������������������������������������������� 43
3.3 Image Segmentation������������������������������������������������������������������������������ 46
3.3.1 Segmentation Approaches��������������������������������������������������������� 47
3.3.2 Threshold Segmentation������������������������������������������������������������ 47
3.3.3 Edge Based Segmentation��������������������������������������������������������� 49
3.3.4 Region Based Segmentation����������������������������������������������������� 51
3.3.5 Using Specialised Medical Software���������������������������������������� 54
3.3.6 Surface and Volume Reconstruction����������������������������������������� 56
3.4 Examples����������������������������������������������������������������������������������������������� 58
3.4.1 Abdominal Bifurcation�������������������������������������������������������������� 58
3.4.2 Left Atrium�������������������������������������������������������������������������������� 60
3.4.3 Left Ventricle����������������������������������������������������������������������������� 62
3.5 Summary����������������������������������������������������������������������������������������������� 63
3.6 Review Questions���������������������������������������������������������������������������������� 66

4 Fundamentals of Haemodynamics������������������������������������������������������������� 67
4.1 Introduction������������������������������������������������������������������������������������������� 67
4.2 Fluid Properties of Blood���������������������������������������������������������������������� 67
4.3 Viscosity of Blood��������������������������������������������������������������������������������� 69
4.4 Clinical Relevance of Blood Viscosity������������������������������������������������� 71
4.5 Blood Flow Properties�������������������������������������������������������������������������� 72
4.5.1 Shear Force������������������������������������������������������������������������������� 72
4.5.2 Pressure Force��������������������������������������������������������������������������� 73
4.5.3 Laminar and Turbulent Flow����������������������������������������������������� 75
4.6 Introduction to Internal Pipe Flow�������������������������������������������������������� 76
4.6.1 Developing and Fully Developed Regions������������������������������� 76
4.6.2 Laminar and Turbulent Velocity Profiles in a Pipe������������������� 78
4.6.3 Poiseulle’s Law������������������������������������������������������������������������� 81
4.6.4 Bernoulli’s Equation����������������������������������������������������������������� 83
4.6.5 Pressure Drop Estimates����������������������������������������������������������� 85
4.7 Fluid Dynamics of Blood Flow Examples�������������������������������������������� 86
4.7.1 Carotid Artery Bifurcation�������������������������������������������������������� 86
4.7.2 Carotid Artery Bifurcation with Stenosis���������������������������������� 88
4.7.3 Curved Flow in Aortic Arch������������������������������������������������������ 89
4.7.4 Aneursym in Abdominal Aorta������������������������������������������������� 91
4.8 Summary����������������������������������������������������������������������������������������������� 93
4.9 Review Questions���������������������������������������������������������������������������������� 94
Contents xiii

5 Computational Fluid Structure Interaction�������������������������������������������� 95


5.1 Introduction����������������������������������������������������������������������������������������� 95
5.2 Introduction to Fluid Dynamics���������������������������������������������������������� 95
5.2.1 Mass Conservation������������������������������������������������������������������ 96
5.2.2 Momentum Conservation�������������������������������������������������������� 100
5.2.3 Introduction to Turbulence������������������������������������������������������ 106
5.3 Introduction to Solid Mechanics��������������������������������������������������������� 111
5.3.1 Elasticity���������������������������������������������������������������������������������� 111
5.3.2 Plane Stress����������������������������������������������������������������������������� 113
5.3.3 Structural Dynamics Equations����������������������������������������������� 114
5.3.4 Elastic Properties of Arteries��������������������������������������������������� 116
5.4 Computational Methods���������������������������������������������������������������������� 118
5.4.1 Finite Difference Method�������������������������������������������������������� 118
5.4.2 Finite Volume Method������������������������������������������������������������� 122
5.4.3 One-Dimensional Steady State Convection-Diffusion
in Finite Volume���������������������������������������������������������������������� 124
5.4.4 Finite Element Method (FEM)������������������������������������������������ 130
5.5 Numerical Solution of Algebraic Systems������������������������������������������ 137
5.5.1 Direct Solution Methods��������������������������������������������������������� 138
5.5.2 Iterative Methods�������������������������������������������������������������������� 141
5.5.3 Solution for a One-Dimensional Steady Diffusion Equation�� 143
5.6 Fluid-Structure Interactions (FSI)������������������������������������������������������� 146
5.6.1 FSI in Computational Haemodynamics���������������������������������� 146
5.6.2 Coupling���������������������������������������������������������������������������������� 148
5.6.3 Stability and Convergence������������������������������������������������������ 151
5.7 Summary��������������������������������������������������������������������������������������������� 152
5.8 Review Questions�������������������������������������������������������������������������������� 153

6 Generation of Computational Mesh for Haemodynamics Analysis������ 155


6.1 Introduction����������������������������������������������������������������������������������������� 155
6.1.1 Meshing Topology������������������������������������������������������������������ 156
6.2 Mesh Configurations��������������������������������������������������������������������������� 157
6.2.1 Structured Mesh���������������������������������������������������������������������� 157
6.2.2 Body-Fitted Mesh������������������������������������������������������������������� 157
6.2.3 Multi-Block Mesh������������������������������������������������������������������� 160
6.2.4 Unstructured Mesh������������������������������������������������������������������ 162
6.2.5 Delaunay Triangulation����������������������������������������������������������� 163
6.2.6 Quadtree/Octree Subdivision�������������������������������������������������� 164
6.2.7 Advancing Front Connectivity������������������������������������������������ 166
6.2.8 Comparisons Between Structured and Unstructured Mesh���� 166
6.2.9 Mesh Terminology������������������������������������������������������������������ 167
6.3 Dynamic Meshing������������������������������������������������������������������������������� 168
6.4 Mesh Generation��������������������������������������������������������������������������������� 169
6.4.1 Mesh Quality��������������������������������������������������������������������������� 169
6.4.2 Mesh Design Strategy������������������������������������������������������������� 171
xiv Contents

6.4.3 Local Refinement and Solution Adaptation���������������������������� 172


6.4.4 Mesh Independence����������������������������������������������������������������� 173
6.5 Meshing Examples������������������������������������������������������������������������������ 175
6.5.1 Flow in Blood Vessel Mesh����������������������������������������������������� 175
6.5.2 Blocking Strategies����������������������������������������������������������������� 175
6.5.3 Stenosed Artery Step-By-Step������������������������������������������������ 177
6.5.4 Left Coronary Artery Bifurcation Step-By-Step��������������������� 178
6.6 Summary��������������������������������������������������������������������������������������������� 180
6.7 Review Questions�������������������������������������������������������������������������������� 180

7 Case Studies of the Human Cardiovascular System������������������������������� 183


7.1 Introduction����������������������������������������������������������������������������������������� 183
7.2 Haemodynamics of a Stenosed Carotid Bifurcation��������������������������� 183
7.2.1 Physiologically Realistic Geometrical Reconstruction
from MRI�������������������������������������������������������������������������������� 184
7.2.2 Computational Mesh Generation�������������������������������������������� 186
7.2.3 Computational Fluid Modelling���������������������������������������������� 187
7.2.4 Experimental Validation���������������������������������������������������������� 188
7.2.5 Flow Visualisation������������������������������������������������������������������� 194
7.2.6 Comments on Modelling Issues���������������������������������������������� 198
7.2.7 Downstream peripheral vascular impedance modelling��������� 202
7.2.8 Closure������������������������������������������������������������������������������������ 206
7.3 Comparison Analysis of Patient Specific Carotid
Bifurcation Models������������������������������������������������������������������������������ 207
7.3.1 Medical Image Reconstruction of Patient-Specific Arteries��� 207
7.3.2 Comparison of Anatomical Geometries���������������������������������� 208
7.3.3 Comparison of Wall Shear Stress Computational Models������ 209
7.3.4 Comparison of Haemodynamic Properties����������������������������� 211
7.3.5 Closure������������������������������������������������������������������������������������ 213
7.4 Analysis of Stented Artery Based on Intra-Aneurysmal
Flow Simulation���������������������������������������������������������������������������������� 214
7.4.1 Configuration of Aneurysm Stenting�������������������������������������� 214
7.4.2 Modes of Aneurysmal Flow���������������������������������������������������� 215
7.4.3 Computational Modelling and Numerical Details������������������ 216
7.4.4 Aneurysmal Flow Results������������������������������������������������������� 217
7.4.5 Parametric Study for Design of Stent in Aneurysm���������������� 219
7.4.6 In-Vitro Flow Measurement of an Aneurysm, Based
on PIV������������������������������������������������������������������������������������� 220
7.4.7 Closure������������������������������������������������������������������������������������ 221
7.5 Analysis of Blood Flow in Cardiac Chamber������������������������������������� 221
7.5.1 Introduction to Heart Chamber Flow Visualisation���������������� 221
7.5.2 Application of Medical Imaging in Computational
Heart Modelling���������������������������������������������������������������������� 222
Contents xv

7.5.3 Comparison of CFD and PC-MRI Vorticity Fields����������������� 227


7.5.4 Computational Haemodynamics Analysis of Heart
Chamber���������������������������������������������������������������������������������� 227
7.5.5 Closure������������������������������������������������������������������������������������� 229
7.6 Intra-Atrial Flow and Mitral Plane Velocity Profile��������������������������� 230
7.6.1 Left Atrium Models����������������������������������������������������������������� 230
7.6.2 Computational Model Setup���������������������������������������������������� 232
7.6.3 Results������������������������������������������������������������������������������������� 233
7.6.4 Closure������������������������������������������������������������������������������������� 237
7.7 Summary��������������������������������������������������������������������������������������������� 238
7.8 Review Questions�������������������������������������������������������������������������������� 238

8 Applications of FSI for Cardiovascular Haemodynamics���������������������� 241


8.1 Introduction����������������������������������������������������������������������������������������� 241
8.2 Flow in an Idealised Stenotic Artery Bifurcation�������������������������������� 241
8.2.1 Computational Considerations������������������������������������������������ 241
8.2.2 Simulation Details������������������������������������������������������������������� 243
8.2.3 FSI Analysis of Diseased Carotid Bifurcation������������������������� 244
8.2.4 Comparison Between FSI and Non-FSI Models��������������������� 249
8.2.5 Closure������������������������������������������������������������������������������������� 251
8.3 Flow in a Realistic Carotid Artery Bifurcation����������������������������������� 251
8.3.1 Geometric Models and Material Properties����������������������������� 252
8.3.2 Haemodynamics Inside the Healthy Carotid Artery���������������� 254
8.3.3 Closure������������������������������������������������������������������������������������� 256
8.4 Flow in the Left Coronary Artery�������������������������������������������������������� 257
8.4.1 Geometric Models and Material Properties����������������������������� 257
8.4.2 Mesh Generation and Physiological Boundary Conditions����� 258
8.4.3 Mechanical Results Analysis��������������������������������������������������� 260
8.4.4 Haemodynamic Results Analysis�������������������������������������������� 263
8.4.5 Closure������������������������������������������������������������������������������������� 264
8.5 Analysis of Calcified Plaque��������������������������������������������������������������� 266
8.5.1 Calcified Plaque Models���������������������������������������������������������� 266
8.5.2 Boundary Conditions and Material Properties������������������������ 270
8.5.3 Two-Dimensional Structural Modelling���������������������������������� 274
8.5.4 Three-Dimensional Fluid-Structure Interaction Modelling����� 276
8.5.5 Correlations Between Plaque Progression and Wall
Shear Stress����������������������������������������������������������������������������� 282
8.5.6 Mechanical Stresses in 2D Carotid Plaque������������������������������ 287
8.5.7 Closure������������������������������������������������������������������������������������� 289
8.6 Flow in a Realistic Aortic Aneurysm�������������������������������������������������� 290
8.6.1 Geometric Models and Material Properties����������������������������� 291
8.6.2 Haemodynamics Inside the Abdominal Aortic Aneurysm������ 291
8.6.3 Closure������������������������������������������������������������������������������������� 295
xvi Contents

8.7 Coronary and Abdominal Arterial Bypass Grafts������������������������������� 296


8.7.1 Geometric Configurations and Computational Details����������� 297
8.7.2 Flow Patterns and Wall Deformation in Coronary
Bypass Graft���������������������������������������������������������������������������� 298
8.7.3 Flow Patterns and Wall Deformation in Abdominal
Arterial Bypass Grafts������������������������������������������������������������� 300
8.7.4 Closure������������������������������������������������������������������������������������� 301
8.8 Mitral Valve Dynamics����������������������������������������������������������������������� 304
8.8.1 Introduction����������������������������������������������������������������������������� 304
8.8.2 Asymmetric Mitral Valve Dynamics During
Diastolic Filling����������������������������������������������������������������������� 305
8.8.3 Closure������������������������������������������������������������������������������������� 308
8.9 Summary��������������������������������������������������������������������������������������������� 308

9 Advanced Topics and Future Trends�������������������������������������������������������� 311


9.1 Introduction����������������������������������������������������������������������������������������� 311
9.2 Blood Rheology���������������������������������������������������������������������������������� 311
9.2.1 Multiphase Flow���������������������������������������������������������������������� 311
9.2.2 Direct Numerical Simulations of Blood Cells������������������������� 313
9.2.3 Blood Rheology in Large Arteries Using Lattice Boltzman���� 315
9.3 Medical Imaging for Flow Validation and Analysis��������������������������� 315
9.3.1 Imaging for Flow Validation���������������������������������������������������� 315
9.3.2 Imaging for Flow Analysis������������������������������������������������������ 316
9.3.3 MRI Flow Imaging������������������������������������������������������������������ 317
9.4 Ventricular Assist Devices������������������������������������������������������������������� 319
9.5 Simulation-Based Virtual Surgery������������������������������������������������������ 321
9.6 Advanced Heart Valve Modelling������������������������������������������������������� 323
9.7 Summary��������������������������������������������������������������������������������������������� 325

Appendix����������������������������������������������������������������������������������������������������������� 327

Bibliography����������������������������������������������������������������������������������������������������� 331

Index������������������������������������������������������������������������������������������������������������������ 347
Chapter 1
Computational Haemodynamics—An
Introduction

1.1 What is Computational Haemodynamics (CHD)

Cardiac diseases remain a major cause of ill health and death in our society and thus
advancements in current clinical therapies are of significant importance. Our age-
ing population and the obesity epidemic, have increased incidences of heart disease
giving rise to a new market for therapeutic systems that are computationally based
and exclusively dedicated to the treatment of cardiovascular diseases. This coin-
cides with recent advancements in computing and flow visualisation technology,
giving greater ease for diagnosis of cardiovascular diseases (Banerjee et al. 2000).
As such, there will be an increasing demand for Computational Haemodynamic
analysis techniques to further facilitate the prognosis and diagnosis of a failing
heart. Haemodynamic parametrical studies have the potential for clinical study of
cardiac patients (Tu et al. 2011). The framework can be used to diagnose pre- and
post- surgical treatments. In particular, fluid mechanical flow quantification can
be adequately documented from simulated cardiovascular flow to aid diagnoses of
cardiovascular diseases and to assess cardiac flow analysis. These new approaches
to medical imaging provide an alternative to traditional invasive methods of diag-
noses such as surgical visualisation, and post-surgical evaluations, to characterise
cardiac abnormalities.
Computational Haemodynamics (CHD) is the computer simulation of blood flow
in the cardiovascular system. The motion of blood flow can be modelled by using
Computational Fluid Dynamics (CFD) and its interaction with blood vessel struc-
tures can be studied by combination with the use of Finite Element Method (FEM).
This is becoming an emerging research field that may lead to the everyday use of
computer modelling techniques for many biomedical engineering applications. The
biomedical engineering industry comprises the health, pharmaceutical and medical
research fields, whereby interest is increasing in the use of CHD modelling for car-
diac flow analysis, effectiveness of stents, and discovery of new phenomena related
to physiological flows.
The term “Computational” of the CFD terminology refers to the study of the “flu-
id dynamics” represented by the Navier-Stokes equations, which are solved using
© Springer Science+Business Media Dordrecht 2015 1
J. Tu et al., Computational Hemodynamics—Theory, Modelling and Applications,
Biological and Medical Physics, Biomedical Engineering,
DOI 10.1007/978-94-017-9594-4_1
2 1 Computational Haemodynamics—An Introduction

computer programs or commercial software packages. The term “hameodynamics”


encompasses both the study of biofluids and in this case, blood that is in motion (the
biofluid in dynamic mode) both in the natural arteries and in biomechanical devices.
Cardiovascular modelling using CHD is a complex and challenging process. At
the front end of the process, medical imaging and computer aided design (CAD)
are used to reconstruct the cardiovascular structure. The model geometry is then im-
ported into CFD for blood flow modelling. Due to the interactive effect of vascular
compliance and blood flow properties such as pressure and pulsatility, the CHD mod-
el also includes structural or FEM-based mechanics for fluid-structure interactions
(FSI). FSI for cardiovascular applications solves a system of governing equations of
both fluid and solid fields that is based on the mechanics of blood-vessel interaction.
Advances in CFD and FEM technologies has been aided by the rapid developments
in numerical models to reflect the true physics of flow, and the increase in computing
power to perform the immense computational work for solution generation.
Medical imaging, CAD, CFD, and FEM, coupled with some basic medical sci-
ence knowledge come together for the development of CHD simulations. Expertise
in this field requires proficiency in each of these It is expected that this field de-
mands a person who will be proficient from each of the sub-disciplines.
As demonstrated in Fig. 1.1, each sub-discipline discipline is interlinked to each
other and does not exist in isolation.

Fig. 1.1 The different disciplines contained within the CHD architecture. The state-of-the-art
research CHD architecture involving medical imaging (MI), computer aided design (CAD), com-
putational fluid dynamics (CFD), and finite element method (FEM) components for haemody-
namic modelling
1.2 Advantages of CHD 3

1.2 Advantages of CHD

CHD is an emerging field for virtual surgical planning, clinical assessment of vas-
cular diseases and the development of medical devices. The exponential growth in
computing power, advancements in technology, and materialisation of interdisci-
plinary research has seen CFD emerge within the last few decades as a practical tool
in modern engineering practice. As such, CHD benefits medical experts in provid-
ing support for their diagnosis and clinical treatment of cardiovascular diseases.
Computational modelling is also becoming a staple in research and develop-
ment (R&D) in practical engineering and product design. The computational results
complement experimental and analytical approaches by providing a cost-effective
alternative to simulate realistic fluid flows. For example, the visualisation capabili-
ties are highly detailed which can provide vector, contour, and flow streamline plots
that describe the physics. Furthermore CHD is a tool that offers the ability to solve
a range of complicated flow problems where analytical approaches do not exist.
Finally, another major advantage of CHD is the ability to simulate biofluid flows
that are not reproducible in experiments. This is significant in the medical and phar-
maceutical fields where invasive methods dealing with human subjects are difficult
to undertake. For example, evaluation of performance for medical devices such as
heart stent and heart pump. The analysis of cardiac diseases such as atherosclerosis
(Fig. 1.2), can also be simulated using CHD, which is indeed much safer and easier
to perform than experimenting on a live human subject.
Nevertheless, the suggestion here is that CHD will not replace experimental test-
ing but rather, it will serve as a viable alternative that complements experimental
methods. Newly developed models still rely on experimental data as validation for
such topics as cardiovascular flows including flow in atherosclerotic arteries and
aneurysm, heart stent and ventricular assist devices, and Low-density Lipoprotein

Fig. 1.2 Streamline visualisation in virtual stenting and simulation treatment for diseased artery,
as well as haemodynamics modeling of stenosed carotid arteries
4 1 Computational Haemodynamics—An Introduction

(LDL) transportation. By using advanced computer software packages, visualization


of numerical solutions using vectors, contours, or animated movies of unsteady
blood vessel interaction can have a significant impact on delivering solutions. Some
of the aims of this book are to introduce the reader to current research trends and to
enable the reader to understand to make the right decisions when setting up CHD
models. In particular, new users often encounter incorrect numerically produced
flow results that could be wrongly interpreted as acceptable physical phenomena.
Numerical results obtained must always be thoroughly examined before they are
accepted. Therefore, the new user needs to learn how to properly analyse and judge
the computed results.

1.3 Applications in the Cardiovascular System

1.3.1 CHD as a Research Tool

One of the many uses of CHD is to reveal the physical nature of the interactions
of fluid around and within objects. Fluid is transported through a domain by many
physical processes including dissipation, diffusion, convection, boundary layers
and turbulence. CHD can be employed as a research tool to perform numerical
experiments in order to better understand the physical nature of the fluid dynamics
of blood flow. For example it can be used to better understand blood flow within a
ventricular assist heart device. Fig. 1.3 shows a snapshot in time of the flow through
such a device which reveals the recirculating flow and high wall shear stresses
which can result in thrombosis. This example illustrates how CHD can provide
detailed visualisation to better understand the observed flow structures and some

Fig. 1.3 Three dimensional streamline flow and near-wall velocity profile. Streamline traces of
flow in a ventricular assist device depicting spiralling flow within a ventricular chamber. Swirling
is observed about the centreline of the conical housing. The speed of rotation varies non-linearly
from the housing to the centre of the vortex

You might also like